17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0508 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0508  hypothetical protein  100 
 
 		 275 aa  548  1e-155  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4013  aminoglycoside phosphotransferase  35.85 
 
 		 272 aa  129  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163543  hitchhiker  0.00393524 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1357  aminoglycoside phosphotransferase  29.45 
 
 		 312 aa  81.3  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.447446  normal  0.521982 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3464  aminoglycoside phosphotransferase  30.2 
 
 		 361 aa  77  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.707829  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1104  aminoglycoside phosphotransferase  32.37 
 
 		 330 aa  75.1  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0139226  hitchhiker  0.00248079 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1044  hypothetical protein  33.61 
 
 		 183 aa  72.4  0.000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.367529  normal  0.873657 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1890  hypothetical protein  33.78 
 
 		 318 aa  69.3  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.873685  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2224  hypothetical protein  40.45 
 
 		 98 aa  68.9  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.819256 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1043  hypothetical protein  40.45 
 
 		 98 aa  68.9  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.576894  normal  0.815603 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5744  aminoglycoside phosphotransferase  29.76 
 
 		 302 aa  67.4  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.342187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3843  aminoglycoside phosphotransferase  27.35 
 
 		 353 aa  65.9  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.451264  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2435  hypothetical protein  28.04 
 
 		 321 aa  65.9  0.0000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5466  aminoglycoside phosphotransferase  25.83 
 
 		 324 aa  64.7  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2284  aminoglycoside phosphotransferase  31.08 
 
 		 319 aa  62.4  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16000  putative homoserine kinase type II (protein kinase fold)  28.8 
 
 		 308 aa  57.4  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.20971 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1615  aminoglycoside phosphotransferase  31.67 
 
 		 219 aa  50.8  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4214  hypothetical protein  34.23 
 
 		 190 aa  48.1  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.486277  normal  0.417493 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>