16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1890 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_1890  hypothetical protein  100 
 
 
318 aa  631  1e-180  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.873685  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16000  putative homoserine kinase type II (protein kinase fold)  44.73 
 
 
308 aa  210  2e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.20971 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1357  aminoglycoside phosphotransferase  37.3 
 
 
312 aa  168  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.447446  normal  0.521982 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2435  hypothetical protein  39.44 
 
 
321 aa  165  8e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5466  aminoglycoside phosphotransferase  37.38 
 
 
324 aa  157  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2284  aminoglycoside phosphotransferase  36.89 
 
 
319 aa  150  3e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1104  aminoglycoside phosphotransferase  32.52 
 
 
330 aa  137  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0139226  hitchhiker  0.00248079 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3843  aminoglycoside phosphotransferase  32.87 
 
 
353 aa  132  5e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.451264  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3464  aminoglycoside phosphotransferase  32.25 
 
 
361 aa  130  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.707829  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5744  aminoglycoside phosphotransferase  33.01 
 
 
302 aa  127  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.342187  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4214  hypothetical protein  37.06 
 
 
190 aa  99  8e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.486277  normal  0.417493 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1615  aminoglycoside phosphotransferase  32.38 
 
 
219 aa  75.9  0.0000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4674  hypothetical protein  29.17 
 
 
323 aa  71.2  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0914933  hitchhiker  0.00723319 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0508  hypothetical protein  33.78 
 
 
275 aa  69.3  0.00000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4013  aminoglycoside phosphotransferase  26.98 
 
 
272 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163543  hitchhiker  0.00393524 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1771  hypothetical protein  31.01 
 
 
273 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.384061 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>