More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3162 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3162  regulatory protein, ArsR  100 
 
 
97 aa  201  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5643  ArsR family transcriptional regulator  79.59 
 
 
102 aa  161  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5264  ArsR family transcriptional regulator  78.57 
 
 
104 aa  160  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5353  ArsR family transcriptional regulator  78.57 
 
 
102 aa  160  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3372  regulatory protein, ArsR  77.42 
 
 
106 aa  155  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.110528 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1841  transcriptional regulator, ArsR family  70.53 
 
 
103 aa  141  4e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0064194  normal  0.0655813 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2619  transcriptional regulator, ArsR family  63.83 
 
 
101 aa  131  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.276362  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3410  regulatory protein, ArsR  68.24 
 
 
129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.625513  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3179  transcriptional regulator, ArsR family  67.47 
 
 
98 aa  122  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000156262  hitchhiker  0.00000576379 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1940  putative transcriptional regulator, ArsR family  57.61 
 
 
100 aa  105  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.146779  normal  0.0107973 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4686  regulatory protein, ArsR  52.27 
 
 
263 aa  95.9  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0399394  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2031  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  51.14 
 
 
268 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.298531 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1684  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 
104 aa  94.4  5e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.366307  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5112  transcriptional regulator, ArsR family  55.17 
 
 
263 aa  92.4  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.340574 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1019  transcriptional regulator, ArsR family  52.27 
 
 
250 aa  91.7  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.736024 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3981  helix-turn-helix, type 11  48.86 
 
 
107 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6785  ArsR family transcriptional regulator  50.57 
 
 
104 aa  89.7  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0336525 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1101  ArsR family transcriptional regulator  44.68 
 
 
247 aa  89.4  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000298233  normal  0.0138971 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2692  ArsR family transcriptional regulator  50.57 
 
 
250 aa  89  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0598068  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2736  ArsR family transcriptional regulator  50.57 
 
 
250 aa  89  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.341929  normal  0.257848 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2722  ArsR family transcriptional regulator  50.57 
 
 
250 aa  89  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.180734  normal  0.430326 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2391  regulatory protein ArsR  50 
 
 
115 aa  87.4  5e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.710298 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1475  transcriptional regulator, ArsR family  49.43 
 
 
104 aa  87.8  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3297  transcriptional regulator, ArsR family  50.59 
 
 
268 aa  85.5  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.481478  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3793  ArsR family transcriptional regulator  50.57 
 
 
110 aa  84.7  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.230802  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0777  transcriptional regulator, ArsR family  50.6 
 
 
267 aa  83.2  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0745  putative transcriptional regulator, ArsR family  47.06 
 
 
119 aa  82  0.000000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.371363  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04778  putative transcription regulator protein  47.06 
 
 
111 aa  81.6  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05659  putative transcription regulator protein  47.06 
 
 
111 aa  81.6  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1920  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  45.45 
 
 
260 aa  78.2  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0328503  normal  0.836165 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1799  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  45.45 
 
 
270 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0572  ArsR family transcriptional regulator  44.05 
 
 
257 aa  76.6  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1482  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 
102 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.415166  normal  0.401747 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0690  regulatory protein ArsR  44.71 
 
 
110 aa  69.7  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  43.68 
 
 
115 aa  63.2  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3415  regulatory protein ArsR  44.05 
 
 
113 aa  60.8  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3384  transcriptional regulator, ArsR family  42.35 
 
 
105 aa  60.5  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508828  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1976  ArsR family transcriptional regulator  41.38 
 
 
104 aa  59.7  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0087105 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1143  ArsR family transcriptional regulator  36.26 
 
 
129 aa  60.1  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000407779  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  39.77 
 
 
104 aa  59.3  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3231  transcriptional regulator, ArsR family  40.23 
 
 
110 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.942122  normal  0.922972 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2050  ArsR family transcriptional regulator  38.37 
 
 
104 aa  58.2  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824329  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2855  transcriptional regulator, ArsR family  46.32 
 
 
100 aa  57.8  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.293533  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3526  transcriptional regulator, ArsR family  40.23 
 
 
110 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0231153  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2320  ArsR family transcriptional regulator  38.2 
 
 
103 aa  57  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2538  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  36.36 
 
 
240 aa  57  0.00000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4277  transcriptional regulator, ArsR family  36.26 
 
 
108 aa  57  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2792  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 
103 aa  57  0.00000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0482  regulatory protein ArsR  39.77 
 
