28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_4225 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_4225  hypothetical protein  100 
 
 
333 aa  700    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.265608 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2241  hypothetical protein  46.24 
 
 
349 aa  316  4e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.235594  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2384  hypothetical protein  45.26 
 
 
335 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.728607 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0876  protein of unknown function DUF227  46.96 
 
 
332 aa  281  8.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.620129  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2096  hypothetical protein  44.62 
 
 
340 aa  280  3e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0262717  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2009  hypothetical protein  41.79 
 
 
359 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.741438  normal  0.129044 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3439  hypothetical protein  42.11 
 
 
339 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1286  hypothetical protein  39.56 
 
 
320 aa  246  4e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00430498  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001235  hypothetical protein  40.18 
 
 
332 aa  244  1.9999999999999999e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.676733  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3627  hypothetical protein  41.36 
 
 
329 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05102  hypothetical protein  37.96 
 
 
328 aa  226  5.0000000000000005e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02343  hypothetical protein  38.26 
 
 
364 aa  221  9.999999999999999e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.445961  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03770  conserved hypothetical protein  26.57 
 
 
414 aa  70.9  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50054  predicted protein  27.36 
 
 
352 aa  68.9  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.702034  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2220  hypothetical protein  21.83 
 
 
362 aa  52.4  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0625  hypothetical protein  29.77 
 
 
345 aa  52  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2246  hypothetical protein  27.69 
 
 
346 aa  52  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3155  hypothetical protein  25.26 
 
 
678 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.736727  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2228  aminoglycoside phosphotransferase  25.89 
 
 
380 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276157  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3374  aminoglycoside phosphotransferase  27.96 
 
 
661 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.116531 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2549  hypothetical protein  25.23 
 
 
667 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.616235 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2557  aminoglycoside phosphotransferase  25.47 
 
 
667 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.898182  normal  0.739218 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2512  aminoglycoside phosphotransferase  25.47 
 
 
667 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2585  protein of unknown function DUF227  37.88 
 
 
346 aa  44.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000429556  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4117  hypothetical protein  23.79 
 
 
382 aa  44.3  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3433  aminoglycoside phosphotransferase  37.14 
 
 
359 aa  42.7  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0252368  normal  0.972006 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2057  aminoglycoside phosphotransferase  24.52 
 
 
378 aa  42.7  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2011  aminoglycoside phosphotransferase  24.52 
 
 
378 aa  42.7  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>