15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2009 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2009  hypothetical protein  100 
 
 		 359 aa  752    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.741438  normal  0.129044 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2241  hypothetical protein  45.95 
 
 		 349 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.235594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2096  hypothetical protein  45.22 
 
 		 340 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0262717  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2384  hypothetical protein  43.26 
 
 		 335 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.728607 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0876  protein of unknown function DUF227  42.94 
 
 		 332 aa  270  4e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.620129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3439  hypothetical protein  43.09 
 
 		 339 aa  266  4e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1286  hypothetical protein  41.62 
 
 		 320 aa  258  1e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00430498  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3627  hypothetical protein  40.9 
 
 		 329 aa  256  4e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4225  hypothetical protein  41.79 
 
 		 333 aa  253  3e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.265608 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001235  hypothetical protein  40.87 
 
 		 332 aa  243  5e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.676733  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05102  hypothetical protein  38.14 
 
 		 328 aa  241  1e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02343  hypothetical protein  37.06 
 
 		 364 aa  210  3e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.445961  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50054  predicted protein  30.4 
 
 		 352 aa  107  4e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.702034  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03770  conserved hypothetical protein  25.83 
 
 		 414 aa  74.7  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2016  aminoglycoside phosphotransferase  25.37 
 
 		 367 aa  44.7  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800046 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>