More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0095 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0095  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  100 
 
 
359 aa  717    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0727  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  63.71 
 
 
361 aa  452  1.0000000000000001e-126  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.690404  normal  0.0268262 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0841  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  60.83 
 
 
361 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.174319  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0487  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  60.06 
 
 
361 aa  432  1e-120  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1946  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  60.17 
 
 
360 aa  409  1e-113  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.152977  normal  0.154356 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1562  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  44.59 
 
 
362 aa  280  4e-74  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0043  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  45.31 
 
 
360 aa  277  2e-73  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0357  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  44.59 
 
 
362 aa  276  6e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0021079 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1657  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.23 
 
 
382 aa  275  7e-73  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.231909 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4569  succinyl-CoA synthetase subunit beta  43.68 
 
 
378 aa  275  8e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0102197  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1026  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.49 
 
 
382 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.0000227763  unclonable  8.1657e-23 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0430  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  43.6 
 
 
362 aa  272  5.000000000000001e-72  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.147024  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0479  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  43.21 
 
 
362 aa  272  6e-72  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1463  succinyl-CoA synthetase subunit beta  43.12 
 
 
379 aa  269  7e-71  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1529  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.34 
 
 
382 aa  265  7e-70  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.36808  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1220  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  41.08 
 
 
377 aa  265  8.999999999999999e-70  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.23479  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2207  succinyl-CoA synthetase subunit beta  41.53 
 
 
381 aa  261  2e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.499624 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1374  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  41.65 
 
 
390 aa  258  1e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3930  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40.85 
 
 
379 aa  255  9e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0289  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  42.19 
 
 
382 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0620  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40.31 
 
 
389 aa  253  3e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000105579  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2062  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  40.21 
 
 
384 aa  253  4.0000000000000004e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2178  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  41.4 
 
 
387 aa  251  1e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.84529  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3203  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40.85 
 
 
379 aa  251  1e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5543  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  39.79 
 
 
384 aa  249  5e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.59554 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1058  succinyl-CoA synthetase subunit beta  41.89 
 
 
385 aa  248  1e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0161245  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0737  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  39.15 
 
 
385 aa  248  1e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1367  succinyl-CoA synthetase subunit beta  41.13 
 
 
378 aa  245  8e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.913427 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0729  succinyl-CoA synthetase subunit beta  41.78 
 
 
385 aa  245  9e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000827995  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0925  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40.72 
 
 
382 aa  244  9.999999999999999e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100196  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2086  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40.69 
 
 
382 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3998  succinyl-CoA synthetase subunit beta  41.51 
 
 
387 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0030268  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0319  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  38.62 
 
 
382 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2396  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  42.11 
 
 
375 aa  243  3e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000351393  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1087  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  41.05 
 
 
391 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000260623  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0957  succinyl-CoA synthetase subunit beta  39.48 
 
 
389 aa  243  3.9999999999999997e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0245  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40.16 
 
 
386 aa  243  5e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000419135 
 
 
-
 
NC_002978  WD1210  succinyl-CoA synthetase subunit beta  38.9 
 
 
383 aa  242  6e-63  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0293  Succinate--CoA ligase (ADP-forming)  41.03 
 
 
337 aa  241  1e-62  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.637875  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0260  succinyl-CoA synthetase subunit beta  39.89 
 
 
386 aa  241  1e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7116  malate--CoA ligase subunit beta  39.9 
 
 
392 aa  241  1e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00456682  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6556  malate--CoA ligase subunit beta  40.15 
 
 
392 aa  241  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.493154  normal  0.0575552 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1375  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  40.11 
 
 
384 aa  241  2e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0438  succinyl-CoA synthetase subunit beta  39.22 
 
 
381 aa  241  2e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.179512  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2717  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40.43 
 
 
387 aa  239  5e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2714  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40.27 
 
 
382 aa  238  1e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0773834 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0587  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  41.29 
 
 
387 aa  237  3e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0425  succinyl-CoA synthase, beta subunit  41.29 
 
 
387 aa  237  3e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.752721  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1988  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  40.33 
 
 
401 aa  236  3e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.953672  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1276  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  39.58 
 
 
383 aa  236  4e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.295759  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0986  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  40.6 
 
 
368 aa  236  5.0000000000000005e-61  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.00000000000000927253  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2250  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  38.28 
 
