34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2384 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2384  hypothetical protein  100 
 
 		 335 aa  700    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.728607 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2241  hypothetical protein  56.47 
 
 		 349 aa  391  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.235594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2096  hypothetical protein  50.46 
 
 		 340 aa  322  6e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0262717  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0876  protein of unknown function DUF227  48.12 
 
 		 332 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.620129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1286  hypothetical protein  46.25 
 
 		 320 aa  303  3.0000000000000004e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00430498  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4225  hypothetical protein  45.26 
 
 		 333 aa  284  2.0000000000000002e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.265608 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2009  hypothetical protein  43.26 
 
 		 359 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.741438  normal  0.129044 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3439  hypothetical protein  41.89 
 
 		 339 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3627  hypothetical protein  41.37 
 
 		 329 aa  271  9e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001235  hypothetical protein  41.49 
 
 		 332 aa  271  1e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.676733  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05102  hypothetical protein  40.55 
 
 		 328 aa  255  1.0000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02343  hypothetical protein  37.18 
 
 		 364 aa  232  9e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.445961  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50054  predicted protein  28.71 
 
 		 352 aa  105  1e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.702034  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03770  conserved hypothetical protein  25.48 
 
 		 414 aa  69.3  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4117  hypothetical protein  21.65 
 
 		 382 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2523  aminoglycoside phosphotransferase  21.81 
 
 		 359 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238738  normal  0.0936723 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2531  aminoglycoside phosphotransferase  21.34 
 
 		 359 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  0.606959 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2486  aminoglycoside phosphotransferase  21.34 
 
 		 359 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3433  aminoglycoside phosphotransferase  33.33 
 
 		 359 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0252368  normal  0.972006 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2057  aminoglycoside phosphotransferase  28.83 
 
 		 378 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2557  aminoglycoside phosphotransferase  25.76 
 
 		 667 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.898182  normal  0.739218 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2011  aminoglycoside phosphotransferase  28.83 
 
 		 378 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2512  aminoglycoside phosphotransferase  25.76 
 
 		 667 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2549  hypothetical protein  25.76 
 
 		 667 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.616235 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0367  aminoglycoside phosphotransferase  22.53 
 
 		 362 aa  47.8  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3155  hypothetical protein  30.1 
 
 		 678 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.736727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1992  hypothetical protein  27.93 
 
 		 378 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.616022  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2220  hypothetical protein  20.86 
 
 		 362 aa  47.8  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2246  hypothetical protein  32.43 
 
 		 346 aa  47  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3102  aminoglycoside phosphotransferase  32.39 
 
 		 365 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3374  aminoglycoside phosphotransferase  29.49 
 
 		 661 aa  43.9  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116531 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2016  aminoglycoside phosphotransferase  33.33 
 
 		 367 aa  44.7  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800046 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2228  aminoglycoside phosphotransferase  20.92 
 
 		 380 aa  43.1  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276157  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27745  predicted protein  23.24 
 
 		 850 aa  42.7  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0531336  normal  0.0916704 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>