55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0367 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_0367  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
362 aa  755    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0979  hypothetical protein  43.66 
 
 
358 aa  281  1e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2512  aminoglycoside phosphotransferase  39.95 
 
 
667 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2549  hypothetical protein  39.95 
 
 
667 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.616235 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2557  aminoglycoside phosphotransferase  39.95 
 
 
667 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.898182  normal  0.739218 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3155  hypothetical protein  38.57 
 
 
678 aa  227  3e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.736727  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3374  aminoglycoside phosphotransferase  38.75 
 
 
661 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.116531 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2220  hypothetical protein  35.8 
 
 
362 aa  208  1e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2246  hypothetical protein  35.45 
 
 
346 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2486  aminoglycoside phosphotransferase  32.66 
 
 
359 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2531  aminoglycoside phosphotransferase  32.66 
 
 
359 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  0.606959 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2523  aminoglycoside phosphotransferase  32.66 
 
 
359 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238738  normal  0.0936723 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2585  protein of unknown function DUF227  29.97 
 
 
346 aa  162  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000429556  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3837  protein of unknown function DUF227  30.68 
 
 
349 aa  158  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3102  aminoglycoside phosphotransferase  30.64 
 
 
365 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2016  aminoglycoside phosphotransferase  31.09 
 
 
367 aa  139  6e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.800046 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3433  aminoglycoside phosphotransferase  29.25 
 
 
359 aa  135  8e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0252368  normal  0.972006 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4330  hypothetical protein  29.39 
 
 
350 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0625  hypothetical protein  29.65 
 
 
345 aa  100  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4117  hypothetical protein  31.14 
 
 
382 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2228  aminoglycoside phosphotransferase  25.76 
 
 
380 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276157  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3907  hypothetical protein  28.09 
 
 
357 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.414972  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3819  hypothetical protein  28.09 
 
 
357 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.323634 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3833  hypothetical protein  28.09 
 
 
357 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1766  hypothetical protein  26.11 
 
 
384 aa  77.8  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00135853  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1286  hypothetical protein  28.32 
 
 
320 aa  76.6  0.0000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00430498  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4223  hypothetical protein  27.96 
 
 
356 aa  73.6  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1992  hypothetical protein  27.05 
 
 
378 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.616022  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2057  aminoglycoside phosphotransferase  27.4 
 
 
378 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2011  aminoglycoside phosphotransferase  27.4 
 
 
378 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2429  hypothetical protein  27.67 
 
 
338 aa  66.6  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0125007  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4018  hypothetical protein  26.35 
 
 
372 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.41342  normal  0.763019 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0329  hypothetical protein  29.44 
 
 
360 aa  58.9  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0029643  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2018  hypothetical protein  25.61 
 
 
398 aa  58.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.135716  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001235  hypothetical protein  23.65 
 
 
332 aa  51.2  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.676733  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05102  hypothetical protein  25.78 
 
 
328 aa  50.4  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0303  hypothetical protein  25.55 
 
 
360 aa  49.3  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.571715  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0876  protein of unknown function DUF227  41.54 
 
 
332 aa  48.9  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.620129  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01062  aminoglycoside phosphotransferase  27.46 
 
 
352 aa  48.9  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.533136  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4784  hypothetical protein  37.5 
 
 
123 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.461111  normal  0.569972 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2384  hypothetical protein  22.53 
 
 
335 aa  47.8  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.728607 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4543  aminoglycoside phosphotransferase  30.47 
 
 
359 aa  47  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2241  hypothetical protein  25.63 
 
 
349 aa  47  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.235594  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1035  aminoglycoside phosphotransferase  27.34 
 
 
353 aa  46.2  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261257  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4338  aminoglycoside phosphotransferase  33.09 
 
 
343 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2068  aminoglycoside phosphotransferase  28.46 
 
 
344 aa  44.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5019  aminoglycoside phosphotransferase  33.09 
 
 
343 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5841  aminoglycoside phosphotransferase  33.09 
 
 
343 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0634  aminoglycoside phosphotransferase  29.06 
 
 
370 aa  44.3  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2903  aminoglycoside phosphotransferase  27.66 
 
 
353 aa  44.3  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1505  aminoglycoside phosphotransferase  26.15 
 
 
357 aa  43.5  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5274  aminoglycoside phosphotransferase  29.29 
 
 
343 aa  43.5  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5078  aminoglycoside phosphotransferase  31.39 
 
 
357 aa  43.1  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114652  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02343  hypothetical protein  23.95 
 
 
364 aa  43.1  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.445961  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0222  aminoglycoside phosphotransferase  27.78 
 
 
355 aa  43.1  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.193801  normal  0.0244768 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>