More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4983 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_4983  acetyl-CoA synthetase  100 
 
 		 280 aa  567  1e-160  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.793805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1407  acetyl-CoA synthetase  70.48 
 
 		 598 aa  306  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959258 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4644  acetyl-CoA synthetase  50.22 
 
 		 588 aa  205  7e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.291537  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3568  acetyl-CoA synthetase  50.22 
 
 		 588 aa  205  7e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0207513  normal  0.0354675 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1412  acetyl-CoA synthetase  54.04 
 
 		 587 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0927  acetyl-CoA synthetase  49.78 
 
 		 588 aa  192  4e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0761  acetyl-CoA synthetase  47.58 
 
 		 592 aa  192  7e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000550868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0511  acetyl-CoA synthetase  49.77 
 
 		 607 aa  189  4e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3465  AMP-dependent synthetase and ligase  51.6 
 
 		 598 aa  174  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.271153  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0388  acetyl-CoA synthetase  48 
 
 		 602 aa  171  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1608  acetyl-CoA synthetase  48.04 
 
 		 584 aa  160  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.281409  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2708  acetyl-CoA synthetase  46.31 
 
 		 576 aa  154  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.180648  hitchhiker  0.00000972511 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3600  acetyl-CoA synthetase  46.47 
 
 		 584 aa  154  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7028  acetyl-CoA synthetase  45.16 
 
 		 585 aa  153  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.277819 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2174  acetyl-CoA synthetase  43.01 
 
 		 588 aa  151  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.181143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2597  acetyl-CoA synthetase  40.45 
 
 		 588 aa  135  9.999999999999999e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0867997  hitchhiker  0.000215379 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2650  AMP-dependent synthetase and ligase  39.47 
 
 		 553 aa  120  3.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.396776 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1788  acetyl-CoA synthetase  34.74 
 
 		 568 aa  116  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.373968  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1823  acetyl-CoA synthetase  34.74 
 
 		 568 aa  116  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000207861  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0180  AMP-dependent synthetase and ligase  36.1 
 
 		 553 aa  109  5e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0011  AMP-dependent synthetase and ligase  36.05 
 
 		 560 aa  104  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1854  AMP-dependent synthetase and ligase  36.65 
 
 		 567 aa  103  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6789  Acetyl-coenzyme A synthetase  37.14 
 
 		 535 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00873195  normal  0.0465133 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1411  phosphopantetheine-binding protein  84.48 
 
 		 84 aa  99  9e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2729  acetyl-CoA synthetase  33.71 
 
 		 571 aa  97.8  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0711  acetyl-CoA synthetase  35.03 
 
 		 571 aa  97.1  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4411  acetyl-CoA synthetase  32.8 
 
 		 572 aa  95.9  7e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3335  acetyl-CoA synthetase  32.28 
 
 		 572 aa  95.9  7e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4493  acetyl-CoA synthetase  32.8 
 
 		 572 aa  94.4  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4394  acetyl-CoA synthetase  32.28 
 
 		 572 aa  94.4  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4775  acetyl-CoA synthetase  32.28 
 
 		 572 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4797  acetyl-CoA synthetase  32.28 
 
 		 572 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0464  acetyl-CoA synthetase  32.28 
 
 		 572 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000164986 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4801  acetyl-CoA synthetase  32.28 
 
 		 572 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4780  acetyl-CoA synthetase  32.28 
 
 		 572 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4560  acetyl-CoA synthetase  32.28 
 
 		 572 aa  92.8  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4915  acetyl-CoA synthetase  32.28 
 
 		 572 aa  92.8  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1850  AMP-dependent synthetase and ligase  34.86 
 
 		 557 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0104238  hitchhiker  0.00000000609851 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2705  AMP-dependent synthetase and ligase  35.75 
 
 		 552 aa  91.3  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000941409  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0477  acetyl-coenzyme A synthetase  30.7 
 
 		 661 aa  87  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0757  AMP-dependent synthetase and ligase  33.84 
 
 		 552 aa  86.3  5e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3527  AMP-dependent synthetase and ligase  32.23 
 
 		 535 aa  85.9  7e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.305269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3984  AMP-dependent synthetase and ligase  31.46 
 
 		 535 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1195  acetate--CoA ligase  36.8 
 
 		 670 aa  84.3  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.671297  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0420  AMP-dependent synthetase and ligase  35.77 
 
 		 629 aa  84.3  0.000000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0761365 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0250  AMP-dependent synthetase and ligase  35.77 
 
 		 629 aa  84.3  0.000000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2340  AMP-dependent synthetase and ligase  34.92 
 
 		 539 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1527  AMP-dependent synthetase and ligase  41.18 
 
 		 633 aa  83.2  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.369396  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1386  AMP-dependent synthetase and ligase  30.81 
 
