More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5147 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5147  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  100 
 
 
390 aa  793    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.710728  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2488  succinyl-CoA synthetase subunit beta  67.36 
 
 
386 aa  525  1e-148  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000281864  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3878  succinyl-CoA synthetase subunit beta  66.84 
 
 
386 aa  521  1e-147  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000279608  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3577  succinyl-CoA synthetase subunit beta  66.84 
 
 
386 aa  521  1e-147  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000022371  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3595  succinyl-CoA synthetase subunit beta  66.84 
 
 
386 aa  521  1e-147  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000384481  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3883  succinyl-CoA synthetase subunit beta  66.84 
 
 
386 aa  521  1e-147  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000224565  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3687  succinyl-CoA synthetase subunit beta  66.58 
 
 
386 aa  519  1e-146  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000356944  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3934  succinyl-CoA synthetase subunit beta  66.58 
 
 
386 aa  519  1e-146  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000073061  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3974  succinyl-CoA synthetase subunit beta  66.58 
 
 
386 aa  519  1e-146  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000205327  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1099  succinyl-CoA synthetase subunit beta  65.37 
 
 
386 aa  519  1e-146  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.367484  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1309  succinyl-CoA synthetase subunit beta  66.58 
 
 
386 aa  518  1e-146  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000115042  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3659  succinyl-CoA synthetase subunit beta  66.58 
 
 
386 aa  518  1e-146  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000717596  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1992  succinyl-CoA synthetase subunit beta  64.34 
 
 
386 aa  512  1e-144  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0813  succinyl-CoA synthetase subunit beta  63.08 
 
 
388 aa  497  1e-139  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0845354  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1452  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  62.05 
 
 
389 aa  488  1e-136  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.567076  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1304  succinyl-CoA synthetase subunit beta  61.03 
 
 
388 aa  484  1e-136  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00442695  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1329  succinyl-CoA synthetase subunit beta  61.03 
 
 
388 aa  484  1e-136  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1375  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  61.92 
 
 
384 aa  477  1e-133  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1747  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  60.36 
 
 
388 aa  475  1e-133  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.655584  normal  0.0712805 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0497  succinyl-CoA synthetase subunit beta  58.07 
 
 
391 aa  473  1e-132  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.892207 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1943  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.55 
 
 
392 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0338  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.36 
 
 
390 aa  468  9.999999999999999e-131  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.210616  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0623  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.11 
 
 
392 aa  465  9.999999999999999e-131  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.420642  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4359  succinyl-CoA synthetase subunit beta  59.85 
 
 
403 aa  462  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.129325 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0776  succinyl-CoA synthetase subunit beta  56.07 
 
 
392 aa  462  1e-129  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0607  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.36 
 
 
390 aa  463  1e-129  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.409556  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1625  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  59.9 
 
 
398 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.357974  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1211  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  58 
 
 
399 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.773586  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0674  succinyl-CoA synthetase subunit beta  61.44 
 
 
389 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.508619 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0667  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.88 
 
 
391 aa  457  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3170  succinyl-CoA synthetase subunit beta  58.25 
 
 
399 aa  452  1.0000000000000001e-126  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0821  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.5 
 
 
397 aa  451  1e-125  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.97511 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3292  succinyl-CoA synthetase subunit beta  61.64 
 
 
389 aa  449  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.251012  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0155  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  61.5 
 
 
388 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573103  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2261  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  59.69 
 
 
386 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.139479  hitchhiker  0.0000000854981 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3486  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  61.5 
 
 
388 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.333849  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0559  succinyl-CoA synthetase subunit beta  56.5 
 
 
397 aa  446  1.0000000000000001e-124  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.335681 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0817  succinyl-CoA synthetase subunit beta  60.53 
 
 
388 aa  444  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.357003  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0813  succinyl-CoA synthetase subunit beta  60.53 
 
 
388 aa  444  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0275  succinyl-CoA synthetase subunit beta  60.53 
 
 
388 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0975  succinyl-CoA synthetase subunit beta  60.53 
 
 
388 aa  444  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1464  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  59.84 
 
 
392 aa  443  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0967  succinyl-CoA synthetase subunit beta  56 
 
 
397 aa  443  1e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2401  succinyl-CoA synthetase subunit beta  60.53 
 
 
388 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2069  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  59.43 
 
 
387 aa  442  1e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000114412  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0931  succinyl-CoA synthetase subunit beta  58.25 
 
 
398 aa  443  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.1911  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0597  succinyl-CoA synthetase subunit beta  55.78 
 
 
390 aa  442  1e-123  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0229  succinyl-CoA synthetase subunit beta  58.75 
 
 
399 aa  442  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.370858 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2789  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  59.84 
 
