30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0303 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0303  hypothetical protein  100 
 
 		 360 aa  735    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.571715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0329  hypothetical protein  41.48 
 
 		 360 aa  229  7e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0029643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0625  hypothetical protein  33.55 
 
 		 345 aa  139  7e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2018  hypothetical protein  28.06 
 
 		 398 aa  129  8.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.135716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4018  hypothetical protein  26.63 
 
 		 372 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.41342  normal  0.763019 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4223  hypothetical protein  27.09 
 
 		 356 aa  99  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2228  aminoglycoside phosphotransferase  27.16 
 
 		 380 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276157  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3907  hypothetical protein  27.37 
 
 		 357 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.414972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3819  hypothetical protein  27.37 
 
 		 357 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.323634 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3833  hypothetical protein  27.37 
 
 		 357 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2429  hypothetical protein  27.54 
 
 		 338 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0125007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1992  hypothetical protein  28.92 
 
 		 378 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.616022  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2057  aminoglycoside phosphotransferase  28.92 
 
 		 378 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2011  aminoglycoside phosphotransferase  28.92 
 
 		 378 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4117  hypothetical protein  27.05 
 
 		 382 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1598  hypothetical protein  38.4 
 
 		 260 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.651223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2585  protein of unknown function DUF227  26.74 
 
 		 346 aa  68.6  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000429556  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3433  aminoglycoside phosphotransferase  24.77 
 
 		 359 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0252368  normal  0.972006 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1766  hypothetical protein  23.36 
 
 		 384 aa  58.5  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00135853  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2486  aminoglycoside phosphotransferase  24.2 
 
 		 359 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2531  aminoglycoside phosphotransferase  24.2 
 
 		 359 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  0.606959 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2523  aminoglycoside phosphotransferase  24.46 
 
 		 359 aa  56.6  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238738  normal  0.0936723 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3837  protein of unknown function DUF227  20.5 
 
 		 349 aa  55.5  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2220  hypothetical protein  24.77 
 
 		 362 aa  53.9  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3102  aminoglycoside phosphotransferase  24.3 
 
 		 365 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3155  hypothetical protein  23.37 
 
 		 678 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.736727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0367  aminoglycoside phosphotransferase  25.55 
 
 		 362 aa  49.3  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2246  hypothetical protein  29.55 
 
 		 346 aa  48.9  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3374  aminoglycoside phosphotransferase  22.68 
 
 		 661 aa  43.9  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116531 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0265  aminoglycoside phosphotransferase  25.93 
 
 		 308 aa  42.7  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.702133  normal  0.22285 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>