27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1286 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1286  hypothetical protein  100 
 
 		 320 aa  671    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00430498  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001235  hypothetical protein  59.41 
 
 		 332 aa  383  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.676733  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05102  hypothetical protein  60.13 
 
 		 328 aa  384  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3627  hypothetical protein  56.49 
 
 		 329 aa  363  3e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0876  protein of unknown function DUF227  50.33 
 
 		 332 aa  323  2e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.620129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2384  hypothetical protein  46.25 
 
 		 335 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.728607 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2241  hypothetical protein  46.06 
 
 		 349 aa  296  2e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.235594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2096  hypothetical protein  40 
 
 		 340 aa  265  1e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0262717  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3439  hypothetical protein  41.9 
 
 		 339 aa  259  3e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2009  hypothetical protein  41.62 
 
 		 359 aa  258  1e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.741438  normal  0.129044 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4225  hypothetical protein  39.56 
 
 		 333 aa  246  4e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.265608 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02343  hypothetical protein  36.93 
 
 		 364 aa  230  2e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.445961  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50054  predicted protein  29.82 
 
 		 352 aa  106  6e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.702034  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0367  aminoglycoside phosphotransferase  28.32 
 
 		 362 aa  76.6  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03770  conserved hypothetical protein  24.6 
 
 		 414 aa  73.6  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2220  hypothetical protein  23.02 
 
 		 362 aa  62.8  0.000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2523  aminoglycoside phosphotransferase  23.83 
 
 		 359 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238738  normal  0.0936723 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2486  aminoglycoside phosphotransferase  24.19 
 
 		 359 aa  59.3  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2531  aminoglycoside phosphotransferase  24.19 
 
 		 359 aa  59.3  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  0.606959 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3433  aminoglycoside phosphotransferase  31.4 
 
 		 359 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0252368  normal  0.972006 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2228  aminoglycoside phosphotransferase  25.12 
 
 		 380 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276157  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0979  hypothetical protein  25.27 
 
 		 358 aa  49.3  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3102  aminoglycoside phosphotransferase  21.52 
 
 		 365 aa  49.3  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2016  aminoglycoside phosphotransferase  23.32 
 
 		 367 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800046 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27745  predicted protein  29.03 
 
 		 850 aa  45.8  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0531336  normal  0.0916704 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2246  hypothetical protein  28.57 
 
 		 346 aa  45.1  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4223  hypothetical protein  25.81 
 
 		 356 aa  44.3  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>