17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2435 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2435  hypothetical protein  100 
 
 
321 aa  631  1e-180  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1357  aminoglycoside phosphotransferase  52.55 
 
 
312 aa  282  5.000000000000001e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.447446  normal  0.521982 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1104  aminoglycoside phosphotransferase  38.56 
 
 
330 aa  166  4e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0139226  hitchhiker  0.00248079 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2284  aminoglycoside phosphotransferase  39.55 
 
 
319 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1890  hypothetical protein  39.44 
 
 
318 aa  165  9e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.873685  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5744  aminoglycoside phosphotransferase  33.99 
 
 
302 aa  135  8e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.342187  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16000  putative homoserine kinase type II (protein kinase fold)  35.76 
 
 
308 aa  132  5e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.20971 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3843  aminoglycoside phosphotransferase  29.69 
 
 
353 aa  100  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.451264  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3464  aminoglycoside phosphotransferase  30.11 
 
 
361 aa  99.8  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.707829  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1615  aminoglycoside phosphotransferase  37.79 
 
 
219 aa  98.2  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5466  aminoglycoside phosphotransferase  30.98 
 
 
324 aa  94  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4214  hypothetical protein  33.66 
 
 
190 aa  90.5  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.486277  normal  0.417493 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1771  hypothetical protein  34.01 
 
 
273 aa  80.1  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.384061 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4674  hypothetical protein  27.91 
 
 
323 aa  70.5  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0914933  hitchhiker  0.00723319 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0508  hypothetical protein  27.99 
 
 
275 aa  65.9  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1255  hypothetical protein  28.77 
 
 
283 aa  53.5  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4013  aminoglycoside phosphotransferase  32.73 
 
 
272 aa  47  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163543  hitchhiker  0.00393524 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>