16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_16000 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_16000  putative homoserine kinase type II (protein kinase fold)  100 
 
 		 308 aa  602  1.0000000000000001e-171  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.20971 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1890  hypothetical protein  44.73 
 
 		 318 aa  225  8e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.873685  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1357  aminoglycoside phosphotransferase  35.33 
 
 		 312 aa  159  7e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.447446  normal  0.521982 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2284  aminoglycoside phosphotransferase  39.55 
 
 		 319 aa  152  8e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3464  aminoglycoside phosphotransferase  36.69 
 
 		 361 aa  149  6e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.707829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3843  aminoglycoside phosphotransferase  40.32 
 
 		 353 aa  140  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.451264  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5466  aminoglycoside phosphotransferase  35.15 
 
 		 324 aa  138  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2435  hypothetical protein  35.45 
 
 		 321 aa  135  7.000000000000001e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1104  aminoglycoside phosphotransferase  31.58 
 
 		 330 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0139226  hitchhiker  0.00248079 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5744  aminoglycoside phosphotransferase  32.3 
 
 		 302 aa  112  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.342187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4214  hypothetical protein  34.9 
 
 		 190 aa  76.3  0.0000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.486277  normal  0.417493 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1615  aminoglycoside phosphotransferase  36.79 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4674  hypothetical protein  29.6 
 
 		 323 aa  70.9  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0914933  hitchhiker  0.00723319 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0508  hypothetical protein  30.36 
 
 		 275 aa  67.4  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1771  hypothetical protein  28.18 
 
 		 273 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.384061 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4013  aminoglycoside phosphotransferase  28.64 
 
 		 272 aa  55.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163543  hitchhiker  0.00393524 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>