36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02343 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02343  hypothetical protein  100 
 
 		 364 aa  764    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.445961  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0876  protein of unknown function DUF227  41.18 
 
 		 332 aa  245  9.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.620129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2096  hypothetical protein  40.88 
 
 		 340 aa  242  6e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0262717  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2384  hypothetical protein  37.18 
 
 		 335 aa  232  1e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.728607 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1286  hypothetical protein  36.93 
 
 		 320 aa  230  3e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00430498  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3439  hypothetical protein  38.76 
 
 		 339 aa  230  3e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05102  hypothetical protein  38.69 
 
 		 328 aa  227  3e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001235  hypothetical protein  36.39 
 
 		 332 aa  226  6e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.676733  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2241  hypothetical protein  38.98 
 
 		 349 aa  225  9e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.235594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4225  hypothetical protein  38.26 
 
 		 333 aa  221  9.999999999999999e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.265608 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2009  hypothetical protein  37.06 
 
 		 359 aa  210  3e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.741438  normal  0.129044 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3627  hypothetical protein  34.96 
 
 		 329 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50054  predicted protein  30 
 
 		 352 aa  101  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.702034  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03770  conserved hypothetical protein  28.66 
 
 		 414 aa  89  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1766  hypothetical protein  27.11 
 
 		 384 aa  56.6  0.0000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00135853  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3374  aminoglycoside phosphotransferase  44.93 
 
 		 661 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116531 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2246  hypothetical protein  40.38 
 
 		 346 aa  52.8  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2512  aminoglycoside phosphotransferase  29.32 
 
 		 667 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0625  hypothetical protein  29.46 
 
 		 345 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2557  aminoglycoside phosphotransferase  29.32 
 
 		 667 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.898182  normal  0.739218 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2549  hypothetical protein  29.32 
 
 		 667 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.616235 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3155  hypothetical protein  35.16 
 
 		 678 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.736727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27745  predicted protein  25.46 
 
 		 850 aa  50.1  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0531336  normal  0.0916704 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4330  hypothetical protein  34.72 
 
 		 350 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2016  aminoglycoside phosphotransferase  31.88 
 
 		 367 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800046 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2429  hypothetical protein  25.94 
 
 		 338 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0125007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2585  protein of unknown function DUF227  23.76 
 
 		 346 aa  47.4  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000429556  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4117  hypothetical protein  26.72 
 
 		 382 aa  46.6  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2057  aminoglycoside phosphotransferase  27.65 
 
 		 378 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2011  aminoglycoside phosphotransferase  27.65 
 
 		 378 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4223  hypothetical protein  24.27 
 
 		 356 aa  43.9  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2531  aminoglycoside phosphotransferase  35.71 
 
 		 359 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  0.606959 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2486  aminoglycoside phosphotransferase  35.71 
 
 		 359 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2523  aminoglycoside phosphotransferase  35.71 
 
 		 359 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238738  normal  0.0936723 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0367  aminoglycoside phosphotransferase  23.95 
 
 		 362 aa  43.1  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3837  protein of unknown function DUF227  34.33 
 
 		 349 aa  43.1  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>