26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05102 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05102  hypothetical protein  100 
 
 
328 aa  686    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001235  hypothetical protein  73.33 
 
 
332 aa  497  1e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.676733  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1286  hypothetical protein  60.13 
 
 
320 aa  384  1e-105  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00430498  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3627  hypothetical protein  49.85 
 
 
329 aa  319  5e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0876  protein of unknown function DUF227  47.7 
 
 
332 aa  293  3e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.620129  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2096  hypothetical protein  41.64 
 
 
340 aa  275  5e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0262717  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3439  hypothetical protein  44.52 
 
 
339 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2241  hypothetical protein  41.72 
 
 
349 aa  264  1e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.235594  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2384  hypothetical protein  40.55 
 
 
335 aa  255  9e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.728607 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2009  hypothetical protein  38.14 
 
 
359 aa  241  1e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.741438  normal  0.129044 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02343  hypothetical protein  38.69 
 
 
364 aa  227  3e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.445961  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4225  hypothetical protein  37.96 
 
 
333 aa  226  5.0000000000000005e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.265608 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50054  predicted protein  28.91 
 
 
352 aa  94.4  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.702034  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03770  conserved hypothetical protein  24.59 
 
 
414 aa  59.3  0.00000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2585  protein of unknown function DUF227  25.7 
 
 
346 aa  55.8  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000429556  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0367  aminoglycoside phosphotransferase  25.78 
 
 
362 aa  50.4  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3102  aminoglycoside phosphotransferase  35.56 
 
 
365 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2523  aminoglycoside phosphotransferase  34.78 
 
 
359 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238738  normal  0.0936723 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2531  aminoglycoside phosphotransferase  34.78 
 
 
359 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  0.606959 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2486  aminoglycoside phosphotransferase  34.78 
 
 
359 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2220  hypothetical protein  22.81 
 
 
362 aa  47  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3433  aminoglycoside phosphotransferase  32.08 
 
 
359 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0252368  normal  0.972006 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2057  aminoglycoside phosphotransferase  24.1 
 
 
378 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2011  aminoglycoside phosphotransferase  24.1 
 
 
378 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27745  predicted protein  30.23 
 
 
850 aa  43.9  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0531336  normal  0.0916704 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1992  hypothetical protein  23.08 
 
 
378 aa  42.7  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.616022  normal  0.589309 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>