42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4117 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4117  hypothetical protein  100 
 
 
382 aa  751    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2228  aminoglycoside phosphotransferase  78.33 
 
 
380 aa  580  1e-164  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276157  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1992  hypothetical protein  67.2 
 
 
378 aa  475  1e-133  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.616022  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2011  aminoglycoside phosphotransferase  67.2 
 
 
378 aa  473  1e-132  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2057  aminoglycoside phosphotransferase  67.2 
 
 
378 aa  473  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1766  hypothetical protein  32.73 
 
 
384 aa  156  7e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00135853  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2018  hypothetical protein  28.11 
 
 
398 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.135716  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2429  hypothetical protein  36.04 
 
 
338 aa  124  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0125007  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3833  hypothetical protein  32.49 
 
 
357 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3819  hypothetical protein  32.49 
 
 
357 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.323634 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3907  hypothetical protein  32.49 
 
 
357 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.414972  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4223  hypothetical protein  34.17 
 
 
356 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2585  protein of unknown function DUF227  31.14 
 
 
346 aa  104  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000429556  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4018  hypothetical protein  30.89 
 
 
372 aa  103  6e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.41342  normal  0.763019 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0367  aminoglycoside phosphotransferase  31.14 
 
 
362 aa  91.7  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3155  hypothetical protein  26.91 
 
 
678 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.736727  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4330  hypothetical protein  29.01 
 
 
350 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3102  aminoglycoside phosphotransferase  30.63 
 
 
365 aa  83.2  0.000000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0329  hypothetical protein  31.7 
 
 
360 aa  83.2  0.000000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0029643  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2016  aminoglycoside phosphotransferase  30.48 
 
 
367 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.800046 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0625  hypothetical protein  29.14 
 
 
345 aa  82  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2557  aminoglycoside phosphotransferase  26.45 
 
 
667 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.898182  normal  0.739218 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2512  aminoglycoside phosphotransferase  26.45 
 
 
667 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2549  hypothetical protein  26.45 
 
 
667 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.616235 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1598  hypothetical protein  38.97 
 
 
260 aa  79.3  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.651223  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3433  aminoglycoside phosphotransferase  29.12 
 
 
359 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0252368  normal  0.972006 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0303  hypothetical protein  27.05 
 
 
360 aa  78.2  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.571715  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3374  aminoglycoside phosphotransferase  30.33 
 
 
661 aa  76.6  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.116531 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2531  aminoglycoside phosphotransferase  27.97 
 
 
359 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  0.606959 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3837  protein of unknown function DUF227  29.12 
 
 
349 aa  75.9  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2486  aminoglycoside phosphotransferase  27.97 
 
 
359 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2523  aminoglycoside phosphotransferase  27.62 
 
 
359 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238738  normal  0.0936723 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2246  hypothetical protein  30.59 
 
 
346 aa  71.2  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0979  hypothetical protein  27.11 
 
 
358 aa  65.9  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2220  hypothetical protein  27.37 
 
 
362 aa  58.2  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2384  hypothetical protein  21.65 
 
 
335 aa  53.5  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.728607 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02343  hypothetical protein  26.72 
 
 
364 aa  46.6  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.445961  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0876  protein of unknown function DUF227  25.29 
 
 
332 aa  46.2  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.620129  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4225  hypothetical protein  23.79 
 
 
333 aa  44.3  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.265608 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2483  aminoglycoside phosphotransferase  35.11 
 
 
323 aa  44.3  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0370489  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2380  aminoglycoside phosphotransferase  36.92 
 
 
285 aa  43.9  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2364  aminoglycoside phosphotransferase  23.85 
 
 
261 aa  43.1  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.488578 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>