More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2084 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2084  hypothetical protein  100 
 
 
276 aa  546  1e-154  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1098  hypothetical protein  61.23 
 
 
282 aa  345  5e-94  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0294  hypothetical protein  58.3 
 
 
276 aa  301  1e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.400849  normal  0.337095 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0776  ABC-3 protein  36.09 
 
 
271 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2858  ABC-3 protein  33.08 
 
 
278 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.997835 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1444  hypothetical protein  33.33 
 
 
239 aa  139  4.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00097924  normal  0.0494808 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1149  ABC-3 protein  34.22 
 
 
273 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18330  ABC-3 protein  30.77 
 
 
277 aa  116  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000262372  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  27.07 
 
 
285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  27.09 
 
 
281 aa  110  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  27.12 
 
 
280 aa  108  9.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  28.81 
 
 
280 aa  108  1e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1547  ABC-3 protein  30.89 
 
 
279 aa  104  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1889  ABC 3 transport family protein  25.19 
 
 
266 aa  102  8e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  27.6 
 
 
288 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  27.6 
 
 
288 aa  99.4  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1017  ABC transporter, inner membrane subunit  26.94 
 
 
275 aa  99.4  6e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1111  ABC-3 protein  27.16 
 
 
268 aa  97.4  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  27.6 
 
 
288 aa  97.8  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3890  ABC-3 protein  27.94 
 
 
272 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  27.6 
 
 
288 aa  97.8  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  26.29 
 
 
300 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3940  ABC-3 protein  27.94 
 
 
272 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0593953 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0928  hypothetical protein  28.81 
 
 
267 aa  96.7  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0195697  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0996  zinc ABC transporter, permease protein  27.27 
 
 
274 aa  96.3  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.349684  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0987  ABC-3 protein  26.67 
 
 
272 aa  95.5  7e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0037  cation ABC transporter, permease protein  28.63 
 
 
269 aa  94.7  1e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2735  ABC-3 protein  27.43 
 
 
277 aa  93.6  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  26.29 
 
 
278 aa  92.8  6e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  26.29 
 
 
278 aa  92.8  6e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  25.91 
 
 
285 aa  92  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0892  ABC-3 protein  26.59 
 
 
278 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0918  ABC-3 protein  26.59 
 
 
278 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1727  cation ABC transporter, permease protein  27.73 
 
 
275 aa  91.3  2e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0129  ABC-3 protein  24.9 
 
 
269 aa  90.5  3e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.765691  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3044  ABC-3 protein  23.48 
 
 
289 aa  90.5  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612109  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  27.49 
 
 
289 aa  90.5  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1038  high-affinity zinc uptake system, membrane protein  26.96 
 
 
261 aa  90.5  3e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  24.15 
 
 
277 aa  89  8e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0402  ABC-3 protein  23.21 
 
 
273 aa  88.2  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3635  ABC-3 protein  28.51 
 
 
288 aa  88.6  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1013  ABC-3 protein  26.32 
 
 
279 aa  88.2  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4926  ABC-3 protein  24.06 
 
 
277 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.255252  normal  0.854448 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_574  cation ABC transporter, permease protein  28.19 
 
 
273 aa  87  3e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0633  cation ABC transporter, permease protein  29.58 
 
 
273 aa  85.9  7e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2063  hypothetical protein  27.9 
 
 
265 aa  85.5  9e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0131229  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1236  anchored repeat-type ABC transporter, permease subunit  24.64 
 
 
287 aa  85.5  9e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156655 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0606  ABC-3 protein  28.57 
 
 
281 aa  84.7  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2421  ABC Mn2+/Zn2+ transporter,inner membrane subunit  25.81 
 
 
276 aa  85.1  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0117  ABC-3 protein  26.32 
 
 
276 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.27708 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2633  chelated iron transport system membrane protein  26.09 
 
 
297 aa  84.7  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  0.711765 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1609  chelated iron transport system membrane protein yfeD  25.5 
 
 
285 aa  84.3  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000716854  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  22.51 
 
 
279 aa  84.7  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1812  ABC-3 protein  26.09 
 
 
297 aa  84.7  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0136745  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1702  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeD  26.09 
 
 
297 aa  84.7  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0814  ABC-3 protein  28.68 
 