 
388 aa  236  5.0000000000000005e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.655045 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0713  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  39.84 
 
 
389 aa  236  6e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00106571  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1099  succinyl-CoA synthetase subunit beta  39.9 
 
 
386 aa  236  6e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.367484  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0979  succinyl-CoA synthetase subunit beta  41.44 
 
 
387 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1747  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  39.27 
 
 
388 aa  234  2.0000000000000002e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.655584  normal  0.0712805 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0497  succinyl-CoA synthetase subunit beta  38.87 
 
 
391 aa  233  3e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.892207 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1304  succinyl-CoA synthetase subunit beta  38.96 
 
 
388 aa  233  4.0000000000000004e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00442695  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1329  succinyl-CoA synthetase subunit beta  38.96 
 
 
388 aa  233  4.0000000000000004e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1992  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40 
 
 
386 aa  233  5e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2040  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  39.18 
 
 
386 aa  233  5e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1943  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40.58 
 
 
392 aa  233  5e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5147  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  37.24 
 
 
390 aa  232  7.000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.710728  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0813  succinyl-CoA synthetase subunit beta  39.51 
 
 
388 aa  232  8.000000000000001e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0845354  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1751  malate--CoA ligase subunit beta  39.03 
 
 
390 aa  232  9e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.635696 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2789  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  40.16 
 
 
392 aa  231  1e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.799374 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1582  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  42.58 
 
 
337 aa  231  1e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0310843  decreased coverage  0.00561469 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1799  malate--CoA ligase subunit beta  39.29 
 
 
390 aa  231  2e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.313721 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0247  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  38.89 
 
 
388 aa  231  2e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2135  malate--CoA ligase subunit beta  39.29 
 
 
390 aa  231  2e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.313278 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0623  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40.05 
 
 
392 aa  231  2e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.420642  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1740  succinyl-CoA synthase, beta subunit  39.57 
 
 
389 aa  230  3e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0062076  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0776  succinyl-CoA synthetase subunit beta  39.46 
 
 
392 aa  230  3e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0667  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40 
 
 
391 aa  229  4e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3724  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40.71 
 
 
392 aa  229  4e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.637154  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3666  malate--CoA ligase subunit beta  38.42 
 
 
392 aa  229  4e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.127325  normal  0.209823 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0607  succinyl-CoA synthetase subunit beta  37.08 
 
 
390 aa  229  4e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.409556  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0148  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40.85 
 
 
386 aa  229  5e-59  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0183836  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0251  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  39.02 
 
 
392 aa  229  5e-59  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1801  succinyl-CoA synthetase subunit beta  38.6 
 
 
389 aa  229  5e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.198712  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1464  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  39.9 
 
 
392 aa  229  8e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0597  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40.61 
 
 
390 aa  228  8e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1889  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40 
 
 
387 aa  228  9e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0967  succinyl-CoA synthase, beta subunit  39.69 
 
 
386 aa  228  1e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0808  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  41.3 
 
 
386 aa  228  1e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5927  malate--CoA ligase subunit beta  38.8 
 
 
395 aa  228  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.298211 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1694  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  42.74 
 
 
395 aa  227  3e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1557  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40.06 
 
 
390 aa  226  3e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004110  succinyl-CoA ligase [ADP-forming] beta chain  39.94 
 
 
388 aa  226  3e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3875  succinyl-CoA synthetase subunit beta  39.58 
 
 
392 aa  227  3e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2240  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40.32 
 
 
391 aa  227  3e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.014872  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2488  succinyl-CoA synthetase subunit beta  39.24 
 
 
386 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000281864  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3878  succinyl-CoA synthetase subunit beta  39.34 
 
 
386 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000279608  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3577  succinyl-CoA synthetase subunit beta  39.34 
 
 
386 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000022371  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3595  succinyl-CoA synthetase subunit beta  39.34 
 
 
386 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000384481  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3883  succinyl-CoA synthetase subunit beta  39.34 
 
 
386 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000224565  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3687  succinyl-CoA synthetase subunit beta  39.34 
 
 
386 aa  226  6e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000356944  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3974  succinyl-CoA synthetase subunit beta  39.34 
 
 
386 aa  226  6e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000205327  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0674  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40.6 
 
 
389 aa  225  7e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.508619 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01357  succinyl-CoA synthetase subunit beta  39.67 
 
 
388 aa  225  9e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>