More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1996 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1996  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  100 
 
 
398 aa  807    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0674  succinyl-CoA synthetase subunit beta  65.03 
 
 
389 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.508619 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4482  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  66.75 
 
 
389 aa  512  1e-144  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3292  succinyl-CoA synthetase subunit beta  65.43 
 
 
389 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.251012  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0443  succinyl-CoA synthetase subunit beta  66.49 
 
 
389 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.881223 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0458  succinyl-CoA synthetase subunit beta  66.58 
 
 
388 aa  505  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.539778  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0014  succinyl-CoA synthetase subunit beta  65.16 
 
 
388 aa  501  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0554  succinyl-CoA synthetase subunit beta  66.76 
 
 
388 aa  501  1e-141  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0275  succinyl-CoA synthetase subunit beta  65.16 
 
 
388 aa  501  1e-141  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0474  succinyl-CoA synthetase subunit beta  66.58 
 
 
388 aa  504  1e-141  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0813  succinyl-CoA synthetase subunit beta  65.16 
 
 
388 aa  501  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0975  succinyl-CoA synthetase subunit beta  65.16 
 
 
388 aa  501  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0646  succinyl-CoA synthetase subunit beta  65.69 
 
 
388 aa  503  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.017874  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0817  succinyl-CoA synthetase subunit beta  65.16 
 
 
388 aa  501  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.357003  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0469  succinyl-CoA synthetase subunit beta  66.76 
 
 
388 aa  502  1e-141  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2675  succinyl-CoA synthetase subunit beta  65.16 
 
 
388 aa  501  1e-141  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2401  succinyl-CoA synthetase subunit beta  65.16 
 
 
388 aa  501  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0530  succinyl-CoA synthetase subunit beta  65.96 
 
 
389 aa  499  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00340695  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0653  succinyl-CoA synthetase subunit beta  65.43 
 
 
388 aa  500  1e-140  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2570  succinyl-CoA synthetase subunit beta  64.63 
 
 
388 aa  498  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2696  succinyl-CoA synthetase subunit beta  64.63 
 
 
388 aa  498  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0495  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  65.89 
 
 
386 aa  495  1e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000993882 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2678  succinyl-CoA synthetase subunit beta  64.63 
 
 
388 aa  497  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.406945  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2699  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  65.89 
 
 
386 aa  495  1e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0793427 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1992  succinyl-CoA synthetase subunit beta  62.04 
 
 
386 aa  495  1e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5976  succinyl-CoA synthetase subunit beta  64.63 
 
 
388 aa  496  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0679423 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0919  succinyl-CoA synthetase subunit beta  65.36 
 
 
386 aa  495  1e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2038  succinyl-CoA synthetase subunit beta  64.63 
 
 
388 aa  497  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2649  succinyl-CoA synthetase subunit beta  64.63 
 
 
388 aa  497  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1831  succinyl-CoA synthetase subunit beta  65.78 
 
 
389 aa  492  9.999999999999999e-139  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.410462  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1452  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  60.05 
 
 
389 aa  494  9.999999999999999e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.567076  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1099  succinyl-CoA synthetase subunit beta  61.78 
 
 
386 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.367484  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1547  succinyl-CoA synthetase subunit beta  65.43 
 
 
389 aa  491  9.999999999999999e-139  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00163339  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1375  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  63.35 
 
 
384 aa  494  9.999999999999999e-139  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3878  succinyl-CoA synthetase subunit beta  61.62 
 
 
386 aa  490  1e-137  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000279608  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3687  succinyl-CoA synthetase subunit beta  61.36 
 
 
386 aa  488  1e-137  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000356944  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3577  succinyl-CoA synthetase subunit beta  61.62 
 
 
386 aa  490  1e-137  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000022371  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3595  succinyl-CoA synthetase subunit beta  61.62 
 
 
386 aa  490  1e-137  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000384481  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3974  succinyl-CoA synthetase subunit beta  61.36 
 
 
386 aa  488  1e-137  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000205327  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3945  succinyl-CoA synthetase subunit beta  65.51 
 
 
388 aa  490  1e-137  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.385374  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1309  succinyl-CoA synthetase subunit beta  61.62 
 
 
386 aa  490  1e-137  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000115042  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3883  succinyl-CoA synthetase subunit beta  61.62 
 
 
386 aa  490  1e-137  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000224565  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3934  succinyl-CoA synthetase subunit beta  61.62 
 
 
386 aa  491  1e-137  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000073061  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3392  succinyl-CoA synthetase subunit beta  64.32 
 
 
386 aa  485  1e-136  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2488  succinyl-CoA synthetase subunit beta  61.36 
 
 
386 aa  486  1e-136  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000281864  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4047  succinyl-CoA synthetase subunit beta  64.32 
 
 
386 aa  485  1e-136  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0869  succinyl-CoA synthetase subunit beta  64.32 
 
