86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2220 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_2220  hypothetical protein  100 
 
 
362 aa  736    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0979  hypothetical protein  37.68 
 
 
358 aa  209  6e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0367  aminoglycoside phosphotransferase  35.8 
 
 
362 aa  208  1e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2549  hypothetical protein  36.26 
 
 
667 aa  200  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.616235 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2557  aminoglycoside phosphotransferase  36.26 
 
 
667 aa  199  6e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.898182  normal  0.739218 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2512  aminoglycoside phosphotransferase  36.26 
 
 
667 aa  199  6e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2585  protein of unknown function DUF227  36.49 
 
 
346 aa  189  8e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000429556  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2246  hypothetical protein  37.85 
 
 
346 aa  177  2e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3155  hypothetical protein  31.64 
 
 
678 aa  168  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.736727  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3374  aminoglycoside phosphotransferase  31.83 
 
 
661 aa  164  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.116531 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2523  aminoglycoside phosphotransferase  32.12 
 
 
359 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238738  normal  0.0936723 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2531  aminoglycoside phosphotransferase  32.57 
 
 
359 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  0.606959 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2486  aminoglycoside phosphotransferase  32.57 
 
 
359 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3837  protein of unknown function DUF227  31.76 
 
 
349 aa  153  4e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3102  aminoglycoside phosphotransferase  31.67 
 
 
365 aa  137  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3433  aminoglycoside phosphotransferase  29.49 
 
 
359 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0252368  normal  0.972006 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2016  aminoglycoside phosphotransferase  33.77 
 
 
367 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.800046 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4330  hypothetical protein  29.97 
 
 
350 aa  112  9e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0625  hypothetical protein  26.76 
 
 
345 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1286  hypothetical protein  23.02 
 
 
320 aa  62.8  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00430498  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4018  hypothetical protein  26.98 
 
 
372 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.41342  normal  0.763019 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3819  hypothetical protein  28.02 
 
 
357 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.323634 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3833  hypothetical protein  28.02 
 
 
357 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3907  hypothetical protein  28.02 
 
 
357 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.414972  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4117  hypothetical protein  27.37 
 
 
382 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2228  aminoglycoside phosphotransferase  26.67 
 
 
380 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276157  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1766  hypothetical protein  24.32 
 
 
384 aa  57  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00135853  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4223  hypothetical protein  25.69 
 
 
356 aa  57  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2068  aminoglycoside phosphotransferase  34.29 
 
 
344 aa  54.7  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0303  hypothetical protein  24.77 
 
 
360 aa  53.9  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.571715  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0876  protein of unknown function DUF227  27.78 
 
 
332 aa  53.9  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.620129  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5019  aminoglycoside phosphotransferase  36.17 
 
 
343 aa  53.5  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5841  aminoglycoside phosphotransferase  36.17 
 
 
343 aa  53.5  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4338  aminoglycoside phosphotransferase  36.17 
 
 
343 aa  53.5  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4225  hypothetical protein  21.83 
 
 
333 aa  52.4  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.265608 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5274  aminoglycoside phosphotransferase  37.23 
 
 
343 aa  51.6  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001235  hypothetical protein  23.21 
 
 
332 aa  51.6  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.676733  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2429  hypothetical protein  28.41 
 
 
338 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0125007  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01062  aminoglycoside phosphotransferase  32.97 
 
 
352 aa  50.4  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.533136  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17900  predicted aminoglycoside phosphotransferase  34.44 
 
 
323 aa  50.1  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.215694  normal  0.505418 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1035  aminoglycoside phosphotransferase  32.71 
 
 
353 aa  50.1  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261257  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3218  aminoglycoside phosphotransferase  36.17 
 
 
343 aa  49.7  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1992  hypothetical protein  27.42 
 
 
378 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.616022  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2011  aminoglycoside phosphotransferase  27.42 
 
 
378 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2057  aminoglycoside phosphotransferase  27.42 
 
