19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4214 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4214  hypothetical protein  100 
 
 		 190 aa  360  7.0000000000000005e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.486277  normal  0.417493 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2284  aminoglycoside phosphotransferase  42.16 
 
 		 319 aa  117  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1890  hypothetical protein  37.06 
 
 		 318 aa  99  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.873685  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1615  aminoglycoside phosphotransferase  37.07 
 
 		 219 aa  94.7  7e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1104  aminoglycoside phosphotransferase  36.19 
 
 		 330 aa  93.6  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0139226  hitchhiker  0.00248079 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2435  hypothetical protein  33.66 
 
 		 321 aa  90.5  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5744  aminoglycoside phosphotransferase  30.54 
 
 		 302 aa  78.2  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.342187  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1357  aminoglycoside phosphotransferase  30.29 
 
 		 312 aa  77.4  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.447446  normal  0.521982 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16000  putative homoserine kinase type II (protein kinase fold)  39.13 
 
 		 308 aa  73.2  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.20971 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4674  hypothetical protein  35 
 
 		 323 aa  60.1  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0914933  hitchhiker  0.00723319 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3464  aminoglycoside phosphotransferase  49.25 
 
 		 361 aa  57.8  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.707829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3843  aminoglycoside phosphotransferase  59.52 
 
 		 353 aa  51.2  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.451264  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5466  aminoglycoside phosphotransferase  27.65 
 
 		 324 aa  51.2  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1771  hypothetical protein  35.9 
 
 		 273 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.384061 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0508  hypothetical protein  34.23 
 
 		 275 aa  48.1  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4013  aminoglycoside phosphotransferase  34.23 
 
 		 272 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163543  hitchhiker  0.00393524 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6301  Mn2+dependent serine/threonine protein kinase  40.35 
 
 		 223 aa  43.9  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0641  aminoglycoside phosphotransferase  35.11 
 
 		 265 aa  42  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.94891 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2489  thiamine kinase  37.93 
 
 		 297 aa  42  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.385558  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>