76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3155 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3155  hypothetical protein  100 
 
 
678 aa  1373    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.736727  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2549  hypothetical protein  68.89 
 
 
667 aa  934    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.616235 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2557  aminoglycoside phosphotransferase  68.74 
 
 
667 aa  932    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.898182  normal  0.739218 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3374  aminoglycoside phosphotransferase  77.51 
 
 
661 aa  1035    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.116531 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2512  aminoglycoside phosphotransferase  68.74 
 
 
667 aa  932    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0367  aminoglycoside phosphotransferase  38.57 
 
 
362 aa  227  6e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2585  protein of unknown function DUF227  33.43 
 
 
346 aa  184  6e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000429556  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8526  hypothetical protein  35.45 
 
 
322 aa  171  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.434149 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2246  hypothetical protein  35.34 
 
 
346 aa  171  4e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2220  hypothetical protein  31.64 
 
 
362 aa  168  2.9999999999999998e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2486  aminoglycoside phosphotransferase  35.56 
 
 
359 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2531  aminoglycoside phosphotransferase  35.56 
 
 
359 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  0.606959 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0979  hypothetical protein  32.88 
 
 
358 aa  159  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2523  aminoglycoside phosphotransferase  34.17 
 
 
359 aa  156  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238738  normal  0.0936723 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3102  aminoglycoside phosphotransferase  33.97 
 
 
365 aa  138  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3433  aminoglycoside phosphotransferase  34.99 
 
 
359 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0252368  normal  0.972006 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3837  protein of unknown function DUF227  32.18 
 
 
349 aa  128  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4117  hypothetical protein  26.91 
 
 
382 aa  91.7  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2228  aminoglycoside phosphotransferase  27.13 
 
 
380 aa  84  0.000000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276157  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4330  hypothetical protein  29.81 
 
 
350 aa  80.9  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2016  aminoglycoside phosphotransferase  27.81 
 
 
367 aa  80.5  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.800046 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1766  hypothetical protein  27.27 
 
 
384 aa  73.9  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00135853  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3077  hypothetical protein  28.84 
 
 
344 aa  67.4  0.0000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.257575  normal  0.207932 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3819  hypothetical protein  29.76 
 
 
357 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.323634 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3907  hypothetical protein  29.76 
 
 
357 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.414972  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3833  hypothetical protein  29.76 
 
 
357 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0625  hypothetical protein  28.36 
 
 
345 aa  63.9  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5522  hypothetical protein  25.82 
 
 
345 aa  63.2  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0329  hypothetical protein  27.69 
 
 
360 aa  62.4  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0029643  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1992  hypothetical protein  27.73 
 
 
378 aa  61.6  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.616022  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4018  hypothetical protein  28.09 
 
 
372 aa  61.2  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.41342  normal  0.763019 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2011  aminoglycoside phosphotransferase  27.73 
 
 
378 aa  59.7  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2057  aminoglycoside phosphotransferase  27.73 
 
 
378 aa  59.7  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2429  hypothetical protein  27.31 
 
 
338 aa  53.5  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0125007  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4223  hypothetical protein  29.6 
 
 
356 aa  53.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2476  aminoglycoside phosphotransferase  48.98 
 
 
338 aa  52.4  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000012289  decreased coverage  0.00166754 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01062  aminoglycoside phosphotransferase  36.62 
 
 
352 aa  51.6  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.533136  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1859  aminoglycoside phosphotransferase  35.8 
 
 
338 aa  51.2  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4543  aminoglycoside phosphotransferase  31.06 
 
 
359 aa  50.4  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02343  hypothetical protein  35.16 
 
 
364 aa  50.1  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.445961  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4225  hypothetical protein  25.26 
 
 
333 aa  50.4  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.265608 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0303  hypothetical protein  23.37 
 
 
360 aa  50.1  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.571715  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1813  aminoglycoside phosphotransferase  31.71 
 
 
344 aa  48.9  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5019  aminoglycoside phosphotransferase  47.83 
 
 
343 aa  48.5  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4338  aminoglycoside phosphotransferase  47.83 
 
 
343 aa  48.5  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5841  aminoglycoside phosphotransferase  47.83 
 
 
343 aa  48.5  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5718  aminoglycoside phosphotransferase  49.02 
 
 
343 aa  48.5  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1524  hypothetical protein  24.55 
 
 
329 aa  47.4  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5274  aminoglycoside phosphotransferase  47.17 
 
 
343 aa  47.4  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1501  hypothetical protein  24.55 
 
 
329 aa  47.4  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.627335  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1501  hypothetical protein  23.97 
 
 
329 aa  47.4  0.0009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2384  hypothetical protein  30.1 
 
 
335 aa  47.4  0.0009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.728607 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5078  aminoglycoside phosphotransferase  45.28 
 
 
357 aa  47  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114652  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3673  hypothetical protein  24.56 
 
 
309 aa  47  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3865  aminoglycoside phosphotransferase  52.27 
 
 
350 aa  46.2  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0767712  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3218  aminoglycoside phosphotransferase  45.65 
 
 
343 aa  45.8  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1559  aminoglycoside phosphotransferase  24.64 
 
 
344 aa  46.2  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1831  aminoglycoside phosphotransferase  44.68 
 
 
451 aa  46.2  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1357  aminoglycoside phosphotransferase  37.62 
 
 
312 aa  46.2  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.447446  normal  0.521982 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3187  putative tyrosine protein kinase/aminoglycoside phosphotransferase  37.21 
 
 
368 aa  46.2  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2209  aminoglycoside phosphotransferase  27.27 
 
 
350 aa  46.2  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.375246  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1368  aminoglycoside phosphotransferase  37.21 
 
 
368 aa  45.8  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544786  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6405  aminoglycoside phosphotransferase  47.06 
 
 
343 aa  45.4  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4558  aminoglycoside phosphotransferase  31.91 
 
 
344 aa  45.8  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00141658 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4784  hypothetical protein  32.63 
 
 
123 aa  45.4  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.461111  normal  0.569972 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2068  aminoglycoside phosphotransferase  44.44 
 
 
344 aa  45.4  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6920  aminoglycoside phosphotransferase  40.32 
 
 
348 aa  45.4  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2241  hypothetical protein  34.21 
 
 
349 aa  45.1  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.235594  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3038  aminoglycoside phosphotransferase  47.62 
 
 
343 aa  45.1  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145633  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0835  aminoglycoside phosphotransferase  46.51 
 
 
360 aa  45.1  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.407131  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5104  putative tyrosine protein kinase  31.82 
 
 
352 aa  45.1  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2018  hypothetical protein  23.24 
 
 
398 aa  44.3  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.135716  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4307  aminoglycoside phosphotransferase  38.1 
 
 
362 aa  44.3  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0855792  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0116  aminoglycoside phosphotransferase  36.36 
 
 
379 aa  43.9  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5046  aminoglycoside phosphotransferase  42.86 
 
 
342 aa  43.9  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.895104 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1820  aminoglycoside phosphotransferase  35.23 
 
 
352 aa  43.9  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0105242 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>