46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4223 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_4223  hypothetical protein  100 
 
 
356 aa  714    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2429  hypothetical protein  85.12 
 
 
338 aa  573  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0125007  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3819  hypothetical protein  65.35 
 
 
357 aa  472  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.323634 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3907  hypothetical protein  65.35 
 
 
357 aa  472  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.414972  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3833  hypothetical protein  65.35 
 
 
357 aa  472  1e-132  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1598  hypothetical protein  60.77 
 
 
260 aa  161  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.651223  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4018  hypothetical protein  34.41 
 
 
372 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.41342  normal  0.763019 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0625  hypothetical protein  31.45 
 
 
345 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2018  hypothetical protein  27.67 
 
 
398 aa  122  6e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.135716  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4117  hypothetical protein  34.17 
 
 
382 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2228  aminoglycoside phosphotransferase  34.18 
 
 
380 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276157  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0329  hypothetical protein  29.79 
 
 
360 aa  107  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0029643  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2057  aminoglycoside phosphotransferase  35.22 
 
 
378 aa  106  7e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2011  aminoglycoside phosphotransferase  35.22 
 
 
378 aa  106  7e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1992  hypothetical protein  34.25 
 
 
378 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.616022  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0303  hypothetical protein  27.09 
 
 
360 aa  99  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.571715  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4330  hypothetical protein  28.96 
 
 
350 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3837  protein of unknown function DUF227  27.22 
 
 
349 aa  85.9  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2016  aminoglycoside phosphotransferase  28.53 
 
 
367 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.800046 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3433  aminoglycoside phosphotransferase  29.5 
 
 
359 aa  80.5  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0252368  normal  0.972006 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1766  hypothetical protein  25.35 
 
 
384 aa  73.9  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00135853  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0367  aminoglycoside phosphotransferase  27.96 
 
 
362 aa  73.6  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2585  protein of unknown function DUF227  28.22 
 
 
346 aa  72  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000429556  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0979  hypothetical protein  28.77 
 
 
358 aa  70.1  0.00000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3102  aminoglycoside phosphotransferase  28.62 
 
 
365 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2531  aminoglycoside phosphotransferase  27.68 
 
 
359 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  0.606959 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2486  aminoglycoside phosphotransferase  27.68 
 
 
359 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2523  aminoglycoside phosphotransferase  27.12 
 
 
359 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238738  normal  0.0936723 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2096  hypothetical protein  55.36 
 
 
127 aa  64.3  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2220  hypothetical protein  25.69 
 
 
362 aa  57  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2246  hypothetical protein  27.1 
 
 
346 aa  55.8  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2549  hypothetical protein  25.5 
 
 
667 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.616235 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2557  aminoglycoside phosphotransferase  26.76 
 
 
667 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.898182  normal  0.739218 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2512  aminoglycoside phosphotransferase  26.76 
 
 
667 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3155  hypothetical protein  29.6 
 
 
678 aa  53.1  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.736727  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3374  aminoglycoside phosphotransferase  28.57 
 
 
661 aa  47  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.116531 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3738  ABC-1 domain protein  36.59 
 
 
455 aa  45.8  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0582734  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1959  aminoglycoside phosphotransferase  34.09 
 
 
331 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02343  hypothetical protein  24.27 
 
 
364 aa  43.9  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.445961  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1286  hypothetical protein  25.81 
 
 
320 aa  44.3  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00430498  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15860  predicted unusual protein kinase  55.88 
 
 
550 aa  43.9  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0876  protein of unknown function DUF227  29.94 
 
 
332 aa  44.3  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.620129  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1172  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  42.11 
 
 
558 aa  43.9  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17900  predicted aminoglycoside phosphotransferase  35.53 
 
 
323 aa  43.5  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.215694  normal  0.505418 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0991  aminoglycoside phosphotransferase  33.33 
 
 
349 aa  43.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.129847 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3886  unusual protein kinase-like  25 
 
 
480 aa  42.7  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>