18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5522 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5522  hypothetical protein  100 
 
 		 345 aa  724    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3077  hypothetical protein  51.9 
 
 		 344 aa  358  7e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.257575  normal  0.207932 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1501  hypothetical protein  28.05 
 
 		 329 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.627335  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1524  hypothetical protein  28.05 
 
 		 329 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1501  hypothetical protein  28.05 
 
 		 329 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2557  aminoglycoside phosphotransferase  30.14 
 
 		 667 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.898182  normal  0.739218 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2512  aminoglycoside phosphotransferase  30.14 
 
 		 667 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2549  hypothetical protein  30.14 
 
 		 667 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.616235 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3374  aminoglycoside phosphotransferase  25.82 
 
 		 661 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116531 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3155  hypothetical protein  25.82 
 
 		 678 aa  63.2  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.736727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4025  putative 6-phosphofructokinase  28.36 
 
 		 327 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.789271 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1583  hypothetical protein  26.05 
 
 		 379 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1529  hypothetical protein  26.05 
 
 		 379 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178306  normal  0.470241 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1559  hypothetical protein  26.05 
 
 		 379 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.970471  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13190  hypothetical protein  22.98 
 
 		 374 aa  46.2  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.269746 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4498  hypothetical protein  22.18 
 
 		 371 aa  42.7  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3874  hypothetical protein  22.03 
 
 		 380 aa  42.7  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.104897  normal  0.0811727 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1868  hypothetical protein  24.23 
 
 		 371 aa  42.7  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139738  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>