 		 626 aa  81.3  0.00000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.911526 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1797  AMP-dependent synthetase and ligase  28.19 
 
 		 641 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1389  acetate--CoA ligase  29.08 
 
 		 632 aa  81.3  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3525  AMP-dependent synthetase and ligase  39.86 
 
 		 549 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.244199 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2230  acetate/CoA ligase  33.53 
 
 		 680 aa  80.1  0.00000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.83854 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1395  putative acetyl-CoA synthetase  32.06 
 
 		 556 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.527272 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2213  AMP-dependent synthetase and ligase  38.51 
 
 		 561 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.548227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31500  putative AMP-binding protein  35.29 
 
 		 555 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.555085  hitchhiker  0.0000351198 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01080  acetyl-coenzyme A synthetase  30.14 
 
 		 650 aa  79.3  0.00000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2681  putative AMP-binding protein  35.29 
 
 		 555 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3458  AMP-dependent synthetase and ligase  34.76 
 
 		 547 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0975472  normal  0.641138 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1969  acetyl-CoA synthetase  30.57 
 
 		 655 aa  78.2  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1637  acetate/CoA ligase  30.57 
 
 		 655 aa  78.2  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000196907 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1839  AMP-dependent synthetase and ligase  33.51 
 
 		 548 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331932  normal  0.165167 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2810  acetate/CoA ligase  35.12 
 
 		 674 aa  78.6  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.036584 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2788  AMP-dependent synthetase and ligase  29.49 
 
 		 608 aa  77.8  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.374642  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1068  acetate--CoA ligase  29.65 
 
 		 673 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2132  acetate/CoA ligase  29.86 
 
 		 661 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000882017  normal  0.24992 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1194  acetate--CoA ligase  36 
 
 		 659 aa  77.8  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384391  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1478  acetate/CoA ligase  31 
 
 		 657 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148557  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2727  AMP-dependent synthetase and ligase  32.06 
 
 		 553 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0976  acetate/CoA ligase  27.35 
 
 		 659 aa  76.6  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1575  AMP-dependent synthetase and ligase  31.1 
 
 		 627 aa  76.6  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.134471 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1587  acetate/CoA ligase  29.29 
 
 		 632 aa  76.3  0.0000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.900608  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1427  AMP-dependent synthetase and ligase  32.94 
 
 		 663 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0770781  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3663  acetyl-coenzyme A synthetase  28.26 
 
 		 667 aa  76.3  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1094  phosphopantetheine-binding protein  65.38 
 
 		 86 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1122  phosphopantetheine-binding protein  65.38 
 
 		 86 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4939  AMP-dependent synthetase and ligase  29.51 
 
 		 555 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1111  phosphopantetheine-binding protein  65.38 
 
 		 86 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1209  acetyl-CoA synthetase  30.06 
 
 		 652 aa  76.3  0.0000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5345  AMP-dependent synthetase and ligase  34.68 
 
 		 555 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.526567  normal  0.149632 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2856  acetyl-CoA synthetase  34.04 
 
 		 656 aa  75.9  0.0000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2671  AMP-dependent synthetase and ligase  35.33 
 
 		 624 aa  75.9  0.0000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1527  AMP-dependent synthetase and ligase  38.66 
 
 		 636 aa  76.3  0.0000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000383021 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33450  acetyl-coenzyme A synthetase  36.13 
 
 		 662 aa  75.9  0.0000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5971  AMP-dependent synthetase and ligase  34.69 
 
 		 557 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.137563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5727  AMP-dependent synthetase and ligase  34.69 
 
 		 557 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0383  propionyl-CoA synthetase  27.55 
 
 		 626 aa  75.9  0.0000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2545  AMP-dependent synthetase and ligase  35.53 
 
 		 563 aa  75.5  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2769  putative acetyl-CoA synthetase and ligase  30.88 
 
 		 650 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.914995  normal  0.208075 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0450  acetyl-CoA synthetase, putative  34.44 
 
 		 556 aa  74.7  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.348474  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4371  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 553 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4507  acetate/CoA ligase  32.69 
 
 		 663 aa  74.7  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.424676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1019  acetyl-coenzyme A synthetase  29.45 
 
 		 652 aa  74.7  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3103  AMP-dependent synthetase and ligase  34.87 
 
 		 562 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0304891 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3167  acetate/CoA ligase  27.27 
 
 		 658 aa  74.7  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.678414  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32550  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  35.33 
 
 		 644 aa  74.7  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.113888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1140  acetate/CoA ligase  30.22 
 
 		 665 aa  74.3  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.224002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4043  acetyl-CoA synthetase  31.12 
 
 		 715 aa  74.3  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4434  acetyl-CoA synthetase  30.98 
 
 		 661 aa  73.9  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000112496 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2909  AMP-dependent synthetase and ligase  35.33 
 
 		 563 aa  74.3  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.522952  normal  0.436285 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>