21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001235 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001235  hypothetical protein  100 
 
 		 332 aa  701    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.676733  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05102  hypothetical protein  73.33 
 
 		 328 aa  497  1e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1286  hypothetical protein  59.41 
 
 		 320 aa  383  1e-105  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00430498  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3627  hypothetical protein  50.47 
 
 		 329 aa  321  9.000000000000001e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0876  protein of unknown function DUF227  49.67 
 
 		 332 aa  302  6.000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.620129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2096  hypothetical protein  42.32 
 
 		 340 aa  281  1e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0262717  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2241  hypothetical protein  43.45 
 
 		 349 aa  278  1e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.235594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2384  hypothetical protein  41.49 
 
 		 335 aa  271  1e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.728607 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3439  hypothetical protein  43.23 
 
 		 339 aa  256  5e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4225  hypothetical protein  40.18 
 
 		 333 aa  244  1.9999999999999999e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.265608 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2009  hypothetical protein  40.87 
 
 		 359 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.741438  normal  0.129044 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02343  hypothetical protein  36.39 
 
 		 364 aa  226  5.0000000000000005e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.445961  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50054  predicted protein  29.02 
 
 		 352 aa  96.3  7e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.702034  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03770  conserved hypothetical protein  23.53 
 
 		 414 aa  58.9  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0367  aminoglycoside phosphotransferase  23.65 
 
 		 362 aa  51.2  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2523  aminoglycoside phosphotransferase  22.52 
 
 		 359 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238738  normal  0.0936723 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2531  aminoglycoside phosphotransferase  22.07 
 
 		 359 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  0.606959 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2486  aminoglycoside phosphotransferase  22.07 
 
 		 359 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2220  hypothetical protein  23.21 
 
 		 362 aa  51.6  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3433  aminoglycoside phosphotransferase  34.85 
 
 		 359 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0252368  normal  0.972006 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3102  aminoglycoside phosphotransferase  34.85 
 
 		 365 aa  47  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>