286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0212 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0212  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
247 aa  491  9.999999999999999e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0697  beta-lactamase domain-containing protein  75.1 
 
 
246 aa  385  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0317435 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0531  beta-lactamase-like protein  70.37 
 
 
242 aa  343  2e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.235067  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0543  beta-lactamase domain-containing protein  70.37 
 
 
242 aa  343  2e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.276827  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0521  beta-lactamase domain-containing protein  70.37 
 
 
242 aa  343  2e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.926076  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10411  beta lactamase like protein  56.68 
 
 
272 aa  287  1e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0249  beta-lactamase domain protein  44.16 
 
 
248 aa  190  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0215  beta-lactamase domain protein  42.04 
 
 
252 aa  179  4.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1277  beta-lactamase domain protein  43.36 
 
 
242 aa  169  3e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4384  beta-lactamase domain protein  37.97 
 
 
258 aa  159  4e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0493064 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3735  beta-lactamase domain protein  32.65 
 
 
246 aa  112  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.555348  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19030  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  31.85 
 
 
278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.936146  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1024  beta-lactamase domain protein  32.92 
 
 
256 aa  107  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2710  beta-lactamase domain protein  30.97 
 
 
237 aa  98.2  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1391  beta-lactamase domain-containing protein  26.64 
 
 
244 aa  74.7  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.354164  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0673  beta-lactamase-like  28.64 
 
 
232 aa  74.3  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2167  beta-lactamase domain protein  29.57 
 
 
245 aa  72.4  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0330732  normal  0.0181786 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0619  beta-lactamase domain-containing protein  30.88 
 
 
273 aa  72.4  0.000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1919  beta-lactamase domain protein  29.51 
 
 
243 aa  71.2  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000566164  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1675  beta-lactamase domain protein  26.89 
 
 
242 aa  70.9  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0035  beta-lactamase domain protein  24.89 
 
 
210 aa  70.1  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2505  putative hydrolase  26.48 
 
 
217 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.341858  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08650  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  30.7 
 
 
346 aa  67.4  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.637388  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5069  beta-lactamase domain protein  31.96 
 
 
214 aa  67  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.137937  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1152  beta-lactamase domain-containing protein  29.74 
 
 
321 aa  66.6  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  hitchhiker  0.0056375 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2563  beta-lactamase domain protein  27.38 
 
 
282 aa  66.2  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2879  beta-lactamase domain protein  31.51 
 
 
216 aa  65.1  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.191235  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2493  beta-lactamase-like  29.86 
 
 
232 aa  63.9  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2203  beta-lactamase domain-containing protein  29.95 
 
 
252 aa  63.9  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2241  hydrolase  25.23 
 
 
217 aa  63.5  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282445  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2175  metal-dependent hydrolase  25.23 
 
 
217 aa  63.5  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000879537  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2161  metal-dependent hydrolase  25.23 
 
 
217 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.57885  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2405  hydrolase  25.23 
 
 
217 aa  63.5  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.903974  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2422  putative hydrolase  25.23 
 
 
217 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0769  beta-lactamase domain-containing protein  29.96 
 
 
273 aa  63.2  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.310253 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2396  beta-lactamase domain protein  25.35 
 
 
228 aa  62.8  0.000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2440  hydrolase, putative  24.66 
 
 
217 aa  62  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0911202  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2292  beta-lactamase domain protein  29.52 
 
 
321 aa  60.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0204091  normal  0.304902 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1322  beta-lactamase domain protein  29.05 
 
 
329 aa  59.3  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1085  beta-lactamase domain protein  29.52 
 
 
263 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2372  putative hydrolase  24.19 
 
 
217 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15960  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  29.81 
 
 
269 aa  58.9  0.00000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.612617  hitchhiker  0.00000215477 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2708  beta-lactamase domain protein  28.88 
 
 
325 aa  57.8  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0967231  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1439  beta-lactamase domain protein  26.62 
 
 
329 aa  58.5  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000967067  normal  0.166741 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2427  beta-lactamase domain-containing protein  31.08 
 
 
300 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.501309  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1007  beta-lactamase domain-containing protein  40.82 
 
 
278 aa  57.4  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5818  beta-lactamase domain protein  26.7 
 
 
294 aa  57  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0022  beta-lactamase domain protein  26.29 
 
 
213 aa  57  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.887133  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2424  beta-lactamase domain protein  30.18 
 
 
322 aa  56.6  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.238173  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2960  putative hydrolase  22.33 
 
 
217 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0047526 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2561  beta-lactamase domain protein  27.35 
 
 
275 aa  56.2  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000265837  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0619  beta-lactamase domain protein  27.23 
 
