90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3374 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2512  aminoglycoside phosphotransferase  69.51 
 
 
667 aa  953    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2557  aminoglycoside phosphotransferase  69.51 
 
 
667 aa  953    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.898182  normal  0.739218 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3374  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
661 aa  1337    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.116531 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3155  hypothetical protein  77.51 
 
 
678 aa  1054    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.736727  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2549  hypothetical protein  69.66 
 
 
667 aa  954    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.616235 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0367  aminoglycoside phosphotransferase  38.75 
 
 
362 aa  226  1e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2585  protein of unknown function DUF227  33.43 
 
 
346 aa  184  5.0000000000000004e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000429556  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2246  hypothetical protein  34.96 
 
 
346 aa  177  6e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8526  hypothetical protein  37.54 
 
 
322 aa  173  7.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.434149 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2220  hypothetical protein  31.83 
 
 
362 aa  173  7.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0979  hypothetical protein  33.33 
 
 
358 aa  164  6e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2531  aminoglycoside phosphotransferase  34.25 
 
 
359 aa  158  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  0.606959 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2486  aminoglycoside phosphotransferase  34.25 
 
 
359 aa  158  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2523  aminoglycoside phosphotransferase  33.43 
 
 
359 aa  154  4e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238738  normal  0.0936723 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3102  aminoglycoside phosphotransferase  33.52 
 
 
365 aa  137  5e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3837  protein of unknown function DUF227  31.41 
 
 
349 aa  137  8e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3433  aminoglycoside phosphotransferase  32.28 
 
 
359 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0252368  normal  0.972006 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2016  aminoglycoside phosphotransferase  28.93 
 
 
367 aa  88.2  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.800046 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4117  hypothetical protein  30.33 
 
 
382 aa  85.1  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4330  hypothetical protein  29.9 
 
 
350 aa  81.3  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2228  aminoglycoside phosphotransferase  27.76 
 
 
380 aa  79.3  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276157  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3077  hypothetical protein  26.98 
 
 
344 aa  73.2  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.257575  normal  0.207932 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0625  hypothetical protein  28.21 
 
 
345 aa  67.8  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1766  hypothetical protein  26.36 
 
 
384 aa  66.6  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00135853  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5522  hypothetical protein  25.82 
 
 
345 aa  64.3  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4018  hypothetical protein  26.01 
 
 
372 aa  62  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.41342  normal  0.763019 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2011  aminoglycoside phosphotransferase  26.53 
 
 
378 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2057  aminoglycoside phosphotransferase  26.53 
 
 
378 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1992  hypothetical protein  25.85 
 
 
378 aa  58.9  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.616022  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3833  hypothetical protein  28.97 
 
 
357 aa  58.5  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3907  hypothetical protein  28.97 
 
 
357 aa  58.5  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.414972  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3819  hypothetical protein  28.97 
 
 
357 aa  58.5  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.323634 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0329  hypothetical protein  26.74 
 
 
360 aa  55.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0029643  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02343  hypothetical protein  44.93 
 
 
364 aa  55.8  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.445961  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4338  aminoglycoside phosphotransferase  39.13 
 
 
343 aa  53.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4225  hypothetical protein  27.96 
 
 
333 aa  53.9  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.265608 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5841  aminoglycoside phosphotransferase  49.02 
 
 
343 aa  53.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4223  hypothetical protein  28.92 
 
 
356 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5019  aminoglycoside phosphotransferase  49.02 
 
 
343 aa  53.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1859  aminoglycoside phosphotransferase  35.8 
 
 
338 aa  53.1  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5718  aminoglycoside phosphotransferase  46.43 
 
 
343 aa  52  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5078  aminoglycoside phosphotransferase  44.64 
 
 
357 aa  51.2  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114652  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4543  aminoglycoside phosphotransferase  35.87 
 
 
359 aa  50.8  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5274  aminoglycoside phosphotransferase  49.02 
 
 
343 aa  50.4  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2476  aminoglycoside phosphotransferase  48.98 
 
 
338 aa  50.8  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000012289  decreased coverage  0.00166754 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3218  aminoglycoside phosphotransferase  47.06 
 
 
343 aa  50.4  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1805  phosphotransferase enzyme family protein  26.46 
 
