38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0329 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0329  hypothetical protein  100 
 
 		 360 aa  723    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0029643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0303  hypothetical protein  41.64 
 
 		 360 aa  235  9e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.571715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2018  hypothetical protein  30.68 
 
 		 398 aa  149  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.135716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4018  hypothetical protein  30.19 
 
 		 372 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.41342  normal  0.763019 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0625  hypothetical protein  34.47 
 
 		 345 aa  137  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3833  hypothetical protein  30.9 
 
 		 357 aa  126  5e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3819  hypothetical protein  30.9 
 
 		 357 aa  126  5e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.323634 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3907  hypothetical protein  30.9 
 
 		 357 aa  126  5e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.414972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4223  hypothetical protein  29.79 
 
 		 356 aa  117  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2429  hypothetical protein  30.47 
 
 		 338 aa  107  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0125007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1766  hypothetical protein  28.62 
 
 		 384 aa  104  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00135853  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2228  aminoglycoside phosphotransferase  30.6 
 
 		 380 aa  104  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276157  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2523  aminoglycoside phosphotransferase  31.6 
 
 		 359 aa  97.1  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238738  normal  0.0936723 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2486  aminoglycoside phosphotransferase  30.94 
 
 		 359 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2531  aminoglycoside phosphotransferase  30.94 
 
 		 359 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  0.606959 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1598  hypothetical protein  45.83 
 
 		 260 aa  94  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.651223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4117  hypothetical protein  31.7 
 
 		 382 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2057  aminoglycoside phosphotransferase  33.33 
 
 		 378 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2011  aminoglycoside phosphotransferase  33.33 
 
 		 378 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1992  hypothetical protein  32.91 
 
 		 378 aa  86.3  8e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.616022  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2585  protein of unknown function DUF227  28.93 
 
 		 346 aa  85.1  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000429556  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0979  hypothetical protein  33.62 
 
 		 358 aa  82  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3102  aminoglycoside phosphotransferase  28.48 
 
 		 365 aa  79.3  0.00000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3433  aminoglycoside phosphotransferase  28.48 
 
 		 359 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0252368  normal  0.972006 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3155  hypothetical protein  27.69 
 
 		 678 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.736727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3837  protein of unknown function DUF227  25.24 
 
 		 349 aa  65.5  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2549  hypothetical protein  29.34 
 
 		 667 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.616235 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0367  aminoglycoside phosphotransferase  29.44 
 
 		 362 aa  65.1  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2512  aminoglycoside phosphotransferase  29.34 
 
 		 667 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2557  aminoglycoside phosphotransferase  29.34 
 
 		 667 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.898182  normal  0.739218 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0876  protein of unknown function DUF227  27.95 
 
 		 332 aa  58.9  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.620129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3374  aminoglycoside phosphotransferase  26.74 
 
 		 661 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116531 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2246  hypothetical protein  28.04 
 
 		 346 aa  54.3  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2016  aminoglycoside phosphotransferase  29.46 
 
 		 367 aa  52  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800046 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1286  hypothetical protein  23.79 
 
 		 320 aa  50.4  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00430498  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2220  hypothetical protein  27.63 
 
 		 362 aa  49.7  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4330  hypothetical protein  25.63 
 
 		 350 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05102  hypothetical protein  23.47 
 
 		 328 aa  44.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>