42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4018 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_4018  hypothetical protein  100 
 
 
372 aa  751    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.41342  normal  0.763019 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4223  hypothetical protein  34.41 
 
 
356 aa  140  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0329  hypothetical protein  30.19 
 
 
360 aa  139  7e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0029643  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3833  hypothetical protein  33.95 
 
 
357 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3819  hypothetical protein  33.95 
 
 
357 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.323634 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3907  hypothetical protein  33.95 
 
 
357 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.414972  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0625  hypothetical protein  32.12 
 
 
345 aa  134  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2429  hypothetical protein  34.25 
 
 
338 aa  133  6e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0125007  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2228  aminoglycoside phosphotransferase  30.24 
 
 
380 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276157  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2018  hypothetical protein  27.66 
 
 
398 aa  109  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.135716  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1992  hypothetical protein  30.93 
 
 
378 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.616022  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2011  aminoglycoside phosphotransferase  30.93 
 
 
378 aa  105  9e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2057  aminoglycoside phosphotransferase  30.93 
 
 
378 aa  105  9e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0303  hypothetical protein  26.63 
 
 
360 aa  103  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.571715  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4117  hypothetical protein  30.89 
 
 
382 aa  103  6e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1766  hypothetical protein  27.79 
 
 
384 aa  98.6  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00135853  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1598  hypothetical protein  44.44 
 
 
260 aa  94.7  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.651223  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3837  protein of unknown function DUF227  27.54 
 
 
349 aa  94.7  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2523  aminoglycoside phosphotransferase  27.52 
 
 
359 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238738  normal  0.0936723 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2486  aminoglycoside phosphotransferase  27.25 
 
 
359 aa  90.9  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2531  aminoglycoside phosphotransferase  27.25 
 
 
359 aa  90.9  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  0.606959 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3102  aminoglycoside phosphotransferase  27.88 
 
 
365 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3433  aminoglycoside phosphotransferase  25.47 
 
 
359 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0252368  normal  0.972006 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0979  hypothetical protein  27.04 
 
 
358 aa  72.8  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2016  aminoglycoside phosphotransferase  27.09 
 
 
367 aa  70.1  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.800046 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0367  aminoglycoside phosphotransferase  26.35 
 
 
362 aa  65.1  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2585  protein of unknown function DUF227  26.46 
 
 
346 aa  62.8  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000429556  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2549  hypothetical protein  28.61 
 
 
667 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.616235 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3155  hypothetical protein  28.09 
 
 
678 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.736727  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2220  hypothetical protein  26.98 
 
 
362 aa  61.2  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2557  aminoglycoside phosphotransferase  29.32 
 
 
667 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.898182  normal  0.739218 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2512  aminoglycoside phosphotransferase  29.32 
 
 
667 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2246  hypothetical protein  28.29 
 
 
346 aa  60.5  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3374  aminoglycoside phosphotransferase  25.74 
 
 
661 aa  60.1  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.116531 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4330  hypothetical protein  27.35 
 
 
350 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3492  ABC-1 domain protein  46.3 
 
 
438 aa  44.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.174728  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3738  ABC-1 domain protein  52.38 
 
 
455 aa  45.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0582734  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2483  aminoglycoside phosphotransferase  38.36 
 
 
323 aa  44.7  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0370489  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1429  hypothetical protein  37.1 
 
 
445 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1411  hypothetical protein  37.1 
 
 
445 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.644627  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1465  hypothetical protein  37.1 
 
 
445 aa  42.7  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3604  aminoglycoside phosphotransferase  32.18 
 
 
331 aa  43.1  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.252193  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>