 
269 aa  84.7  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0383142  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3173  iron/manganese transport system membrane protein SitD  24.7 
 
 
292 aa  83.2  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568533  normal  0.636939 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0177  cation ABC transporter, permease protein  23.63 
 
 
267 aa  83.2  0.000000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0081  iron/manganese transport system membrane protein SitD  24.7 
 
 
285 aa  82.8  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000241548 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3024  ABC-type transport system, permease component  27.24 
 
 
281 aa  82.8  0.000000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0136  cation ABC transporter, permease protein  23.63 
 
 
267 aa  82  0.00000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.032132  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2603  ABC-3 protein  28.96 
 
 
275 aa  82  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2474  ABC-3 protein  29.2 
 
 
273 aa  82  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.339421  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1710  ABC-3 protein  25.62 
 
 
273 aa  81.3  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.793327  normal  0.78687 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0280  ABC-3 protein  25.46 
 
 
278 aa  80.9  0.00000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0347715  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0153  cation ABC transporter, permease protein  23.21 
 
 
267 aa  80.9  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1676  ABC 3 transport family protein  30.26 
 
 
275 aa  80.5  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000397302  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2573  manganese transport system membrane protein MntB  24.8 
 
 
276 aa  80.1  0.00000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.449069  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0493  hypothetical protein  26.1 
 
 
272 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1114  ABC-3 protein  23.9 
 
 
279 aa  79.3  0.00000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0291  ABC transporter, permease protein  23.9 
 
 
278 aa  79.3  0.00000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0463  ABC-3 protein  23.75 
 
 
264 aa  79  0.00000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.826396  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2130  ABC-3 protein  25.94 
 
 
286 aa  79  0.00000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0882717 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2086  hypothetical protein  28.7 
 
 
277 aa  78.6  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.628213  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2137  ABC-3 protein  25.82 
 
 
277 aa  78.6  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00135344  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0518  cation ABC transporter, permease protein  26.1 
 
 
264 aa  78.2  0.0000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2984  ABC transporter, permease protein  30.43 
 
 
272 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2315  ABC-3 protein  28.98 
 
 
272 aa  77.4  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1653  ATP-binding domain-containing protein  25.99 
 
 
272 aa  77.8  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0187  ABC-3 protein  28.76 
 
 
269 aa  77.8  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0048  ABC-3 protein  25.86 
 
 
272 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3229  ABC-3 protein  26.61 
 
 
289 aa  77  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0676629  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0575  hypothetical protein  26.22 
 
 
268 aa  76.6  0.0000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1710  putative zinc ABC transporter, permease protein  25 
 
 
269 aa  76.6  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.223491  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1443  metal (zinc) transport protein (ABC transporter, permease protein) zurM  25 
 
 
269 aa  76.6  0.0000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.834179  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2192  ABC-3 protein  22.59 
 
 
271 aa  76.3  0.0000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000361955  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1789  oligoendopeptidase F  23.24 
 
 
268 aa  76.3  0.0000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0325  chelated iron ABC transporter, permease  23.87 
 
 
280 aa  76.3  0.0000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.057736  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0276  ABC-3 protein  25.42 
 
 
264 aa  76.3  0.0000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.367177  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1186  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  26.2 
 
 
265 aa  75.9  0.0000000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1835  ABC-3 protein  27.39 
 
 
277 aa  75.5  0.0000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.906803  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2131  ABC-3 protein  24.55 
 
 
286 aa  75.5  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.241388 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2208  ABC-3 protein  26.81 
 
 
285 aa  74.3  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.033424  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2382  ABC-3 protein  23.81 
 
 
280 aa  74.3  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.376168  normal  0.01145 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2844  ABC-3 protein  24.42 
 
 
281 aa  74.7  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3180  ABC-3 protein  26.53 
 
 
272 aa  74.3  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.131337  normal  0.114587 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2210  cation ABC transporter, permease protein  25.44 
 
 
273 aa  73.9  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704688  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4771  ABC-3 protein  22.46 
 
 
287 aa  73.9  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0596  ABC-3 protein  23.11 
 
 
272 aa  73.9  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1230  hypothetical protein  22.87 
 
 
301 aa  73.6  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>