252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_2492 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_2492  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 
310 aa  622  1e-177  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.248024  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0077  rod shape-determining protein MreC  45.42 
 
 
324 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0115  rod shape-determining protein MreC  44.04 
 
 
311 aa  241  7.999999999999999e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0052  rod shape-determining protein MreC  45.86 
 
 
336 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0155006  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0319  rod shape-determining protein MreC  46.29 
 
 
298 aa  226  4e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0325  rod shape-determining protein MreC  45.11 
 
 
369 aa  225  6e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4399  rod shape-determining protein MreC  45.11 
 
 
369 aa  224  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0691605  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0051  rod shape-determining protein MreC  43.57 
 
 
367 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0237  rod shape-determining protein MreC  44.57 
 
 
292 aa  216  5e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2373  rod shape-determining protein MreC  42.48 
 
 
357 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.729262  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0161  rod shape-determining protein MreC  42.48 
 
 
357 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.749008  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0365  rod shape-determining protein MreC  42.48 
 
 
357 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0180  rod shape-determining protein MreC  42.48 
 
 
357 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.841992  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0169  rod shape-determining protein MreC  42.48 
 
 
357 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2786  rod shape-determining protein MreC  42.48 
 
 
357 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2293  rod shape-determining protein MreC  42.48 
 
 
357 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0145  rod shape-determining protein MreC  42.25 
 
 
359 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.811267  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0284  rod shape-determining protein MreC  41.42 
 
 
326 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6462  rod shape-determining protein MreC  41.73 
 
 
355 aa  207  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3366  rod shape-determining protein MreC  43.23 
 
 
348 aa  206  3e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3689  rod shape-determining protein MreC  43.23 
 
 
348 aa  206  5e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3108  rod shape-determining protein MreC  41.43 
 
 
367 aa  206  5e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.988939  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3127  rod shape-determining protein MreC  40.98 
 
 
358 aa  203  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2497  rod shape-determining protein MreC  40.98 
 
 
358 aa  203  3e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.401568  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3111  rod shape-determining protein MreC  40.98 
 
 
358 aa  203  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417593  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3922  rod shape-determining protein MreC  41.25 
 
 
306 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1006  rod shape-determining protein MreC  38.71 
 
 
281 aa  198  1.0000000000000001e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3049  rod shape-determining protein MreC  39.85 
 
 
356 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3166  rod shape-determining protein MreC  39.85 
 
 
356 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0280823  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0223  rod shape-determining protein MreC  36.81 
 
 
307 aa  193  3e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0170  rod shape-determining protein MreC  41.73 
 
 
310 aa  193  3e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0295  rod shape-determining protein MreC  37.72 
 
 
306 aa  191  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0101  rod shape-determining protein MreC  42.26 
 
 
300 aa  190  2e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0468  rod shape-determining protein MreC  36.52 
 
 
309 aa  188  1e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077697  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0404  rod shape-determining protein MreC  39.85 
 
 
293 aa  187  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00230654  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0060  rod shape-determining protein MreC  42.86 
 
 
346 aa  187  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4559  rod shape-determining protein MreC  38.95 
 
 
291 aa  186  3e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  38.49 
 
 
299 aa  186  5e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2022  rod shape-determining protein MreC  35.12 
 
 
311 aa  185  7e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.102546  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0174  rod shape-determining protein MreC  37.69 
 
 
306 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2239  rod shape-determining protein MreC  38.29 
 
 
317 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  38.49 
 
 
296 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0503  rod shape-determining protein MreC  35.67 
 
 
312 aa  183  3e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00353407 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0839  rod shape-determining protein MreC  39.06 
 
 
362 aa  182  7e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.237231  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3676  rod shape-determining protein MreC  36.84 
 
 
414 aa  181  1e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00252425  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0575  rod shape-determining protein MreC  38.35 
 
 
334 aa  179  4e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000194769  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4471  rod shape-determining protein MreC  39.13 
 
 
359 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.712319  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4162  rod shape-determining protein MreC  39.53 
 
 
357 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0355  rod shape-determining protein MreC  35.23 
 
 
356 aa  177  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3333  rod shape-determining protein MreC  39.1 
 
 
294 aa  176  3e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0190345  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1739  rod shape-determining protein MreC  36.1 
 
 
281 aa  176  6e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0240  rod shape-determining protein MreC  34.97 
 
 
305 aa  175  8e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.857372 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12660  rod shape-determining protein MreC  37.11 
 