 
108 aa  56.6  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  41.86 
 
 
115 aa  56.6  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2829  regulatory protein, ArsR  36.9 
 
 
108 aa  56.2  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00161963  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3489  ArsR family transcriptional regulator  41.98 
 
 
107 aa  56.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.656263 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2163  ArsR family transcriptional regulator  40.48 
 
 
141 aa  55.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.159359  decreased coverage  0.0016254 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4480  transcriptional regulator, ArsR family  40.7 
 
 
152 aa  55.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3080  regulatory protein ArsR  40.91 
 
 
104 aa  55.5  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5830  putative transcriptional regulator, ArsR family  40.23 
 
 
128 aa  55.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2621  ArsR family transcriptional regulator  39.51 
 
 
107 aa  54.7  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.136975  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
104 aa  54.7  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6062  transcriptional regulator, ArsR family  37.08 
 
 
104 aa  54.7  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3693  transcriptional regulator, ArsR family  39.77 
 
 
140 aa  54.7  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.4544 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  40.23 
 
 
109 aa  54.3  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1697  ArsR family transcriptional regulator  28.89 
 
 
86 aa  54.3  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000623406  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  43.02 
 
 
118 aa  53.9  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0774  ArsR family transcriptional regulator  38.27 
 
 
107 aa  53.9  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5842  transcriptional regulator, ArsR family  39.08 
 
 
109 aa  53.5  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2069  transcriptional regulator, ArsR family  40.74 
 
 
107 aa  53.9  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0785  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 
104 aa  53.9  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4133  regulatory protein ArsR  41.25 
 
 
106 aa  53.5  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4541  ArsR family transcriptional regulator  39.53 
 
 
107 aa  53.5  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2659  transcriptional regulator, ArsR family  39.33 
 
 
110 aa  53.5  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2754  transcriptional regulator, ArsR family  39.33 
 
 
110 aa  53.5  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0602  regulatory protein ArsR  41.18 
 
 
123 aa  53.5  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0753  regulatory protein ArsR  31.33 
 
 
95 aa  53.5  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4852  ArsR family transcriptional regulator  38.37 
 
 
107 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4442  ArsR family transcriptional regulator  38.37 
 
 
107 aa  52.8  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00577501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4460  ArsR family transcriptional regulator  38.37 
 
 
107 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7536  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 
193 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.92847 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0687  regulatory protein ArsR  31.33 
 
 
95 aa  52.8  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2922  transcriptional regulator, ArsR family  35.05 
 
 
176 aa  53.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0414  transcriptional regulator, ArsR family  38.37 
 
 
107 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0893062  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4828  transcriptional regulator, ArsR family  38.37 
 
 
107 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8897  putative transcriptional regulator, ArsR family  44.59 
 
 
109 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2300  transcriptional regulator, ArsR family  35.05 
 
 
99 aa  53.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.290076  hitchhiker  0.000322902 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4502  regulatory protein ArsR  38.27 
 
 
107 aa  53.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.329127 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4846  transcriptional regulator, ArsR family  38.37 
 
 
107 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018293  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4822  transcriptional regulator, ArsR family  38.37 
 
 
107 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0136  ArsR family transcriptional regulator  31.33 
 
 
95 aa  52.8  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4606  ArsR family transcriptional regulator  38.37 
 
 
107 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.325995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4962  ArsR family transcriptional regulator  38.37 
 
 
107 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0995274  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5395  transcriptional regulator, ArsR family  38.82 
 
 
120 aa  52.4  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4518  regulatory protein, ArsR  36.05 
 
 
119 aa  52.8  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0897151  normal  0.876093 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2302  transcriptional regulator, ArsR family  39.51 
 
 
107 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.640095 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1231  ArsR family transcriptional regulator  31.33 
 
 
95 aa  52.4  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2149  regulatory protein, ArsR  35.29 
 
 
108 aa  52.8  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02750  regulatory protein ArsR  36.9 
 
 
97 aa  51.6  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3603  ArsR family transcriptional regulator  38.27 
 
 
107 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4442  ArsR family transcriptional regulator  38.27 
 
 
107 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550147  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1381  transcriptional regulator, ArsR family  38.1 
 
 
133 aa  52  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3925  ArsR family transcriptional regulator  38.27 
 
 
107 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.725948  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2973  transcriptional regulator, ArsR family  36.78 
 
 
94 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>