More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1582 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_1582  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  100 
 
 
337 aa  670    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0310843  decreased coverage  0.00561469 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0293  Succinate--CoA ligase (ADP-forming)  65.38 
 
 
337 aa  442  1e-123  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.637875  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1220  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  44.05 
 
 
377 aa  251  1e-65  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.23479  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1529  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40.37 
 
 
382 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.36808  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1026  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40 
 
 
382 aa  241  1e-62  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.0000227763  unclonable  8.1657e-23 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0247  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  37.63 
 
 
388 aa  238  1e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1657  succinyl-CoA synthetase subunit beta  39.74 
 
 
382 aa  238  2e-61  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.231909 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1463  succinyl-CoA synthetase subunit beta  38.03 
 
 
379 aa  233  5e-60  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3203  succinyl-CoA synthetase subunit beta  39.28 
 
 
379 aa  231  9e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0986  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  39.34 
 
 
368 aa  231  1e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.00000000000000927253  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1946  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  41.31 
 
 
360 aa  231  1e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.152977  normal  0.154356 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0095  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  43.23 
 
 
359 aa  229  6e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3930  succinyl-CoA synthetase subunit beta  38.89 
 
 
379 aa  229  7e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4569  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40.28 
 
 
378 aa  228  9e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0102197  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0841  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  41.76 
 
 
361 aa  224  2e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.174319  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0430  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  37.53 
 
 
362 aa  221  9e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.147024  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0289  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  38.72 
 
 
382 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0713  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  39.1 
 
 
389 aa  218  7.999999999999999e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00106571  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2086  succinyl-CoA synthetase subunit beta  39.55 
 
 
382 aa  218  1e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1374  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  39.67 
 
 
390 aa  218  2e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2717  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40 
 
 
387 aa  217  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1276  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  40.11 
 
 
383 aa  217  2e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.295759  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0260  succinyl-CoA synthetase subunit beta  38.42 
 
 
386 aa  217  2e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1375  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  37.21 
 
 
384 aa  217  2.9999999999999998e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0245  succinyl-CoA synthetase subunit beta  38.42 
 
 
386 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000419135 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0587  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  38.95 
 
 
387 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2396  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  39.72 
 
 
375 aa  217  2.9999999999999998e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000351393  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0425  succinyl-CoA synthase, beta subunit  38.95 
 
 
387 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.752721  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3998  succinyl-CoA synthetase subunit beta  39.67 
 
 
387 aa  216  5e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0030268  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0487  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  40.78 
 
 
361 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2406  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  36.55 
 
 
394 aa  213  2.9999999999999995e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.502778  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0727  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  41.91 
 
 
361 aa  213  2.9999999999999995e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.690404  normal  0.0268262 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0808  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  39.89 
 
 
386 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2037  succinyl-CoA synthetase subunit beta  36.7 
 
 
387 aa  211  1e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.325125  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0043  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  39.71 
 
 
360 aa  211  1e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2117  succinyl-CoA synthetase subunit beta  36.7 
 
 
387 aa  211  2e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1058  succinyl-CoA synthetase subunit beta  39.4 
 
 
385 aa  210  3e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0161245  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0925  succinyl-CoA synthetase subunit beta  37.57 
 
 
382 aa  209  7e-53  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100196  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1562  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  37.25 
 
 
362 aa  207  1e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2178  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  38.52 
 
 
387 aa  208  1e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.84529  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1889  succinyl-CoA synthetase subunit beta  38.67 
 
 
387 aa  208  1e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1210  succinyl-CoA synthetase subunit beta  36.19 
 
 
383 aa  207  2e-52  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0544  succinyl-CoA synthetase subunit beta  38.42 
 
 
397 aa  207  2e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1452  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  36.41 
 
 
389 aa  207  3e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.567076  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0620  succinyl-CoA synthetase subunit beta  35.44 
 
 
389 aa  206  3e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000105579  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0729  succinyl-CoA synthetase subunit beta  38.69 
 
 
385 aa  207  3e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000827995  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1557  succinyl-CoA synthetase subunit beta  37.67 
 
 
390 aa  206  4e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0597  succinyl-CoA synthetase subunit beta  37.4 
 
 
390 aa  206  4e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0357  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  36.97 
 
 
362 aa  206  5e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0021079 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0530  succinyl-CoA synthetase subunit beta  39.13 
 
 
389 aa  206  6e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00340695  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1586  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  36.41 
 
 
398 aa  206  6e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.991981  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0074  succinyl-CoA synthetase subunit beta  38.5 
 
