More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_0293 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_4564  hypothetical protein  74.52 
 
 		 523 aa  773    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00360175  normal  0.224392 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0302  hypothetical protein  98.68 
 
 		 534 aa  1059    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.947471  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0312  hypothetical protein  98.68 
 
 		 534 aa  1059    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.337711 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0293  hypothetical protein  100 
 
 		 529 aa  1073    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.467949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2675  hypothetical protein  48.94 
 
 		 528 aa  401  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0187257  normal  0.0233154 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2883  hypothetical protein  49.03 
 
 		 530 aa  398  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0393135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1860  hypothetical protein  40.97 
 
 		 552 aa  338  9.999999999999999e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.903101 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3721  hypothetical protein  41.81 
 
 		 587 aa  326  8.000000000000001e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3335  hypothetical protein  40.04 
 
 		 570 aa  306  5.0000000000000004e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248225 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1005  hypothetical protein  37.33 
 
 		 555 aa  293  5e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0143655 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3488  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  32.77 
 
 		 491 aa  218  2e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3339  hypothetical protein  32.93 
 
 		 488 aa  203  6e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.196154 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1518  hypothetical protein  34.09 
 
 		 498 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0214659  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3411  hypothetical protein  32.58 
 
 		 500 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0735026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3686  hypothetical protein  33.84 
 
 		 484 aa  196  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3515  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  34.16 
 
 		 492 aa  192  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.395658  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3165  hypothetical protein  32.44 
 
 		 525 aa  192  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0565388  normal  0.0860599 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1659  hypothetical protein  33.52 
 
 		 493 aa  190  5e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.224804  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2856  hypothetical protein  32.02 
 
 		 493 aa  180  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2900  hypothetical protein  32.02 
 
 		 493 aa  180  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2887  hypothetical protein  31.27 
 
 		 658 aa  179  8e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0307  hypothetical protein  29.45 
 
 		 487 aa  173  5e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.681233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0316  hypothetical protein  29.05 
 
 		 487 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.719492  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0326  hypothetical protein  29.05 
 
 		 487 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.173098 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0296  hypothetical protein  33.14 
 
 		 493 aa  170  5e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3846  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  31.1 
 
 		 486 aa  163  8.000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4545  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  29.94 
 
 		 495 aa  161  3e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11847  hypothetical protein  30.43 
 
 		 487 aa  152  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  9.81807e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0773  hypothetical protein  28.11 
 
 		 542 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000153715  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4550  hypothetical protein  29.28 
 
 		 482 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.288577 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2890  hypothetical protein  28.14 
 
 		 486 aa  130  7.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.995147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  24.76 
 
 		 464 aa  113  8.000000000000001e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2727  putative succinate dehydrogenase  28.23 
 
 		 569 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1095  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.99 
 
 		 482 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2894  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.39 
 
 		 529 aa  108  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0165292  hitchhiker  0.000448653 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  26.52 
 
 		 589 aa  107  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  25.14 
 
 		 589 aa  107  5e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  24.25 
 
 		 588 aa  105  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1037  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  30.64 
 
 		 463 aa  105  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.192722  normal  0.0849595 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0945  Succinate dehydrogenase  24.56 
 
 		 511 aa  105  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1298  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.46 
 
 		 569 aa  104  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.306259  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3788  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  26.03 
 
 		 593 aa  103  9e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2125  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  26.42 
 
 		 587 aa  103  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.401658  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1414  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.64 
 
 		 586 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0850069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3784  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  25.86 
 
 		 593 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20340  putative succinate dehydrogenase  28.52 
 
 		 581 aa  102  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.78266  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3857  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  25.86 
 
 		 593 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4243  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  25.46 
 
 		 601 aa  99.8  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30250  putative FAD-binding dehydrogenase  27.41 
 
 		 572 aa  98.6  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  23.28 
 
 		 519 aa  98.2  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3768  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  25.28 
 
 		 460 aa  96.7  9e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  25.05 
 
 		 591 aa  96.3  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2780  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  27.64 
 
 		 564 aa  95.9  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.386374  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3368  flavocytochrome c  23.98 
 
 		 519 aa  94.7  4e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0098  fumarate reductase, flavoprotein subunit  22.87 
 
 		 465 aa  93.6  7e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1792  3-oxosteroid 1-dehydrogenase  27.09 
 
 		 563 aa  93.2  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.157211  normal  0.304525 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3181  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.3 
 
 		 523 aa  92.8  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.357921  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0904  succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit  26.3 
 
 		 603 aa  93.2  1e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000602214 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3480  hypothetical protein  25.24 
 
 		 623 aa  92.8  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4075  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  27.39 
 
 		 484 aa  93.2  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1519  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  26.5 
 
 		 570 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1064  tricarballylate dehydrogenase  24.55 
 
 		 505 aa  91.7  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1003  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.95 
 
 		 522 aa  91.7  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2896  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.04 
 
 		 588 aa  91.7  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.217438  hitchhiker  0.000124211 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0943  flavocytochrome c  25.41 
 
 		 517 aa  91.7  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0511  flavocytochrome c  24.03 
 
 		 510 aa  91.3  4e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3252  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.93 
 
 		 523 aa  91.3  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.556116  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6873  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  25.08 
 
 		 569 aa  90.9  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.901911  normal  0.6243 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4671  putative 3-oxosteroid 1-dehydrogenase  26.06 
 
 		 577 aa  90.5  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4061  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  27.11 
 
 		 476 aa  90.1  8e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0124  Succinate dehydrogenase  24.95 
 
 		 497 aa  90.1  9e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  25.89 
 
 		 596 aa  88.2  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2281  flavocytochrome c  23.31 
 
 		 519 aa  88.2  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0325  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  25.3 
 
 		 550 aa  88.2  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.681292  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  25.89 
 
 		 596 aa  87.8  5e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  25.14 
 
 		 598 aa  87.4  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2701  putative FAD-binding dehydrogenase  26.04 
 
 		 599 aa  87  7e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.211864 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13570  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  26.34 
 
 		 563 aa  87  8e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000282742 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  23.64 
 
 		 598 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1029  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.76 
 
 		 509 aa  86.3  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0508  putative dehydrogenase flavoprotein  26.43 
 
 		 560 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.890159  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3126  flavocytochrome c  23.83 
 
 		 925 aa  86.7  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0795  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.84 
 
 		 509 aa  86.3  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.820864  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  25.89 
 
 		 597 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  25.53 
 
 		 596 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  25.53 
 
 		 596 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3133  tricarballylate dehydrogenase  24.86 
 
 		 524 aa  85.1  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.262589  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  23.62 
 
 		 596 aa  84.3  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3501  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.86 
 
 		 510 aa  84.3  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116635  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3358  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  26.74 
 
 		 564 aa  84  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  24 
 
 		 591 aa  83.6  0.000000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0768  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.72 
 
 		 550 aa  84  0.000000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5237  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  25.67 
 
 		 560 aa  83.6  0.000000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.466642 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3320  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  27.04 
 
 		 564 aa  83.2  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21320  fumarate reductase/succinate dehyfrogenase, flavoprotein subunit  25.26 
 
 		 514 aa  83.2  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.22533  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5045  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  26.2 
 
 		 563 aa  83.2  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5492  putative succinate dehydrogenase  25.43 
 
 		 567 aa  82  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0208  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.86 
 
 		 534 aa  82.4  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000177  normal  0.616185 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4750  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  26.03 
 
 		 563 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.309954  normal  0.275452 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2731  putative flavoprotein subunit of a reductase  23.2 
 
 		 507 aa  82  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.620849  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>