 
368 aa  49.7  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113334  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4784  hypothetical protein  39.36 
 
 
123 aa  49.7  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.461111  normal  0.569972 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0437  phosphotransferase enzyme family protein  26.46 
 
 
368 aa  49.7  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1323  phosphotransferase enzyme family protein  26.46 
 
 
368 aa  49.7  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1314  phosphotransferase enzyme family protein  26.46 
 
 
368 aa  49.7  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0714  phosphotransferase enzyme family protein  26.46 
 
 
368 aa  49.7  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.701125  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1460  phosphotransferase family protein  26.46 
 
 
368 aa  49.7  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2429  hypothetical protein  30.12 
 
 
338 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0125007  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1154  phosphotransferase enzyme family protein  26.46 
 
 
368 aa  49.7  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.119269  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3038  aminoglycoside phosphotransferase  46.15 
 
 
343 aa  48.9  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145633  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5046  aminoglycoside phosphotransferase  36.92 
 
 
342 aa  48.9  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.895104 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6405  aminoglycoside phosphotransferase  44.44 
 
 
343 aa  48.1  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3925  aminoglycoside phosphotransferase  29.86 
 
 
355 aa  48.1  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138496  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3673  hypothetical protein  25 
 
 
309 aa  47.8  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3559  aminoglycoside phosphotransferase  31.46 
 
 
355 aa  47.4  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595969  normal  0.25426 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01062  aminoglycoside phosphotransferase  38.1 
 
 
352 aa  47.4  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.533136  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3187  putative tyrosine protein kinase/aminoglycoside phosphotransferase  37.21 
 
 
368 aa  46.6  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3072  aminoglycoside phosphotransferase  33.33 
 
 
388 aa  46.6  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267154  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2629  aminoglycoside phosphotransferase  38.1 
 
 
368 aa  47.4  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0566206  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1368  aminoglycoside phosphotransferase  37.21 
 
 
368 aa  46.2  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544786  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1813  aminoglycoside phosphotransferase  43.48 
 
 
344 aa  46.2  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2658  aminoglycoside phosphotransferase  36.62 
 
 
348 aa  46.2  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6920  aminoglycoside phosphotransferase  42.86 
 
 
348 aa  46.2  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5104  putative tyrosine protein kinase  32.95 
 
 
352 aa  46.2  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2068  aminoglycoside phosphotransferase  46.34 
 
 
344 aa  45.4  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2384  hypothetical protein  23.87 
 
 
335 aa  45.4  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.728607 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4260  aminoglycoside phosphotransferase  27.54 
 
 
314 aa  45.8  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3865  aminoglycoside phosphotransferase  40 
 
 
350 aa  45.4  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0767712  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1910  aminoglycoside phosphotransferase  29.17 
 
 
355 aa  45.8  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107516  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1820  aminoglycoside phosphotransferase  33.68 
 
 
352 aa  45.1  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4558  aminoglycoside phosphotransferase  32.18 
 
 
344 aa  45.1  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00141658 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3467  hypothetical protein  29.21 
 
 
356 aa  45.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1952  hypothetical protein  32.86 
 
 
363 aa  44.7  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.126845 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1084  phosphotransferase enzyme family protein  34.85 
 
 
368 aa  45.1  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2519  aminoglycoside phosphotransferase  31 
 
 
349 aa  44.7  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177703  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3214  aminoglycoside phosphotransferase  30.34 
 
 
355 aa  44.7  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.457678 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40880  hypothetical protein  29.55 
 
 
356 aa  44.7  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2241  hypothetical protein  32.98 
 
 
349 aa  44.7  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.235594  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0835  aminoglycoside phosphotransferase  42.22 
 
 
360 aa  44.3  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.407131  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2514  aminoglycoside phosphotransferase  37.29 
 
 
365 aa  44.3  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0303  hypothetical protein  22.68 
 
 
360 aa  44.3  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.571715  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2810  aminoglycoside phosphotransferase  50 
 
 
336 aa  43.9  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0541387  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1108  aminoglycoside phosphotransferase  34.83 
 
 
362 aa  43.9  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0793428  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3076  aminoglycoside phosphotransferase  34.92 
 
 
361 aa  43.9  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.986116  normal  0.214027 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>