41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2016 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_2016  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
367 aa  730    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.800046 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4330  hypothetical protein  79.04 
 
 
350 aa  565  1e-160  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2585  protein of unknown function DUF227  31.78 
 
 
346 aa  140  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000429556  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0367  aminoglycoside phosphotransferase  31.09 
 
 
362 aa  139  6e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2486  aminoglycoside phosphotransferase  32.35 
 
 
359 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2531  aminoglycoside phosphotransferase  32.35 
 
 
359 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  0.606959 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2523  aminoglycoside phosphotransferase  32.08 
 
 
359 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238738  normal  0.0936723 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2220  hypothetical protein  33.77 
 
 
362 aa  129  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3837  protein of unknown function DUF227  28.9 
 
 
349 aa  119  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0979  hypothetical protein  30.45 
 
 
358 aa  110  5e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3102  aminoglycoside phosphotransferase  29.09 
 
 
365 aa  99.8  8e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3433  aminoglycoside phosphotransferase  30.03 
 
 
359 aa  97.1  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0252368  normal  0.972006 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2246  hypothetical protein  29.75 
 
 
346 aa  95.1  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2549  hypothetical protein  30.87 
 
 
667 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.616235 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2557  aminoglycoside phosphotransferase  30.82 
 
 
667 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.898182  normal  0.739218 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0625  hypothetical protein  29.79 
 
 
345 aa  87.4  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2512  aminoglycoside phosphotransferase  30.82 
 
 
667 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3374  aminoglycoside phosphotransferase  28.93 
 
 
661 aa  82.8  0.000000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.116531 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4223  hypothetical protein  28.53 
 
 
356 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4117  hypothetical protein  30.48 
 
 
382 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2429  hypothetical protein  29.76 
 
 
338 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0125007  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3155  hypothetical protein  27.81 
 
 
678 aa  80.5  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.736727  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2228  aminoglycoside phosphotransferase  26.99 
 
 
380 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276157  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4018  hypothetical protein  27.09 
 
 
372 aa  70.1  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.41342  normal  0.763019 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3819  hypothetical protein  28.2 
 
 
357 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.323634 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3907  hypothetical protein  28.2 
 
 
357 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.414972  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3833  hypothetical protein  28.2 
 
 
357 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1766  hypothetical protein  25.9 
 
 
384 aa  65.9  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00135853  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0876  protein of unknown function DUF227  30.37 
 
 
332 aa  63.2  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.620129  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2057  aminoglycoside phosphotransferase  28.9 
 
 
378 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2011  aminoglycoside phosphotransferase  28.9 
 
 
378 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1992  hypothetical protein  28.86 
 
 
378 aa  56.2  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.616022  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2018  hypothetical protein  22.43 
 
 
398 aa  55.8  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.135716  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2603  aminoglycoside phosphotransferase  30.56 
 
 
367 aa  55.8  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000127207  hitchhiker  0.00111486 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2241  hypothetical protein  25.45 
 
 
349 aa  52  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.235594  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1598  hypothetical protein  33.33 
 
 
260 aa  51.2  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.651223  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02343  hypothetical protein  31.88 
 
 
364 aa  48.1  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.445961  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1286  hypothetical protein  23.32 
 
 
320 aa  46.2  0.0009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00430498  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2009  hypothetical protein  25.37 
 
 
359 aa  44.7  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.741438  normal  0.129044 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2384  hypothetical protein  33.33 
 
 
335 aa  44.7  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.728607 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0329  hypothetical protein  29.46 
 
 
360 aa  44.3  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0029643  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>