More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0293 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0293  Succinate--CoA ligase (ADP-forming)  100 
 
 
337 aa  660    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.637875  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1582  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  65.38 
 
 
337 aa  442  1e-123  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0310843  decreased coverage  0.00561469 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1026  succinyl-CoA synthetase subunit beta  43.77 
 
 
382 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.0000227763  unclonable  8.1657e-23 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1529  succinyl-CoA synthetase subunit beta  41.38 
 
 
382 aa  259  3e-68  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.36808  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1463  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.74 
 
 
379 aa  259  4e-68  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1657  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.18 
 
 
382 aa  257  3e-67  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.231909 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3203  succinyl-CoA synthetase subunit beta  41.64 
 
 
379 aa  256  5e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1562  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  45.66 
 
 
362 aa  253  3e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3930  succinyl-CoA synthetase subunit beta  41.5 
 
 
379 aa  252  8.000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0357  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  43.68 
 
 
362 aa  251  1e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0021079 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2086  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.94 
 
 
382 aa  251  1e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0479  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  45.09 
 
 
362 aa  250  2e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1220  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  42.43 
 
 
377 aa  248  9e-65  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.23479  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4569  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.7 
 
 
378 aa  245  6e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0102197  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0430  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  43.54 
 
 
362 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.147024  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0986  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  41.55 
 
 
368 aa  243  3e-63  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.00000000000000927253  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0289  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  41.34 
 
 
382 aa  242  7.999999999999999e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0607  succinyl-CoA synthetase subunit beta  38.34 
 
 
390 aa  239  2.9999999999999997e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.409556  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0095  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  41.62 
 
 
359 aa  238  8e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0247  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  37.37 
 
 
388 aa  237  3e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3396  succinyl-CoA synthetase subunit beta  38.29 
 
 
397 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4482  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  39.31 
 
 
389 aa  234  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0925  succinyl-CoA synthetase subunit beta  39.01 
 
 
382 aa  233  3e-60  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100196  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0651  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40.16 
 
 
388 aa  233  4.0000000000000004e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.889445  normal  0.431206 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0620  succinyl-CoA synthetase subunit beta  38.32 
 
 
389 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000105579  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0043  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  42.61 
 
 
360 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0497  succinyl-CoA synthetase subunit beta  36.56 
 
 
391 aa  232  6e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.892207 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1943  succinyl-CoA synthetase subunit beta  37.8 
 
 
392 aa  232  8.000000000000001e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5147  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  38.71 
 
 
390 aa  231  1e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.710728  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0425  succinyl-CoA synthase, beta subunit  37.77 
 
 
387 aa  231  1e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.752721  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1889  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40.65 
 
 
387 aa  231  1e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0587  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  37.77 
 
 
387 aa  231  1e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0713  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  38.32 
 
 
389 aa  230  2e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00106571  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3998  succinyl-CoA synthetase subunit beta  39.78 
 
 
387 aa  229  4e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0030268  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1276  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  38.76 
 
 
383 aa  229  4e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.295759  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0623  succinyl-CoA synthetase subunit beta  36.46 
 
 
392 aa  229  5e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.420642  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0667  succinyl-CoA synthetase subunit beta  37.53 
 
 
391 aa  229  6e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1992  succinyl-CoA synthetase subunit beta  39.02 
 
 
386 aa  229  6e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0776  succinyl-CoA synthetase subunit beta  37 
 
 
392 aa  229  7e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1375  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  39.02 
 
 
384 aa  228  8e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2488  succinyl-CoA synthetase subunit beta  37.5 
 
 
386 aa  228  1e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000281864  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1099  succinyl-CoA synthetase subunit beta  39.57 
 
 
386 aa  227  2e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.367484  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4693  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  38.73 
 
 
407 aa  227  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.298599  normal  0.0453308 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0490  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  37.88 
 
 
410 aa  227  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1374  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  36.68 
 
 
390 aa  226  3e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0931  succinyl-CoA synthetase subunit beta  37.63 
 
 
398 aa  226  3e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.1911  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1210  succinyl-CoA synthetase subunit beta  38.9 
 
 
383 aa  226  4e-58  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3878  succinyl-CoA synthetase subunit beta  38.71 
 
 
386 aa  226  4e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000279608  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3687  succinyl-CoA synthetase subunit beta  38.71 
 
 
386 aa  226  4e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000356944  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3577  succinyl-CoA synthetase subunit beta  38.71 
 
 
386 aa  226  4e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000022371  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3595  succinyl-CoA synthetase subunit beta  38.71 
 
 
386 aa  226  4e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000384481  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3974  succinyl-CoA synthetase subunit beta  38.71 
 