 
386 aa  484  1e-135  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4682  succinyl-CoA synthetase subunit beta  63.54 
 
 
386 aa  483  1e-135  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21216  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5192  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  63.66 
 
 
388 aa  479  1e-134  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3659  succinyl-CoA synthetase subunit beta  60.31 
 
 
386 aa  481  1e-134  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000717596  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0155  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  62.11 
 
 
388 aa  476  1e-133  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573103  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4684  succinyl-CoA synthetase subunit beta  63.54 
 
 
386 aa  477  1e-133  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3486  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  62.11 
 
 
388 aa  476  1e-133  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.333849  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0813  succinyl-CoA synthetase subunit beta  59.79 
 
 
388 aa  471  1e-132  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0845354  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3953  succinyl-CoA synthetase subunit beta  63.28 
 
 
386 aa  473  1e-132  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.142844 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3364  succinyl-CoA synthetase subunit beta  62.24 
 
 
386 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0072  succinyl-CoA synthetase subunit beta  65.51 
 
 
386 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.442706 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2261  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  61.4 
 
 
386 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.139479  hitchhiker  0.0000000854981 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1040  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  61.08 
 
 
389 aa  464  9.999999999999999e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.401967 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1747  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  59.11 
 
 
388 aa  468  9.999999999999999e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.655584  normal  0.0712805 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3223  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  60.98 
 
 
389 aa  461  1e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.835206  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4359  succinyl-CoA synthetase subunit beta  58.88 
 
 
403 aa  464  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.129325 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2789  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  60.72 
 
 
392 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.799374 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1464  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  60.72 
 
 
392 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2069  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  60.47 
 
 
387 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000114412  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1211  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  56.39 
 
 
399 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.773586  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0920  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  57.79 
 
 
398 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492661  normal  0.231916 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1329  succinyl-CoA synthetase subunit beta  58.25 
 
 
388 aa  460  9.999999999999999e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1304  succinyl-CoA synthetase subunit beta  58.25 
 
 
388 aa  460  9.999999999999999e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00442695  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2730  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  60.88 
 
 
388 aa  454  1.0000000000000001e-126  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.150685 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0280  succinyl-CoA synthetase subunit beta  56.03 
 
 
398 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0625888 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4349  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  59.95 
 
 
387 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.741807  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1210  succinyl-CoA synthetase subunit beta  55.76 
 
 
383 aa  448  1e-125  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0193  succinyl-CoA synthetase subunit beta  56.03 
 
 
399 aa  450  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0176  succinyl-CoA synthetase subunit beta  56.61 
 
 
426 aa  451  1e-125  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135845  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0559  succinyl-CoA synthetase subunit beta  56.09 
 
 
397 aa  451  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.335681 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0490  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  57.36 
 
 
410 aa  449  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1926  succinyl-CoA synthetase subunit beta  56.85 
 
 
398 aa  447  1.0000000000000001e-124  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4127  succinyl-CoA synthetase subunit beta  58.29 
 
 
398 aa  444  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0931  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.11 
 
 
398 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.1911  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0536  succinyl-CoA synthetase subunit beta  56.85 
 
 
399 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1855  succinyl-CoA synthetase subunit beta  56.85 
 
 
398 aa  447  1.0000000000000001e-124  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.965079  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0154  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  56.35 
 
 
400 aa  445  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306338  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0393  succinyl-CoA synthetase subunit beta  55.33 
 
 
398 aa  443  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.268228  normal  0.21905 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0229  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.54 
 
 
399 aa  444  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.370858 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1627  succinyl-CoA synthetase subunit beta  59.54 
 
 
388 aa  443  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3170  succinyl-CoA synthetase subunit beta  56.38 
 
 
399 aa  444  1e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0186  succinyl-CoA synthetase subunit beta  56.28 
 
 
398 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.984943  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4693  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  57.25 
 
 
407 aa  442  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.298599  normal  0.0453308 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1625  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  55.42 
 
 
398 aa  443  1e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.357974  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1586  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  56.6 
 
 
398 aa  442  1e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.991981  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2233  succinyl-CoA synthetase subunit beta  59.28 
 
 
388 aa  441  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.159588  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0079  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.57 
 
 
397 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2321  succinyl-CoA synthetase subunit beta  59.28 
 
 
388 aa  441  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0456316  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0023  succinyl-CoA synthetase subunit beta  55.28 
 
 
398 aa  439  9.999999999999999e-123  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0544  succinyl-CoA synthetase subunit beta  56.6 
 
 
397 aa  441  9.999999999999999e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1644  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  56.6 
 
 
398 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.47315 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2162  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  56.09 
 
 
398 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23107  normal  0.201717 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1926  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  56.6 
 
 
398 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.15774  normal  0.826279 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3605  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  54.64 
 
 
410 aa  436  1e-121  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.194047  normal  0.127689 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>