 
388 aa  205  8e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.698704  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0479  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  36.69 
 
 
362 aa  204  1e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0599  succinyl-CoA synthetase subunit beta  36.91 
 
 
387 aa  204  2e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0580  succinyl-CoA synthetase subunit beta  36.91 
 
 
387 aa  204  2e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3724  succinyl-CoA synthetase subunit beta  36.63 
 
 
392 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.637154  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3396  succinyl-CoA synthetase subunit beta  34.92 
 
 
397 aa  204  2e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1747  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  37.07 
 
 
388 aa  204  2e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.655584  normal  0.0712805 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1367  succinyl-CoA synthetase subunit beta  37.43 
 
 
378 aa  204  2e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.913427 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1644  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  36.41 
 
 
398 aa  203  3e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.47315 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1926  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  36.41 
 
 
398 aa  203  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.15774  normal  0.826279 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5543  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  37.95 
 
 
384 aa  203  4e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.59554 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3398  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  38.38 
 
 
404 aa  202  5e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.694638 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4482  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  38.38 
 
 
389 aa  202  7e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0458  succinyl-CoA synthetase subunit beta  37.17 
 
 
388 aa  202  9e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.539778  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7116  malate--CoA ligase subunit beta  35.37 
 
 
392 aa  202  9e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00456682  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0469  succinyl-CoA synthetase subunit beta  38.32 
 
 
388 aa  202  9e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6556  malate--CoA ligase subunit beta  35.64 
 
 
392 aa  202  9e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.493154  normal  0.0575552 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2491  malate--CoA ligase subunit beta  35.33 
 
 
392 aa  201  9.999999999999999e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0474  succinyl-CoA synthetase subunit beta  37.17 
 
 
388 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0554  succinyl-CoA synthetase subunit beta  38.32 
 
 
388 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0420  succinyl-CoA synthetase subunit beta  37.6 
 
 
399 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.63284  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0497  succinyl-CoA synthetase subunit beta  36.57 
 
 
391 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.892207 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2736  succinyl-CoA synthetase subunit beta  38.76 
 
 
407 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.217876  normal  0.563324 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3257  malate--CoA ligase subunit beta  36.51 
 
 
389 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1243  Succinate--CoA ligase (ADP-forming)  36.81 
 
 
393 aa  200  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.766366  hitchhiker  0.00547287 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0981  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  38.11 
 
 
405 aa  201  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.23259  normal  0.387246 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0319  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  38.42 
 
 
382 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0919  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40.27 
 
 
386 aa  200  3e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1988  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  35.41 
 
 
401 aa  199  3.9999999999999996e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.953672  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0651  succinyl-CoA synthetase subunit beta  36.61 
 
 
388 aa  199  5e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.889445  normal  0.431206 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0957  succinyl-CoA synthetase subunit beta  35.2 
 
 
389 aa  199  5e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1099  succinyl-CoA synthetase subunit beta  36.39 
 
 
386 aa  199  6e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.367484  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5147  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  36.46 
 
 
390 aa  199  6e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.710728  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1943  succinyl-CoA synthetase subunit beta  37.19 
 
 
392 aa  199  7e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0654  succinyl-CoA synthetase subunit beta  36.39 
 
 
393 aa  199  7e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.715889  normal  0.308517 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0443  succinyl-CoA synthetase subunit beta  36.31 
 
 
389 aa  199  7e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.881223 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0920  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  35.26 
 
 
398 aa  199  7e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492661  normal  0.231916 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0967  succinyl-CoA synthase, beta subunit  37.43 
 
 
386 aa  198  9e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0817  succinyl-CoA synthetase subunit beta  36.59 
 
 
388 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.357003  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0014  succinyl-CoA synthetase subunit beta  36.59 
 
 
388 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0275  succinyl-CoA synthetase subunit beta  36.59 
 
 
388 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0975  succinyl-CoA synthetase subunit beta  36.59 
 
 
388 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2062  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  37.36 
 
 
384 aa  198  1.0000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1088  succinyl-CoA synthetase subunit beta  37.5 
 
 
385 aa  198  1.0000000000000001e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.226622 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2184  succinyl-CoA synthetase subunit beta  39.23 
 
 
387 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2401  succinyl-CoA synthetase subunit beta  36.59 
 
 
388 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0813  succinyl-CoA synthetase subunit beta  36.59 
 
 
388 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2675  succinyl-CoA synthetase subunit beta  36.59 
 
 
388 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2202  succinyl-CoA synthase, beta subunit  34.28 
 
 
388 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00971799  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>