 
318 aa  174  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0234  rod shape-determining protein MreC  35.44 
 
 
305 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.236094  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0082  rod shape-determining protein MreC  36.52 
 
 
311 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.147193 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0857  rod shape-determining protein MreC  36.21 
 
 
328 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0399  rod shape-determining protein MreC  36.47 
 
 
331 aa  172  6.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.216027  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0466  rod shape-determining protein MreC  36.47 
 
 
331 aa  172  6.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0018954  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1197  rod shape-determining protein MreC  36.47 
 
 
331 aa  172  6.999999999999999e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000315493  hitchhiker  0.00816148 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4401  rod shape-determining protein MreC  40.6 
 
 
298 aa  170  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00873954  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5094  rod shape-determining protein MreC  36.61 
 
 
329 aa  169  5e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2835  rod shape-determining protein MreC  36.98 
 
 
296 aa  169  5e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140817  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58130  rod shape-determining protein MreC  36.76 
 
 
330 aa  169  7e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.317249  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0934  rod shape-determining protein MreC  37.6 
 
 
332 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1609  rod shape-determining protein MreC  37.21 
 
 
311 aa  168  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.72705  normal  0.758946 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0941  rod shape-determining protein MreC  37.75 
 
 
325 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0974  rod shape-determining protein MreC  37.35 
 
 
330 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261547  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3737  rod shape-determining protein MreC  39.85 
 
 
320 aa  166  5e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00218266  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0523  rod shape-determining protein MreC  39.1 
 
 
336 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0013052  normal  0.369074 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3821  rod shape-determining protein MreC  39.1 
 
 
338 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00205381  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0519  rod shape-determining protein MreC  39.1 
 
 
336 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000295389  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0498  rod shape-determining protein MreC  39.1 
 
 
336 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000920661  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0559  rod shape-determining protein MreC  38.35 
 
 
298 aa  162  7e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0551516  normal  0.419374 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0513  rod shape-determining protein MreC  37.17 
 
 
286 aa  162  8.000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1938  rod shape-determining protein MreC  33.84 
 
 
267 aa  160  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000368183  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3191  rod shape-determining protein MreC  39.64 
 
 
254 aa  161  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0011283  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4281  rod shape-determining protein MreC  36.48 
 
 
333 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.535486  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0329  rod shape-determining protein MreC  38.49 
 
 
292 aa  160  3e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.134678  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0184  rod shape-determining protein MreC  35.02 
 
 
286 aa  160  3e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00341566  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00265  rod shape-determining protein MreC  37.08 
 
 
277 aa  159  4e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0246577  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0484  rod shape-determining protein MreC  32.48 
 
 
285 aa  159  8e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0116086  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0264  rod shape-determining protein MreC  37.5 
 
 
327 aa  158  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.032676  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3753  rod shape-determining protein MreC  41.03 
 
 
295 aa  158  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000670381  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3471  rod shape-determining protein MreC  34.75 
 
 
353 aa  156  3e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0021778  normal  0.815632 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0480  rod shape-determining protein MreC  34.75 
 
 
353 aa  157  3e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.589731  normal  0.326651 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0514  rod shape-determining protein MreC  34.96 
 
 
292 aa  156  4e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000273535  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3647  rod shape-determining protein MreC  37.22 
 
 
353 aa  156  4e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0178406  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3834  rod shape-determining protein MreC  36.09 
 
 
383 aa  155  1e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0283563  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1647  rod shape-determining protein MreC  34.59 
 
 
292 aa  154  2e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000765813  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0253  rod shape-determining protein MreC  37.89 
 
 
327 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00109654  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0261  rod shape-determining protein MreC  36.1 
 
 
281 aa  153  4e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4097  rod shape-determining protein MreC  36.47 
 
 
355 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4410  rod shape-determining protein MreC  35.94 
 
 
334 aa  150  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000283267  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1126  rod shape-determining protein MreC  35.71 
 
 
351 aa  150  2e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.16039  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4566  rod shape-determining protein MreC  36.33 
 
 
367 aa  148  9e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000293229  normal  0.735878 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03109  cell wall structural complex MreBCD transmembrane component MreC  36.33 
 
 
367 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0024282  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0457  rod shape-determining protein MreC  36.33 
 
 
367 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000354374  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0457  rod shape-determining protein MreC  36.33 
 
 
367 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00301189  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3733  rod shape-determining protein MreC  36.33 
 
 
367 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011451  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3439  rod shape-determining protein MreC  36.33 
 
 
367 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000626675  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>