 
240 aa  55.8  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2500  beta-lactamase-like  29.17 
 
 
308 aa  55.8  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.763303  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5606  beta-lactamase domain protein  29.12 
 
 
221 aa  55.8  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3547  hypothetical protein  28.16 
 
 
255 aa  55.5  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152924  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3993  beta-lactamase domain-containing protein  29.74 
 
 
321 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000582662 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0161  beta-lactamase domain-containing protein  40.86 
 
 
269 aa  55.1  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4113  beta-lactamase domain protein  27.41 
 
 
355 aa  54.7  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.011437  normal  0.053603 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1287  beta-lactamase domain-containing protein  30.04 
 
 
226 aa  53.9  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0372729  normal  0.0146108 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2218  beta-lactamase domain-containing protein  22.61 
 
 
217 aa  54.3  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.250629  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1399  beta-lactamase domain protein  28.69 
 
 
230 aa  53.9  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.290066 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2978  beta-lactamase domain-containing protein  26.79 
 
 
298 aa  53.5  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0019  beta-lactamase domain-containing protein  29.44 
 
 
207 aa  53.9  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.751358  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5146  metallo-beta-lactamase family protein  25.32 
 
 
240 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3066  beta-lactamase-like  28.7 
 
 
363 aa  52.8  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.193945  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1047  beta-lactamase domain-containing protein  28.81 
 
 
295 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0508  beta-lactamase domain protein  30.16 
 
 
295 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4874  metallo-beta-lactamase family protein  24.9 
 
 
240 aa  52.8  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5245  metallo-beta-lactamase family protein  24.9 
 
 
240 aa  52.8  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5582  beta-lactamase domain protein  28.63 
 
 
322 aa  52.4  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1078  beta-lactamase domain protein  27.56 
 
 
402 aa  52.4  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.123154  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2888  beta-lactamase domain-containing protein  29.72 
 
 
368 aa  52.4  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2405  beta-lactamase-like  26.94 
 
 
237 aa  52.4  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703115  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0513  beta-lactamase domain-containing protein  28.08 
 
 
228 aa  52.4  0.000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000126924  hitchhiker  0.000693595 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4636  beta-lactamase domain protein  29.55 
 
 
299 aa  52  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.218254 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2870  metal-dependent hydrolase  28.33 
 
 
285 aa  52  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.154446  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3118  metallo-beta-lactamase family protein  26.92 
 
 
281 aa  52  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2900  metallo-beta-lactamase family protein  26.92 
 
 
285 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.248774  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2384  beta-lactamase domain protein  27.96 
 
 
230 aa  51.6  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3996  beta-lactamase domain-containing protein  29.06 
 
 
296 aa  51.6  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.590455  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5152  metallo-beta-lactamase family protein  25.68 
 
 
240 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.810942  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4522  beta-lactamase domain protein  30.09 
 
 
299 aa  52  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.231723  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2483  putative Beta-lactamase  40.91 
 
 
290 aa  51.6  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2127  beta-lactamase domain protein  21.5 
 
 
213 aa  50.4  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0013409  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0462  metallo-beta-lactamase family protein  27.01 
 
 
269 aa  50.8  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000870775  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3140  metallo-beta-lactamase family protein  27.08 
 
 
281 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0313805  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0784  beta-lactamase domain protein  29.18 
 
 
354 aa  50.4  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1079  beta-lactamase domain protein  29.14 
 
 
332 aa  50.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0383209  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3562  beta-lactamase domain protein  26.61 
 
 
228 aa  50.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000949082  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3947  beta-lactamase domain protein  24.5 
 
 
246 aa  50.8  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.304771  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3408  Beta-lactamase  25.89 
 
 
288 aa  50.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126776  normal  0.0176052 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1637  beta-lactamase domain-containing protein  25.45 
 
 
207 aa  50.8  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.084203  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1374  beta-lactamase domain-containing protein  29.82 
 
 
192 aa  50.8  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.09884  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1603  beta-lactamase domain-containing protein  25.45 
 
 
207 aa  50.8  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0599073  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4154  beta-lactamase domain-containing protein  30.09 
 
 
299 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.336345 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0821  beta-lactamase domain protein  26.51 
 
 
324 aa  50.4  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3882  Zn-dependent hydrolase  27.71 
 
 
317 aa  50.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4731  metallo-beta-lactamase family protein  25 
 
 
240 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0664  metal dependent hydrolase  32.74 
 
 
238 aa  49.7  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0424  beta-lactamase domain protein  27.78 
 
 
223 aa  50.1  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.65466  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>