15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3439 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3439  hypothetical protein  100 
 
 		 339 aa  712    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2096  hypothetical protein  43.58 
 
 		 340 aa  293  4e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0262717  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2384  hypothetical protein  41.89 
 
 		 335 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.728607 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05102  hypothetical protein  44.52 
 
 		 328 aa  266  2.9999999999999995e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2241  hypothetical protein  43.2 
 
 		 349 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.235594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2009  hypothetical protein  43.09 
 
 		 359 aa  266  4e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.741438  normal  0.129044 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0876  protein of unknown function DUF227  45.34 
 
 		 332 aa  266  4e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.620129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1286  hypothetical protein  41.9 
 
 		 320 aa  259  3e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00430498  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001235  hypothetical protein  43.23 
 
 		 332 aa  256  6e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.676733  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4225  hypothetical protein  42.11 
 
 		 333 aa  253  4.0000000000000004e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.265608 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3627  hypothetical protein  38.74 
 
 		 329 aa  241  1e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02343  hypothetical protein  38.76 
 
 		 364 aa  230  3e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.445961  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50054  predicted protein  27.47 
 
 		 352 aa  85.5  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.702034  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03770  conserved hypothetical protein  27.89 
 
 		 414 aa  65.5  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2246  hypothetical protein  29.03 
 
 		 346 aa  42.4  0.01  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>