 
392 aa  442  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.799374 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1627  succinyl-CoA synthetase subunit beta  59.85 
 
 
388 aa  442  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2675  succinyl-CoA synthetase subunit beta  60.53 
 
 
388 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1557  succinyl-CoA synthetase subunit beta  56.3 
 
 
390 aa  442  1e-123  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4682  succinyl-CoA synthetase subunit beta  60 
 
 
386 aa  443  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21216  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0014  succinyl-CoA synthetase subunit beta  60.53 
 
 
388 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3514  succinyl-CoA synthetase subunit beta  56.25 
 
 
397 aa  442  1e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.764048  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3396  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.75 
 
 
397 aa  442  1e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0079  succinyl-CoA synthetase subunit beta  56 
 
 
397 aa  443  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2627  succinyl-CoA synthetase subunit beta  56 
 
 
397 aa  443  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.426035  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3223  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  58.91 
 
 
389 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.835206  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2878  succinyl-CoA synthetase subunit beta  56.75 
 
 
397 aa  441  9.999999999999999e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1210  succinyl-CoA synthetase subunit beta  55.38 
 
 
383 aa  439  9.999999999999999e-123  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1926  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.75 
 
 
398 aa  439  9.999999999999999e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2233  succinyl-CoA synthetase subunit beta  59.59 
 
 
388 aa  440  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.159588  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0919  succinyl-CoA synthetase subunit beta  58.97 
 
 
386 aa  439  9.999999999999999e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0443  succinyl-CoA synthetase subunit beta  60.32 
 
 
389 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.881223 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1855  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.75 
 
 
398 aa  439  9.999999999999999e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.965079  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5976  succinyl-CoA synthetase subunit beta  60.05 
 
 
388 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0679423 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0646  succinyl-CoA synthetase subunit beta  60.32 
 
 
388 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.017874  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0620  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.76 
 
 
389 aa  438  9.999999999999999e-123  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000105579  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4233  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  56.09 
 
 
393 aa  441  9.999999999999999e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.510138  normal  0.149486 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2321  succinyl-CoA synthetase subunit beta  59.59 
 
 
388 aa  440  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0456316  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1703  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.8 
 
 
388 aa  440  9.999999999999999e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.213189  normal  0.378528 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1087  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  54.73 
 
 
391 aa  440  9.999999999999999e-123  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000260623  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1040  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  58.91 
 
 
389 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.401967 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0474  succinyl-CoA synthetase subunit beta  60.85 
 
 
388 aa  437  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0490  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  57.32 
 
 
410 aa  436  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2678  succinyl-CoA synthetase subunit beta  60.05 
 
 
388 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.406945  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3364  succinyl-CoA synthetase subunit beta  59.74 
 
 
386 aa  436  1e-121  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2406  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  56.6 
 
 
394 aa  437  1e-121  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.502778  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2570  succinyl-CoA synthetase subunit beta  60.05 
 
 
388 aa  437  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0653  succinyl-CoA synthetase subunit beta  60 
 
 
388 aa  437  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0458  succinyl-CoA synthetase subunit beta  60.58 
 
 
388 aa  436  1e-121  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.539778  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2038  succinyl-CoA synthetase subunit beta  60.05 
 
 
388 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3605  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  55.56 
 
 
410 aa  436  1e-121  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.194047  normal  0.127689 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2696  succinyl-CoA synthetase subunit beta  60.05 
 
 
388 aa  437  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3953  succinyl-CoA synthetase subunit beta  59.49 
 
 
386 aa  435  1e-121  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.142844 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2649  succinyl-CoA synthetase subunit beta  60.05 
 
 
388 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4693  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  57.71 
 
 
407 aa  431  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.298599  normal  0.0453308 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0554  succinyl-CoA synthetase subunit beta  59.79 
 
 
388 aa  432  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0920  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  56.25 
 
 
398 aa  432  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492661  normal  0.231916 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2699  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  59.49 
 
 
386 aa  434  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0793427 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0495  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  59.49 
 
 
386 aa  434  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000993882 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1694  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  56.01 
 
 
395 aa  434  1e-120  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0023  succinyl-CoA synthetase subunit beta  56.75 
 
 
398 aa  433  1e-120  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3392  succinyl-CoA synthetase subunit beta  58.46 
 
 
386 aa  431  1e-120  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2184  succinyl-CoA synthetase subunit beta  59.84 
 
 
387 aa  433  1e-120  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4349  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  59.43 
 
 
387 aa  433  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.741807  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4047  succinyl-CoA synthetase subunit beta  58.46 
 
 
386 aa  431  1e-120  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0251  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  53.23 
 
 
392 aa  428  1e-119  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3945  succinyl-CoA synthetase subunit beta  58.73 
 
 
388 aa  430  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.385374  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>