More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3129 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3326  major facilitator superfamily MFS_1  89.11 
 
 		 459 aa  739    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3129  major facilitator transporter  100 
 
 		 459 aa  867    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0660329 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3450  major facilitator superfamily MFS_1  98.91 
 
 		 459 aa  857    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.523249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3520  major facilitator transporter  69.35 
 
 		 475 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0923  major facilitator transporter  67.71 
 
 		 459 aa  522  1e-147  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.298675 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1309  major facilitator superfamily MFS_1  66.97 
 
 		 455 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2121  major facilitator transporter  56.44 
 
 		 480 aa  459  9.999999999999999e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000118824  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2398  major facilitator transporter  56.67 
 
 		 457 aa  458  9.999999999999999e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.233467  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01799  predicted transporter  55.31 
 
 		 457 aa  449  1e-125  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.702332  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1814  major facilitator superfamily MFS_1  55.53 
 
 		 457 aa  450  1e-125  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0974065  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1919  major facilitator transporter  55.53 
 
 		 457 aa  450  1e-125  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591664  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2560  transporter, major facilitator family  55.53 
 
 		 457 aa  449  1e-125  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000336159  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01787  hypothetical protein  55.31 
 
 		 457 aa  449  1e-125  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.868049  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1359  major facilitator transporter  55.53 
 
 		 457 aa  449  1e-125  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000544866  normal  0.0171999 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2057  major facilitator transporter  55.53 
 
 		 457 aa  450  1e-125  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276099  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1804  major facilitator transporter  55.53 
 
 		 457 aa  450  1e-125  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.673075  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2096  transporter, major facilitator family  55.53 
 
 		 457 aa  450  1e-125  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000334622  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2300  major facilitator transporter  53.2 
 
 		 455 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2436  major facilitator transporter  53.2 
 
 		 455 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0899  major facilitator transporter  55.66 
 
 		 455 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0142459 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5717  major facilitator transporter  54.24 
 
 		 455 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4770  MFS family transporter  53.38 
 
 		 474 aa  441  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1680  major facilitator transporter  52.67 
 
 		 455 aa  437  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0903  EmrB/QacA family drug resistance transporter  55.58 
 
 		 457 aa  437  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2768  MFS family transporter  53.43 
 
 		 464 aa  436  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.469352 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1779  major facilitator transporter  55.66 
 
 		 455 aa  438  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2391  major facilitator transporter  55.66 
 
 		 455 aa  438  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2655  major facilitator transporter  52.67 
 
 		 455 aa  437  1e-121  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0128885 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1791  major facilitator transporter  52.67 
 
 		 455 aa  437  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.130423  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1267  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  55.4 
 
 		 457 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2396  major facilitator transporter  55.9 
 
 		 455 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.124422 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1107  transport protein YebQ  54.81 
 
 		 457 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1113  EmrB/QacA family drug resistance transporter  55.16 
 
 		 457 aa  431  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.239242  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3036  EmrB/QacA family drug resistance transporter  54.92 
 
 		 457 aa  430  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0968  EmrB/QacA family drug resistance transporter  54.92 
 
 		 457 aa  430  1e-119  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.028238  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3013  EmrB/QacA family drug resistance transporter  54.92 
 
 		 457 aa  430  1e-119  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2164  major facilitator transporter  54.04 
 
 		 476 aa  429  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3373  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  51.56 
 
 		 474 aa  430  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0970246  normal  0.949591 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1559  EmrB/QacA family drug resistance transporter  54.92 
 
 		 457 aa  430  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.3304  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3532  major facilitator superfamily MFS_1  53.25 
 
 		 464 aa  421  1e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0144741  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3647  major facilitator superfamily MFS_1  53.42 
 
 		 445 aa  420  1e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3792  major facilitator transporter  51.81 
 
 		 488 aa  412  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.57884 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2143  major facilitator transporter  51.68 
 
 		 480 aa  410  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172092  hitchhiker  0.000390012 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1140  major facilitator superfamily MFS_1  52.23 
 
 		 485 aa  410  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2203  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  52.5 
 
 		 455 aa  404  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190205  normal  0.434224 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5967  major facilitator superfamily MFS_1  51.82 
 
