42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2228 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_2228  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
380 aa  747    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276157  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4117  hypothetical protein  78.33 
 
 
382 aa  580  1e-164  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1992  hypothetical protein  66.49 
 
 
378 aa  484  1e-136  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.616022  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2011  aminoglycoside phosphotransferase  66.49 
 
 
378 aa  482  1e-135  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2057  aminoglycoside phosphotransferase  66.49 
 
 
378 aa  482  1e-135  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1766  hypothetical protein  32.66 
 
 
384 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00135853  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2018  hypothetical protein  31.28 
 
 
398 aa  138  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.135716  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3819  hypothetical protein  34.85 
 
 
357 aa  124  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.323634 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3907  hypothetical protein  34.85 
 
 
357 aa  124  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.414972  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3833  hypothetical protein  34.85 
 
 
357 aa  124  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2429  hypothetical protein  34.62 
 
 
338 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0125007  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4223  hypothetical protein  34.18 
 
 
356 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4018  hypothetical protein  30.24 
 
 
372 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.41342  normal  0.763019 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0303  hypothetical protein  27.16 
 
 
360 aa  97.1  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.571715  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0329  hypothetical protein  30.6 
 
 
360 aa  96.3  9e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0029643  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2585  protein of unknown function DUF227  28.81 
 
 
346 aa  96.3  9e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000429556  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2557  aminoglycoside phosphotransferase  27.42 
 
 
667 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.898182  normal  0.739218 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2512  aminoglycoside phosphotransferase  27.42 
 
 
667 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3155  hypothetical protein  27.13 
 
 
678 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.736727  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0625  hypothetical protein  28.62 
 
 
345 aa  84  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2549  hypothetical protein  27.42 
 
 
667 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.616235 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3102  aminoglycoside phosphotransferase  30.27 
 
 
365 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0367  aminoglycoside phosphotransferase  25.76 
 
 
362 aa  81.3  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2531  aminoglycoside phosphotransferase  26.25 
 
 
359 aa  79.7  0.00000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  0.606959 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2486  aminoglycoside phosphotransferase  26.25 
 
 
359 aa  79.7  0.00000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2523  aminoglycoside phosphotransferase  25.96 
 
 
359 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238738  normal  0.0936723 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1598  hypothetical protein  39.55 
 
 
260 aa  77.8  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.651223  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3433  aminoglycoside phosphotransferase  28.61 
 
 
359 aa  73.6  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0252368  normal  0.972006 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4330  hypothetical protein  27.73 
 
 
350 aa  73.6  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3837  protein of unknown function DUF227  26.49 
 
 
349 aa  73.6  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3374  aminoglycoside phosphotransferase  27.83 
 
 
661 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.116531 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2016  aminoglycoside phosphotransferase  26.99 
 
 
367 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.800046 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0979  hypothetical protein  27.56 
 
 
358 aa  70.5  0.00000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2246  hypothetical protein  30.26 
 
 
346 aa  64.3  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2220  hypothetical protein  26.67 
 
 
362 aa  58.2  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0876  protein of unknown function DUF227  24.9 
 
 
332 aa  51.6  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.620129  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1286  hypothetical protein  25.12 
 
 
320 aa  49.7  0.00009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00430498  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4225  hypothetical protein  25.89 
 
 
333 aa  48.1  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.265608 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1003  aminoglycoside phosphotransferase  30.36 
 
 
291 aa  43.9  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0641  aminoglycoside phosphotransferase  47.5 
 
 
265 aa  43.9  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.94891 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2384  hypothetical protein  20.92 
 
 
335 aa  43.1  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.728607 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0894  aminoglycoside phosphotransferase  48.84 
 
 
459 aa  43.1  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.184458  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>