 
386 aa  226  4e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000205327  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2037  succinyl-CoA synthetase subunit beta  39.3 
 
 
387 aa  226  4e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.325125  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3883  succinyl-CoA synthetase subunit beta  38.71 
 
 
386 aa  226  4e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000224565  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2717  succinyl-CoA synthetase subunit beta  39.24 
 
 
387 aa  226  4e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0023  succinyl-CoA synthetase subunit beta  38.38 
 
 
398 aa  226  4e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0487  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  40.33 
 
 
361 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2117  succinyl-CoA synthetase subunit beta  39.3 
 
 
387 aa  226  6e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4221  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  38.87 
 
 
396 aa  225  8e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.687915  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0981  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  40.15 
 
 
405 aa  225  9e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.23259  normal  0.387246 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1309  succinyl-CoA synthetase subunit beta  37.5 
 
 
386 aa  225  9e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000115042  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_004310  BR1926  succinyl-CoA synthetase subunit beta  37.63 
 
 
398 aa  224  1e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3934  succinyl-CoA synthetase subunit beta  38.44 
 
 
386 aa  224  1e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000073061  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7116  malate--CoA ligase subunit beta  36.86 
 
 
392 aa  224  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00456682  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1855  succinyl-CoA synthetase subunit beta  37.63 
 
 
398 aa  224  1e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.965079  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2736  succinyl-CoA synthetase subunit beta  37.72 
 
 
407 aa  224  1e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.217876  normal  0.563324 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2500  succinyl-CoA synthetase subunit beta  39.08 
 
 
388 aa  224  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.680576  normal  0.0920336 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1243  Succinate--CoA ligase (ADP-forming)  38.73 
 
 
393 aa  224  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.766366  hitchhiker  0.00547287 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1452  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  38.48 
 
 
389 aa  224  2e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.567076  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2396  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  39.23 
 
 
375 aa  223  2e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000351393  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2577  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40.71 
 
 
410 aa  224  2e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1367  succinyl-CoA synthetase subunit beta  38.89 
 
 
378 aa  224  2e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.913427 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2178  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  40 
 
 
387 aa  224  2e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.84529  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0808  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  40.22 
 
 
386 aa  224  2e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1329  succinyl-CoA synthetase subunit beta  38.54 
 
 
388 aa  224  2e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1304  succinyl-CoA synthetase subunit beta  38.54 
 
 
388 aa  224  2e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00442695  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0074  succinyl-CoA synthetase subunit beta  39.46 
 
 
388 aa  223  3e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.698704  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0260  succinyl-CoA synthetase subunit beta  37.87 
 
 
386 aa  223  3e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1586  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  37.19 
 
 
398 aa  223  4e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.991981  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2943  succinyl-CoA synthetase subunit beta  37.37 
 
 
398 aa  223  4e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.349199  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3659  succinyl-CoA synthetase subunit beta  38.44 
 
 
386 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000717596  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0245  succinyl-CoA synthetase subunit beta  37.87 
 
 
386 aa  222  7e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000419135 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3605  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  36.94 
 
 
410 aa  222  8e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.194047  normal  0.127689 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1996  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  37.5 
 
 
398 aa  222  8e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0597  succinyl-CoA synthetase subunit beta  37.13 
 
 
390 aa  221  9e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0469  succinyl-CoA synthetase subunit beta  38.87 
 
 
388 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1801  succinyl-CoA synthetase subunit beta  38.99 
 
 
389 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.198712  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1557  succinyl-CoA synthetase subunit beta  37.4 
 
 
390 aa  221  9.999999999999999e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1926  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  37.19 
 
 
398 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.15774  normal  0.826279 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0474  succinyl-CoA synthetase subunit beta  38.04 
 
 
388 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6556  malate--CoA ligase subunit beta  36.59 
 
 
392 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.493154  normal  0.0575552 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0458  succinyl-CoA synthetase subunit beta  38.04 
 
 
388 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.539778  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1644  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  37.19 
 
 
398 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.47315 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1713  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  37.14 
 
 
393 aa  220  1.9999999999999999e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000861995  hitchhiker  0.0000000000000037897 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2406  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  37.17 
 
 
394 aa  220  3e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.502778  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2491  malate--CoA ligase subunit beta  36.68 
 
 
392 aa  220  3e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1617  succinyl-CoA synthetase subunit beta  38.81 
 
 
388 aa  220  3e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.133966  normal  0.227908 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0544  succinyl-CoA synthetase subunit beta  37.25 
 
 
397 aa  220  3e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0530  succinyl-CoA synthetase subunit beta  39.19 
 
 
389 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00340695  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1703  succinyl-CoA synthetase subunit beta  38.38 
 
 
388 aa  219  5e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.213189  normal  0.378528 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>