16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3464 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3464  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 361 aa  697    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.707829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3843  aminoglycoside phosphotransferase  80.74 
 
 		 353 aa  500  1e-140  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.451264  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16000  putative homoserine kinase type II (protein kinase fold)  36.52 
 
 		 308 aa  150  3e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.20971 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5466  aminoglycoside phosphotransferase  33.33 
 
 		 324 aa  142  6e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1890  hypothetical protein  32.25 
 
 		 318 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.873685  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1357  aminoglycoside phosphotransferase  32.39 
 
 		 312 aa  124  4e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.447446  normal  0.521982 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2435  hypothetical protein  30.91 
 
 		 321 aa  108  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2284  aminoglycoside phosphotransferase  34.63 
 
 		 319 aa  106  6e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1104  aminoglycoside phosphotransferase  28.83 
 
 		 330 aa  90.5  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0139226  hitchhiker  0.00248079 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5744  aminoglycoside phosphotransferase  31.17 
 
 		 302 aa  87.8  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.342187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4674  hypothetical protein  28.77 
 
 		 323 aa  86.3  8e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0914933  hitchhiker  0.00723319 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0508  hypothetical protein  30.2 
 
 		 275 aa  76.6  0.0000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4214  hypothetical protein  49.25 
 
 		 190 aa  58.2  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.486277  normal  0.417493 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4013  aminoglycoside phosphotransferase  28.23 
 
 		 272 aa  54.7  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163543  hitchhiker  0.00393524 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1615  aminoglycoside phosphotransferase  35.12 
 
 		 219 aa  55.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2246  hypothetical protein  33.77 
 
 		 346 aa  48.1  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>