 		 455 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1280  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.61 
 
 		 459 aa  393  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.086672  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2166  major facilitator transporter  51.36 
 
 		 498 aa  387  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.440197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3984  putative MFS superfamily transport protein  50 
 
 		 473 aa  386  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00527926 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4320  major facilitator transporter  51.01 
 
 		 446 aa  383  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.142601  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3816  major facilitator transporter  51.82 
 
 		 491 aa  385  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.524764  normal  0.933625 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4444  major facilitator transporter  51.25 
 
 		 453 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3923  major facilitator transporter  51.25 
 
 		 453 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3605  major facilitator transporter  51.36 
 
 		 472 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1017  transporter, putative  50.12 
 
 		 459 aa  377  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.525895  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3665  major facilitator transporter  51.01 
 
 		 466 aa  378  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2896  major facilitator superfamily MFS_1  53.36 
 
 		 476 aa  372  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.17584  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0958  putative transporter  50.74 
 
 		 442 aa  373  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3300  major facilitator transporter  51.59 
 
 		 497 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.471538 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4542  major facilitator superfamily transporter  50.86 
 
 		 490 aa  368  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.061139  normal  0.234222 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3366  major facilitator transporter  49.67 
 
 		 474 aa  362  5.0000000000000005e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.209391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2000  major facilitator superfamily MFS_1  48.45 
 
 		 468 aa  362  9e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0919237  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1703  major facilitator superfamily transporter  48.23 
 
 		 468 aa  360  2e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.824746 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3110  major facilitator superfamily MFS_1  47.44 
 
 		 469 aa  357  2.9999999999999997e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1868  major facilitator superfamily transporter  50.58 
 
 		 463 aa  347  2e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4661  major facilitator transporter  53.08 
 
 		 468 aa  345  8e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6200  major facilitator superfamily MFS_1  47.74 
 
 		 481 aa  312  9e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.111664  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04823  putative efflux PUMP antibiotic resistance transmembrane protein  43.21 
 
 		 479 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05653  putative efflux PUMP antibiotic resistance transmembrane protein  43.21 
 
 		 479 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2995  major facilitator transporter  42.19 
 
 		 461 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.35009  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6917  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.52 
 
 		 463 aa  276  7e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2482  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.21 
 
 		 493 aa  223  8e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15461  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.48 
 
 		 475 aa  219  7.999999999999999e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1290  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.71 
 
 		 477 aa  217  4e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.27 
 
 		 474 aa  215  9.999999999999999e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2180  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.98 
 
 		 477 aa  214  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2797  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.48 
 
 		 482 aa  206  6e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1125  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  31.77 
 
 		 462 aa  202  9.999999999999999e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.59 
 
 		 456 aa  201  3e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1448  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.71 
 
 		 482 aa  192  1e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.307254  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1253  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.54 
 
 		 482 aa  191  2e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.35553  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.99 
 
 		 483 aa  190  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3579  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.9 
 
 		 475 aa  186  7e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0493  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.16 
 
 		 478 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2785  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  28.84 
 
 		 500 aa  184  2.0000000000000003e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1916  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.96 
 
 		 478 aa  181  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0782092  hitchhiker  0.00395657 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0366  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.67 
 
 		 461 aa  179  1e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0742092  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.47 
 
 		 483 aa  179  1e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.787219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.46 
 
 		 493 aa  177  4e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.65 
 
 		 465 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00238209  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3306  efflux PumP antibiotic resistance protein  29.97 
 
 		 492 aa  172  9e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.403535  normal  0.0962569 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1318  major facilitator superfamily MFS_1  33.93 
 
 		 474 aa  168  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.15 
 
 		 504 aa  167  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1292  major facilitator transporter  29.26 
 
 		 465 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.674052  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1502  major facilitator family protein  29.26 
 
 		 465 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.34 
 
 		 528 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11276  drug-transport integral membrane protein  31.86 
 
 		 579 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.201451 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2391  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.71 
 
 		 480 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.128985  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.25 
 
 		 509 aa  163  7e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0977  major facilitator transporter  32.75 
 
 		 503 aa  162  8.000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132044 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>