89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1003 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1003  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 291 aa  595  1e-169  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2137  aminoglycoside phosphotransferase family protein  50.53 
 
 		 293 aa  301  8.000000000000001e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2889  aminoglycoside phosphotransferase  50 
 
 		 292 aa  293  2e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.181023  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2863  phosphotransferase family protein  48.77 
 
 		 292 aa  292  4e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3100  aminoglycoside phosphotransferase family protein  50 
 
 		 292 aa  290  1e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0596  hypothetical protein  48.25 
 
 		 293 aa  290  2e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4097  aminoglycoside phosphotransferase  51.24 
 
 		 300 aa  289  3e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.402369  normal  0.57426 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4507  aminoglycoside phosphotransferase  50.69 
 
 		 305 aa  288  5.0000000000000004e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0298269 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1967  aminoglycoside phosphotransferase  51.74 
 
 		 299 aa  288  6e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15745  normal  0.449635 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3114  aminoglycoside phosphotransferase family protein  47.72 
 
 		 292 aa  287  2e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2894  aminoglycoside phosphotransferase family protein  48.07 
 
 		 292 aa  286  2e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.5849  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3111  aminoglycoside phosphotransferase family protein  48.07 
 
 		 292 aa  286  2e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2694  aminoglycoside phosphotransferase  47.02 
 
 		 310 aa  281  1e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4212  aminoglycoside phosphotransferase  47.06 
 
 		 302 aa  271  6e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.429799  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0116  hypothetical protein  49.83 
 
 		 534 aa  268  1e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2351  aminoglycoside phosphotransferase  47.93 
 
 		 332 aa  267  1e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4227  aminoglycoside phosphotransferase  44.98 
 
 		 303 aa  241  7e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0563454  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5350  aminoglycoside phosphotransferase  42.62 
 
 		 303 aa  239  5e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0776813  normal  0.0441787 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4220  aminoglycoside phosphotransferase  45.69 
 
 		 315 aa  229  3e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.24311 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5432  aminoglycoside phosphotransferase  45.98 
 
 		 299 aa  214  9e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4129  aminoglycoside phosphotransferase  46.69 
 
 		 339 aa  205  7e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.753306  normal  0.346085 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13254  transferase  38.41 
 
 		 474 aa  191  1e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.323872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2781  aminoglycoside phosphotransferase  39.51 
 
 		 299 aa  191  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.907134  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4721  aminoglycoside phosphotransferase  36.64 
 
 		 293 aa  178  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14460  predicted aminoglycoside phosphotransferase  38.95 
 
 		 303 aa  176  3e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.25682  normal  0.25424 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5725  aminoglycoside phosphotransferase  39.79 
 
 		 287 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0907707  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1948  aminoglycoside phosphotransferase  36.36 
 
 		 293 aa  150  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.013285 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3260  hypothetical protein  33.99 
 
 		 300 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913929  normal  0.957534 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0041  aminoglycoside phosphotransferase  35.88 
 
 		 299 aa  142  8e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0072  aminoglycoside phosphotransferase  36.54 
 
 		 324 aa  139  6e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00601594  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4063  aminoglycoside phosphotransferase  31.42 
 
 		 297 aa  138  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32149  normal  0.620997 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1715  aminoglycoside phosphotransferase  34.91 
 
 		 298 aa  138  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.39264 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3611  aminoglycoside phosphotransferase  35.9 
 
 		 294 aa  137  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5153  aminoglycoside phosphotransferase  31.06 
 
 		 302 aa  131  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.325444  normal  0.0433393 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1996  aminoglycoside phosphotransferase  35.88 
 
 		 301 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  0.365925 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16270  predicted aminoglycoside phosphotransferase  32.09 
 
 		 329 aa  122  9e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.544506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0209  aminoglycoside phosphotransferase  36.23 
 
 		 303 aa  121  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1902  aminoglycoside phosphotransferase  33.22 
 
 		 323 aa  120  3e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3990  aminoglycoside phosphotransferase  30.17 
 
 		 299 aa  119  6e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0393  aminoglycoside phosphotransferase  36.75 
 
 		 301 aa  117  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.948995  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1324  aminoglycoside phosphotransferase  34.56 
 
 		 305 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.547927  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2104  aminoglycoside phosphotransferase  38.15 
 
 		 305 aa  109  6e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.714313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2507  hypothetical protein  34.1 
 
 		 213 aa  91.7  1e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3344  aminoglycoside phosphotransferase  27.43 
 
 		 296 aa  85.9  7e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0459569 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2624  aminoglycoside phosphotransferase  30.04 
 
