22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2284 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2284  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
319 aa  627  1e-179  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1357  aminoglycoside phosphotransferase  38.24 
 
 
312 aa  192  6e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.447446  normal  0.521982 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5744  aminoglycoside phosphotransferase  40.77 
 
 
302 aa  185  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.342187  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1104  aminoglycoside phosphotransferase  38.41 
 
 
330 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0139226  hitchhiker  0.00248079 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2435  hypothetical protein  39.55 
 
 
321 aa  168  1e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1890  hypothetical protein  37.22 
 
 
318 aa  156  4e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.873685  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1615  aminoglycoside phosphotransferase  43.13 
 
 
219 aa  155  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16000  putative homoserine kinase type II (protein kinase fold)  39.55 
 
 
308 aa  149  6e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.20971 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4214  hypothetical protein  42.16 
 
 
190 aa  120  3.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.486277  normal  0.417493 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3843  aminoglycoside phosphotransferase  35.06 
 
 
353 aa  113  5e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.451264  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3464  aminoglycoside phosphotransferase  34.94 
 
 
361 aa  109  5e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.707829  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1771  hypothetical protein  31.41 
 
 
273 aa  95.5  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.384061 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4674  hypothetical protein  29.07 
 
 
323 aa  82.8  0.000000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0914933  hitchhiker  0.00723319 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5466  aminoglycoside phosphotransferase  31.25 
 
 
324 aa  80.5  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1255  hypothetical protein  31.32 
 
 
283 aa  72  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0508  hypothetical protein  31.2 
 
 
275 aa  68.2  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17900  predicted aminoglycoside phosphotransferase  30.35 
 
 
323 aa  49.7  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.215694  normal  0.505418 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4013  aminoglycoside phosphotransferase  33.57 
 
 
272 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163543  hitchhiker  0.00393524 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0641  aminoglycoside phosphotransferase  30.77 
 
 
265 aa  45.1  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.94891 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1959  aminoglycoside phosphotransferase  35.35 
 
 
331 aa  43.5  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3604  aminoglycoside phosphotransferase  43.14 
 
 
331 aa  42.7  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.252193  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00272  Phosphotransferase enzyme family domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G02880)  23.28 
 
 
364 aa  42.7  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0403488 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>