42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4330 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4330  hypothetical protein  100 
 
 
350 aa  701    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2016  aminoglycoside phosphotransferase  79.04 
 
 
367 aa  565  1e-160  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.800046 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2585  protein of unknown function DUF227  32.33 
 
 
346 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000429556  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0367  aminoglycoside phosphotransferase  29.39 
 
 
362 aa  115  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2486  aminoglycoside phosphotransferase  29.03 
 
 
359 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2531  aminoglycoside phosphotransferase  29.03 
 
 
359 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  0.606959 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2220  hypothetical protein  29.97 
 
 
362 aa  112  9e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2523  aminoglycoside phosphotransferase  28.27 
 
 
359 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238738  normal  0.0936723 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3837  protein of unknown function DUF227  29.64 
 
 
349 aa  109  6e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0979  hypothetical protein  29.61 
 
 
358 aa  103  6e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4223  hypothetical protein  28.96 
 
 
356 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3433  aminoglycoside phosphotransferase  29.09 
 
 
359 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0252368  normal  0.972006 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3102  aminoglycoside phosphotransferase  28.03 
 
 
365 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2246  hypothetical protein  30 
 
 
346 aa  86.7  5e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4117  hypothetical protein  29.01 
 
 
382 aa  85.9  9e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2557  aminoglycoside phosphotransferase  28.86 
 
 
667 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.898182  normal  0.739218 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2512  aminoglycoside phosphotransferase  28.86 
 
 
667 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2549  hypothetical protein  28.86 
 
 
667 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.616235 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2429  hypothetical protein  30.7 
 
 
338 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0125007  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3155  hypothetical protein  29.81 
 
 
678 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.736727  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3374  aminoglycoside phosphotransferase  29.9 
 
 
661 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.116531 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3819  hypothetical protein  28.65 
 
 
357 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.323634 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3907  hypothetical protein  28.65 
 
 
357 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.414972  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3833  hypothetical protein  28.65 
 
 
357 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2228  aminoglycoside phosphotransferase  27.73 
 
 
380 aa  73.6  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276157  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0625  hypothetical protein  30.19 
 
 
345 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2057  aminoglycoside phosphotransferase  29.36 
 
 
378 aa  63.2  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2011  aminoglycoside phosphotransferase  29.36 
 
 
378 aa  63.2  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1992  hypothetical protein  28.75 
 
 
378 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.616022  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0876  protein of unknown function DUF227  29.48 
 
 
332 aa  57  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.620129  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2241  hypothetical protein  26.63 
 
 
349 aa  55.5  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.235594  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4018  hypothetical protein  27.35 
 
 
372 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.41342  normal  0.763019 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2603  aminoglycoside phosphotransferase  32.1 
 
 
367 aa  53.9  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000127207  hitchhiker  0.00111486 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1766  hypothetical protein  25.44 
 
 
384 aa  52.8  0.000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00135853  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02343  hypothetical protein  34.72 
 
 
364 aa  48.9  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.445961  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2018  hypothetical protein  21.56 
 
 
398 aa  48.1  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.135716  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1598  hypothetical protein  30.6 
 
 
260 aa  47  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.651223  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2096  hypothetical protein  25.35 
 
 
340 aa  45.4  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0262717  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1820  aminoglycoside phosphotransferase  37.33 
 
 
352 aa  44.7  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5274  aminoglycoside phosphotransferase  36.59 
 
 
343 aa  42.7  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2364  aminoglycoside phosphotransferase  34.25 
 
 
261 aa  42.7  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.488578 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0329  hypothetical protein  25.86 
 
 
360 aa  42.7  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0029643  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>