 		 319 aa  80.1  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000546322  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4473  aminoglycoside phosphotransferase  30.92 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2713  NB-ARC domain protein  40.58 
 
 		 838 aa  60.1  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000220271  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1900  kanamycin kinase (aminoglycoside phosphotransferase, gentamicin resistance protein)  23.05 
 
 		 293 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2806  aminoglycoside phosphotransferase  23.25 
 
 		 479 aa  57  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0356715  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2761  aminoglycoside phosphotransferase  23.25 
 
 		 479 aa  57  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1585  6'-aminoglycoside N-acetyltransferase/2''-aminoglycoside phosphotransferase  23.25 
 
 		 479 aa  57  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.616804  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1266  aminoglycoside phophotransferase  24.12 
 
 		 300 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2179  6'-aminoglycoside N-acetyltransferase/2''-aminoglycoside phosphotransferase, putative  22.3 
 
 		 293 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.174828  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4256  aminoglycoside phosphotransferase  28.97 
 
 		 273 aa  53.9  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1292  aminoglycoside phophotransferase family protein  23.74 
 
 		 300 aa  52.8  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1264  aminoglycoside phophotransferase  23.74 
 
 		 300 aa  52.8  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.332261  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1468  aminoglycoside phophotransferase family protein  23.74 
 
 		 300 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1397  aminoglycoside phophotransferase family protein  23.74 
 
 		 300 aa  52.8  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1431  aminoglycoside phophotransferase family protein  25.75 
 
 		 300 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20250  predicted aminoglycoside phosphotransferase  27.34 
 
 		 315 aa  52.4  0.000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.227699  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1911  aminoglycoside phophotransferase family protein  25.11 
 
 		 293 aa  52  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0214215  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3134  aminoglycoside phosphotransferase family protein  37.7 
 
 		 64 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.138324  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4461  aminoglycoside phosphotransferase  27.35 
 
 		 298 aa  52  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0845  phosphotransferase  54.69 
 
 		 74 aa  51.6  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.515192  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0783  aminoglycoside phosphotransferase  33.11 
 
 		 306 aa  50.4  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.277231  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1987  hypothetical protein  21.53 
 
 		 317 aa  49.3  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.908113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1537  aminoglycoside phophotransferase family protein  23.33 
 
 		 300 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2900  aminoglycoside phosphotransferase  27.91 
 
 		 386 aa  48.5  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.123406  normal  0.0517924 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2343  aminoglycoside phosphotransferase  25.37 
 
 		 294 aa  48.5  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.523631  normal  0.421232 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3085  aminoglycoside phosphotransferase  43.28 
 
 		 309 aa  48.9  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.472078  normal  0.971754 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0713  aminoglycoside phosphotransferase  27.19 
 
 		 455 aa  47.8  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1301  aminoglycoside phosphotransferase  24.03 
 
 		 302 aa  47.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.422035  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3066  hypothetical protein  23.76 
 
 		 308 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0858  homoserine kinase  31.88 
 
 		 317 aa  45.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000127482  hitchhiker  0.000000000719161 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0167  aminoglycoside phosphotransferase  32.5 
 
 		 272 aa  44.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0770895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1797  aminoglycoside phosphotransferase  38.1 
 
 		 384 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0217857  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1805  aminoglycoside phosphotransferase  38.1 
 
 		 389 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0159  aminoglycoside 3'-phosphotransferase  27.37 
 
 		 271 aa  44.3  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.193227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2228  aminoglycoside phosphotransferase  30.36 
 
 		 380 aa  43.9  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276157  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22410  predicted aminoglycoside phosphotransferase  25.26 
 
 		 298 aa  43.5  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0662626  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0894  aminoglycoside phosphotransferase  34.48 
 
 		 459 aa  43.5  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.184458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1772  aminoglycoside phosphotransferase  23.08 
 
 		 303 aa  43.1  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0779  aminoglycoside phosphotransferase  28.51 
 
 		 284 aa  43.5  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.366594 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4758  aminoglycoside phosphotransferase  34.29 
 
 		 336 aa  43.1  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00571232  hitchhiker  0.000730899 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2481  aminoglycoside phosphotransferase  36.9 
 
 		 382 aa  42.7  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.469146  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2830  aminoglycoside phosphotransferase  26.58 
 
 		 308 aa  42.7  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2852  aminoglycoside phosphotransferase  23.88 
 
 		 312 aa  42.4  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00333465  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1844  aminoglycoside phosphotransferase  36.9 
 
 		 392 aa  42.4  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.812957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27590  predicted aminoglycoside phosphotransferase  27.01 
 
 		 505 aa  42.4  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>