 
378 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5078  aminoglycoside phosphotransferase  35.11 
 
 
357 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114652  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5046  aminoglycoside phosphotransferase  27.21 
 
 
342 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.895104 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3590  aminoglycoside phosphotransferase  45.83 
 
 
370 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2861  aminoglycoside phosphotransferase  34.15 
 
 
345 aa  47.8  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2384  hypothetical protein  20.86 
 
 
335 aa  47.8  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.728607 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3038  aminoglycoside phosphotransferase  34.04 
 
 
343 aa  47  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145633  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05102  hypothetical protein  22.81 
 
 
328 aa  47  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0471  aminoglycoside phosphotransferase  28.25 
 
 
403 aa  46.6  0.0007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6405  aminoglycoside phosphotransferase  31.91 
 
 
343 aa  46.2  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1706  aminoglycoside phosphotransferase  34.23 
 
 
355 aa  46.2  0.0009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.9599  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4543  aminoglycoside phosphotransferase  27.4 
 
 
359 aa  45.8  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1952  hypothetical protein  25.77 
 
 
363 aa  45.8  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.126845 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2629  aminoglycoside phosphotransferase  35.16 
 
 
368 aa  44.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0566206  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2361  phosphotransferase enzyme family protein, putative  29.2 
 
 
322 aa  45.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.699195  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4576  aminoglycoside phosphotransferase  28.39 
 
 
357 aa  45.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.822662 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1859  aminoglycoside phosphotransferase  32.18 
 
 
338 aa  45.1  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5718  aminoglycoside phosphotransferase  30.43 
 
 
343 aa  44.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5104  putative tyrosine protein kinase  38.46 
 
 
352 aa  45.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2603  aminoglycoside phosphotransferase  26.97 
 
 
367 aa  45.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000127207  hitchhiker  0.00111486 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0222  aminoglycoside phosphotransferase  28.83 
 
 
355 aa  44.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.193801  normal  0.0244768 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1108  aminoglycoside phosphotransferase  42.55 
 
 
362 aa  44.3  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0793428  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0835  aminoglycoside phosphotransferase  31.25 
 
 
360 aa  44.3  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.407131  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0618  putative phosphotransferase  29.52 
 
 
350 aa  44.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172758  normal  0.0703036 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1885  aminoglycoside phosphotransferase  34.21 
 
 
354 aa  44.3  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3076  aminoglycoside phosphotransferase  41.27 
 
 
361 aa  44.3  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.986116  normal  0.214027 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1323  phosphotransferase enzyme family protein  35.05 
 
 
368 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2096  hypothetical protein  22.44 
 
 
340 aa  43.9  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0262717  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0329  hypothetical protein  27.41 
 
 
360 aa  43.9  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0029643  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3072  aminoglycoside phosphotransferase  31.82 
 
 
388 aa  43.9  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267154  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1844  hypothetical protein  28.42 
 
 
339 aa  43.5  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00606035  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2724  hypothetical protein  25.38 
 
 
355 aa  43.9  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2457  aminoglycoside phosphotransferase  25.14 
 
 
355 aa  43.5  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00764802 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1459  aminoglycoside phosphotransferase  32.61 
 
 
354 aa  43.5  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.049097  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27745  predicted protein  25.99 
 
 
850 aa  43.5  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0531336  normal  0.0916704 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3286  aminoglycoside phosphotransferase  34.94 
 
 
361 aa  43.1  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.597573 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7669  phosphotransferase family protein  44 
 
 
349 aa  43.1  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.799733  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1813  aminoglycoside phosphotransferase  32.26 
 
 
344 aa  43.1  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2397  aminoglycoside phosphotransferase  41.46 
 
 
362 aa  43.1  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1944  aminoglycoside phosphotransferase  39.68 
 
 
361 aa  42.7  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3467  hypothetical protein  28.68 
 
 
356 aa  42.7  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2519  aminoglycoside phosphotransferase  32.65 
 
 
349 aa  42.7  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177703  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>