43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2011 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2011  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
378 aa  754    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1992  hypothetical protein  98.94 
 
 
378 aa  749    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.616022  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2057  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
378 aa  754    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2228  aminoglycoside phosphotransferase  66.49 
 
 
380 aa  499  1e-140  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276157  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4117  hypothetical protein  67.2 
 
 
382 aa  492  9.999999999999999e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1766  hypothetical protein  32.93 
 
 
384 aa  151  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00135853  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3819  hypothetical protein  34.55 
 
 
357 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.323634 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3833  hypothetical protein  34.55 
 
 
357 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3907  hypothetical protein  34.55 
 
 
357 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.414972  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2018  hypothetical protein  27.43 
 
 
398 aa  124  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.135716  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4018  hypothetical protein  30.93 
 
 
372 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.41342  normal  0.763019 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4223  hypothetical protein  35.22 
 
 
356 aa  108  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2429  hypothetical protein  33.13 
 
 
338 aa  107  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0125007  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2585  protein of unknown function DUF227  28.89 
 
 
346 aa  86.7  6e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000429556  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0303  hypothetical protein  27.73 
 
 
360 aa  85.1  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.571715  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0625  hypothetical protein  32.13 
 
 
345 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3102  aminoglycoside phosphotransferase  28.93 
 
 
365 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0329  hypothetical protein  32.66 
 
 
360 aa  81.6  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0029643  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1598  hypothetical protein  38.81 
 
 
260 aa  79.3  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.651223  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2531  aminoglycoside phosphotransferase  25.84 
 
 
359 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  0.606959 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3433  aminoglycoside phosphotransferase  28.21 
 
 
359 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0252368  normal  0.972006 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2486  aminoglycoside phosphotransferase  25.84 
 
 
359 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2523  aminoglycoside phosphotransferase  25.56 
 
 
359 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238738  normal  0.0936723 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0367  aminoglycoside phosphotransferase  27.67 
 
 
362 aa  72.4  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3837  protein of unknown function DUF227  26.29 
 
 
349 aa  72.4  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4330  hypothetical protein  29.97 
 
 
350 aa  70.1  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2557  aminoglycoside phosphotransferase  27.3 
 
 
667 aa  69.7  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.898182  normal  0.739218 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2512  aminoglycoside phosphotransferase  27.3 
 
 
667 aa  69.7  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2549  hypothetical protein  27.3 
 
 
667 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.616235 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0979  hypothetical protein  26.5 
 
 
358 aa  68.6  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2016  aminoglycoside phosphotransferase  28.9 
 
 
367 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.800046 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3155  hypothetical protein  26.97 
 
 
678 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.736727  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2246  hypothetical protein  30.77 
 
 
346 aa  58.5  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2220  hypothetical protein  26.29 
 
 
362 aa  53.5  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3374  aminoglycoside phosphotransferase  25.4 
 
 
661 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.116531 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2384  hypothetical protein  28.83 
 
 
335 aa  47.8  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.728607 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0876  protein of unknown function DUF227  28.22 
 
 
332 aa  47.8  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.620129  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0649  aminoglycoside phosphotransferase  26.61 
 
 
356 aa  45.8  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0418435  normal  0.791945 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05102  hypothetical protein  24.1 
 
 
328 aa  45.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02343  hypothetical protein  27.65 
 
 
364 aa  45.4  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.445961  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2364  aminoglycoside phosphotransferase  28.89 
 
 
261 aa  43.5  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.488578 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0641  aminoglycoside phosphotransferase  35.21 
 
 
265 aa  43.5  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.94891 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0894  aminoglycoside phosphotransferase  35.71 
 
 
459 aa  43.1  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.184458  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>