19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1559 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1559  hypothetical protein  100 
 
 
379 aa  767    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.970471  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1583  hypothetical protein  100 
 
 
379 aa  767    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1868  hypothetical protein  82.63 
 
 
371 aa  647    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139738  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1529  hypothetical protein  98.94 
 
 
379 aa  761    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178306  normal  0.470241 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4498  hypothetical protein  81.84 
 
 
371 aa  638    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13190  hypothetical protein  79.74 
 
 
374 aa  628  1e-179  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.269746 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4605  hypothetical protein  75.33 
 
 
381 aa  603  1.0000000000000001e-171  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.360002  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3635  hypothetical protein  69.39 
 
 
373 aa  553  1e-156  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1820  hypothetical protein  60.05 
 
 
371 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.153192 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7978  hypothetical protein  41.25 
 
 
376 aa  280  2e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.369377  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3975  hypothetical protein  42.28 
 
 
361 aa  268  1e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2500  hypothetical protein  31.23 
 
 
369 aa  189  5.999999999999999e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000111187 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4406  hypothetical protein  33.68 
 
 
367 aa  162  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2219  hypothetical protein  31.94 
 
 
363 aa  152  5.9999999999999996e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2245  hypothetical protein  30 
 
 
363 aa  147  3e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0285  hypothetical protein  28.64 
 
 
377 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0819327  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2009  hypothetical protein  26.39 
 
 
377 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0128163  normal  0.280016 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3398  hypothetical protein  27.57 
 
 
371 aa  70.1  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.362896  normal  0.482648 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5522  hypothetical protein  26.05 
 
 
345 aa  48.1  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>