40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0876 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0876  protein of unknown function DUF227  100 
 
 
332 aa  677    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.620129  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1286  hypothetical protein  50.33 
 
 
320 aa  324  1e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00430498  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2241  hypothetical protein  50.15 
 
 
349 aa  320  3e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.235594  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2384  hypothetical protein  45.99 
 
 
335 aa  305  9.000000000000001e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.728607 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001235  hypothetical protein  49.67 
 
 
332 aa  302  5.000000000000001e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.676733  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05102  hypothetical protein  47.7 
 
 
328 aa  293  3e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2096  hypothetical protein  44.03 
 
 
340 aa  288  1e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0262717  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4225  hypothetical protein  46.15 
 
 
333 aa  284  2.0000000000000002e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.265608 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2009  hypothetical protein  42.13 
 
 
359 aa  273  3e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.741438  normal  0.129044 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3627  hypothetical protein  42.22 
 
 
329 aa  270  2e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3439  hypothetical protein  45.34 
 
 
339 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02343  hypothetical protein  41.18 
 
 
364 aa  245  9e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.445961  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50054  predicted protein  28.23 
 
 
352 aa  88.2  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.702034  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03770  conserved hypothetical protein  24.09 
 
 
414 aa  68.9  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2016  aminoglycoside phosphotransferase  29.6 
 
 
367 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.800046 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2246  hypothetical protein  28.72 
 
 
346 aa  60.8  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4330  hypothetical protein  29.48 
 
 
350 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2585  protein of unknown function DUF227  26.17 
 
 
346 aa  57.4  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000429556  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2220  hypothetical protein  27.78 
 
 
362 aa  54.3  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2228  aminoglycoside phosphotransferase  24.9 
 
 
380 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276157  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3102  aminoglycoside phosphotransferase  35.87 
 
 
365 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0329  hypothetical protein  27.95 
 
 
360 aa  51.2  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0029643  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0979  hypothetical protein  25.62 
 
 
358 aa  50.8  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1992  hypothetical protein  28.22 
 
 
378 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.616022  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0367  aminoglycoside phosphotransferase  41.54 
 
 
362 aa  48.9  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2549  hypothetical protein  30.06 
 
 
667 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.616235 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2557  aminoglycoside phosphotransferase  30 
 
 
667 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.898182  normal  0.739218 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2512  aminoglycoside phosphotransferase  30 
 
 
667 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2057  aminoglycoside phosphotransferase  28.22 
 
 
378 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2011  aminoglycoside phosphotransferase  28.22 
 
 
378 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4117  hypothetical protein  25.29 
 
 
382 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3433  aminoglycoside phosphotransferase  36.23 
 
 
359 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0252368  normal  0.972006 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1766  hypothetical protein  28.44 
 
 
384 aa  45.8  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00135853  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2523  aminoglycoside phosphotransferase  31.17 
 
 
359 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238738  normal  0.0936723 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4223  hypothetical protein  29.94 
 
 
356 aa  44.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2531  aminoglycoside phosphotransferase  31.17 
 
 
359 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  0.606959 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2486  aminoglycoside phosphotransferase  31.17 
 
 
359 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3155  hypothetical protein  32.71 
 
 
678 aa  43.9  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.736727  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2429  hypothetical protein  28.57 
 
 
338 aa  42.4  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0125007  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3374  aminoglycoside phosphotransferase  37.31 
 
 
661 aa  42.4  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.116531 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>