42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0979 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0979  hypothetical protein  100 
 
 
358 aa  742    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0367  aminoglycoside phosphotransferase  43.66 
 
 
362 aa  281  1e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2220  hypothetical protein  37.68 
 
 
362 aa  209  6e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2585  protein of unknown function DUF227  34.94 
 
 
346 aa  184  3e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000429556  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2486  aminoglycoside phosphotransferase  34.63 
 
 
359 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2531  aminoglycoside phosphotransferase  34.63 
 
 
359 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  0.606959 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2523  aminoglycoside phosphotransferase  34.35 
 
 
359 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238738  normal  0.0936723 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3837  protein of unknown function DUF227  31.62 
 
 
349 aa  165  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2549  hypothetical protein  34.25 
 
 
667 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.616235 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2512  aminoglycoside phosphotransferase  34.25 
 
 
667 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2557  aminoglycoside phosphotransferase  34.25 
 
 
667 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.898182  normal  0.739218 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3155  hypothetical protein  32.88 
 
 
678 aa  159  7e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.736727  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2246  hypothetical protein  34.64 
 
 
346 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3374  aminoglycoside phosphotransferase  33.33 
 
 
661 aa  151  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.116531 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3433  aminoglycoside phosphotransferase  31.23 
 
 
359 aa  149  6e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0252368  normal  0.972006 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3102  aminoglycoside phosphotransferase  31.05 
 
 
365 aa  145  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2016  aminoglycoside phosphotransferase  30.45 
 
 
367 aa  110  5e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.800046 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4330  hypothetical protein  29.61 
 
 
350 aa  103  7e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3833  hypothetical protein  28.76 
 
 
357 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3907  hypothetical protein  28.76 
 
 
357 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.414972  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3819  hypothetical protein  28.76 
 
 
357 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.323634 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1766  hypothetical protein  25.76 
 
 
384 aa  81.3  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00135853  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0625  hypothetical protein  27.97 
 
 
345 aa  80.1  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0329  hypothetical protein  33.62 
 
 
360 aa  75.9  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0029643  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4018  hypothetical protein  27.04 
 
 
372 aa  72.8  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.41342  normal  0.763019 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2228  aminoglycoside phosphotransferase  27.56 
 
 
380 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276157  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4223  hypothetical protein  28.77 
 
 
356 aa  70.1  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1992  hypothetical protein  26.32 
 
 
378 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.616022  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2011  aminoglycoside phosphotransferase  26.32 
 
 
378 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2057  aminoglycoside phosphotransferase  26.32 
 
 
378 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4117  hypothetical protein  27.11 
 
 
382 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4784  hypothetical protein  41.84 
 
 
123 aa  60.8  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.461111  normal  0.569972 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2429  hypothetical protein  31.12 
 
 
338 aa  57  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0125007  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2018  hypothetical protein  26.73 
 
 
398 aa  57.4  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.135716  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0876  protein of unknown function DUF227  26.17 
 
 
332 aa  50.1  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.620129  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2603  aminoglycoside phosphotransferase  29.3 
 
 
367 aa  49.7  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000127207  hitchhiker  0.00111486 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1286  hypothetical protein  25.27 
 
 
320 aa  49.3  0.00009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00430498  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1505  aminoglycoside phosphotransferase  29.94 
 
 
357 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1505  aminoglycoside phosphotransferase  29.94 
 
 
358 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.290971  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1528  aminoglycoside phosphotransferase  29.94 
 
 
358 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1820  aminoglycoside phosphotransferase  33.73 
 
 
352 aa  43.9  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1598  hypothetical protein  34.62 
 
 
260 aa  43.1  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.651223  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>