25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1357 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1357  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
312 aa  608  1e-173  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.447446  normal  0.521982 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2435  hypothetical protein  52.55 
 
 
321 aa  282  5.000000000000001e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2284  aminoglycoside phosphotransferase  38.24 
 
 
319 aa  189  5e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5744  aminoglycoside phosphotransferase  37.83 
 
 
302 aa  186  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.342187  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1104  aminoglycoside phosphotransferase  36.74 
 
 
330 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0139226  hitchhiker  0.00248079 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1890  hypothetical protein  37.3 
 
 
318 aa  168  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.873685  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16000  putative homoserine kinase type II (protein kinase fold)  35.24 
 
 
308 aa  153  4e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.20971 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1615  aminoglycoside phosphotransferase  39.34 
 
 
219 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3843  aminoglycoside phosphotransferase  33.72 
 
 
353 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.451264  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3464  aminoglycoside phosphotransferase  32.11 
 
 
361 aa  110  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.707829  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5466  aminoglycoside phosphotransferase  29.07 
 
 
324 aa  99.4  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4674  hypothetical protein  31.37 
 
 
323 aa  94  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0914933  hitchhiker  0.00723319 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0508  hypothetical protein  29.41 
 
 
275 aa  80.5  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4214  hypothetical protein  30.29 
 
 
190 aa  77.4  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.486277  normal  0.417493 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1771  hypothetical protein  30.32 
 
 
273 aa  76.3  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.384061 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1255  hypothetical protein  31.73 
 
 
283 aa  65.9  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2920  aminoglycoside phosphotransferase  36.73 
 
 
341 aa  54.7  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4013  aminoglycoside phosphotransferase  27.24 
 
 
272 aa  53.1  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163543  hitchhiker  0.00393524 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3155  hypothetical protein  37.62 
 
 
678 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.736727  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1584  aminoglycoside phosphotransferase  27.53 
 
 
373 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1560  aminoglycoside phosphotransferase  27.53 
 
 
373 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2945  aminoglycoside phosphotransferase  24.46 
 
 
263 aa  45.4  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.263618  normal  0.221507 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1530  aminoglycoside phosphotransferase  28.74 
 
 
373 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.984982  normal  0.641522 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1851  aminoglycoside phosphotransferase  33.33 
 
 
267 aa  44.3  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1149  aminoglycoside phosphotransferase  31.02 
 
 
337 aa  42.7  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>