18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4013 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4013  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 272 aa  545  1e-154  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163543  hitchhiker  0.00393524 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0508  hypothetical protein  36.36 
 
 		 275 aa  127  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1615  aminoglycoside phosphotransferase  32.31 
 
 		 219 aa  58.2  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1044  hypothetical protein  30.14 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.367529  normal  0.873657 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2224  hypothetical protein  38.57 
 
 		 98 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.819256 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1890  hypothetical protein  26.98 
 
 		 318 aa  54.3  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.873685  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1043  hypothetical protein  38.57 
 
 		 98 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.576894  normal  0.815603 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3464  aminoglycoside phosphotransferase  28.23 
 
 		 361 aa  54.7  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.707829  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1104  aminoglycoside phosphotransferase  28.51 
 
 		 330 aa  53.9  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0139226  hitchhiker  0.00248079 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1357  aminoglycoside phosphotransferase  27.24 
 
 		 312 aa  53.1  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.447446  normal  0.521982 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5744  aminoglycoside phosphotransferase  27.46 
 
 		 302 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.342187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16000  putative homoserine kinase type II (protein kinase fold)  27.7 
 
 		 308 aa  50.8  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.20971 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4674  hypothetical protein  24.01 
 
 		 323 aa  48.9  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0914933  hitchhiker  0.00723319 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2284  aminoglycoside phosphotransferase  33.57 
 
 		 319 aa  48.9  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2435  hypothetical protein  32.73 
 
 		 321 aa  47  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4214  hypothetical protein  34.23 
 
 		 190 aa  46.6  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.486277  normal  0.417493 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3843  aminoglycoside phosphotransferase  42.86 
 
 		 353 aa  43.1  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.451264  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5596  serine/threonine protein kinase  41.86 
 
 		 649 aa  42.4  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>