141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2144 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2144  major facilitator transporter  100 
 
 		 400 aa  750    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.436527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2421  major facilitator superfamily MFS_1  98 
 
 		 400 aa  732    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.107516 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2104  major facilitator superfamily MFS_1  86.72 
 
 		 404 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.965781  normal  0.443718 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1427  major facilitator transporter  59.49 
 
 		 445 aa  417  9.999999999999999e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.08987  normal  0.773865 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6132  major facilitator transporter  51.78 
 
 		 403 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6420  major facilitator transporter  53.62 
 
 		 383 aa  338  8e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2673  major facilitator transporter  50.92 
 
 		 403 aa  324  2e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.940968 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5584  major facilitator transporter  53.28 
 
 		 406 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5948  major facilitator transporter  53.28 
 
 		 406 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.291144 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6449  major facilitator transporter  53.28 
 
 		 406 aa  316  6e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0185  major facilitator superfamily MFS_1  53.59 
 
 		 401 aa  313  4.999999999999999e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.73097 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4416  major facilitator transporter  53.2 
 
 		 408 aa  289  6e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0645  major facilitator transporter  25.95 
 
 		 382 aa  63.2  0.000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.080187  normal  0.0394754 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1292  major facilitator transporter  25.45 
 
 		 416 aa  61.6  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0269507 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0566  major facilitator superfamily MFS_1  32.65 
 
 		 428 aa  61.2  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1189  major facilitator superfamily MFS_1  26.63 
 
 		 400 aa  60.8  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.051319  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2437  major facilitator superfamily MFS_1  25.43 
 
 		 396 aa  60.5  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.905943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2104  major facilitator transporter  25.89 
 
 		 391 aa  59.7  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.314279 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0680  major facilitator family transporter  25.97 
 
 		 443 aa  59.7  0.00000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0546  fosmidomycin resistance protein  27.81 
 
 		 406 aa  59.7  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.268965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0600  fosmidomycin resistance protein  27.81 
 
 		 406 aa  59.7  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.184073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3306  major facilitator superfamily MFS_1  29.03 
 
 		 423 aa  59.3  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1497  transporter, MFS superfamily  25.97 
 
 		 443 aa  59.3  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0556  fosmidomycin resistance protein  27.81 
 
 		 406 aa  59.7  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.809506 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0539  fosmidomycin resistance protein  27.81 
 
 		 406 aa  59.7  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0541  fosmidomycin resistance protein  27.22 
 
 		 406 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.404971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1946  major facilitator transporter  27.89 
 
 		 420 aa  58.2  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.086986  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0518  fosmidomycin resistance protein  27.22 
 
 		 406 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0414  fosmidomycin resistance protein  26.63 
 
 		 248 aa  57.8  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3837  major facilitator superfamily MFS_1  25.44 
 
 		 400 aa  57.4  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.791856  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00430  predicted fosmidomycin efflux system  26.63 
 
 		 406 aa  57  0.0000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3131  major facilitator superfamily MFS_1  26.63 
 
 		 406 aa  57  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00435  hypothetical protein  26.63 
 
 		 406 aa  57  0.0000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0556  fosmidomycin resistance protein  26.63 
 
 		 406 aa  57  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3137  major facilitator transporter  26.63 
 
 		 406 aa  57  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.546423  hitchhiker  0.000000426482 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0571  fosmidomycin resistance protein  26.63 
 
 		 406 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.652835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0523  fosmidomycin resistance protein  26.63 
 
 		 406 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2568  major facilitator superfamily MFS_1  31.56 
 
 		 427 aa  56.2  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4326  major facilitator superfamily MFS_1  26.02 
 
 		 393 aa  56.2  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0958  major facilitator transporter  25.6 
 
 		 406 aa  55.8  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3928  major facilitator superfamily MFS_1  27.19 
 
 		 420 aa  55.1  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1968  major facilitator transporter  25.94 
 
 		 410 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.620228  normal  0.0550042 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4835  major facilitator transporter  28.77 
 
 		 403 aa  53.5  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0156  major facilitator superfamily MFS_1  26.45 
 
 		 408 aa  53.5  0.000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1519  major facilitator transporter  24.67 
 
 		 404 aa  53.1  0.000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.120358  normal  0.496216 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1478  major facilitator superfamily MFS_1  29.4 
 
 		 402 aa  53.1  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4112  major facilitator transporter  23.49 
 
 		 397 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0806371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5829  major facilitator transporter  30.34 
 
 		 422 aa  51.6  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.50804  normal  0.878008 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2392  major facilitator transporter  30.1 
 
 		 450 aa  52  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3770  major facilitator superfamily MFS_1  23.59 
 
 		 418 aa  51.6  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0419  major facilitator transporter  28.9 
 
 		 396 aa  51.6  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.42011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3329  major facilitator transporter  24.81 
 
 		 410 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.875992  normal  0.707628 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1260  fosmidomycin resistance protein  25.7 
 
 		 404 aa  50.4  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0237353  hitchhiker  0.0000222003 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2972  major facilitator transporter  24.25 
 
 		 422 aa  50.1  0.00006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5234  major facilitator transporter  28.48 
 
 		 430 aa  50.4  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6505  major facilitator superfamily MFS_1  26.03 
 
 		 400 aa  50.1  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  26.87 
 
 		 436 aa  50.1  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  27.59 
 
 		 443 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2630  fosmidomycin resistance protein  26.59 
 
 		 420 aa  49.7  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6092  major facilitator superfamily MFS_1  26.03 
 
 		 400 aa  49.7  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0102  major facilitator superfamily MFS_1  28.09 
 
 		 382 aa  50.1  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.346364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3033  fosmidomycin resistance protein  25.7 
 
 		 404 aa  50.1  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00068897  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2366  antibiotic MFS transporter, putative  26.35 
 
 		 420 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.89438  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0930  fosmidomycin resistance protein  26.59 
 
 		 416 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1849  fosmidomycin resistance protein  26.59 
 
 		 417 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4588  major facilitator transporter  26.19 
 
 		 412 aa  49.3  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1463  fosmidomycin resistance protein  26.59 
 
 		 416 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0419  fosmidomycin resistance protein  26.59 
 
 		 416 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.423949  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1672  fosmidomycin resistance protein  26.59 
 
 		 417 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1694  fosmidomycin resistance protein  26.59 
 
 		 417 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.511968  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0744  fosmidomycin resistance protein  26.59 
 
 		 416 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.944019  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2676  major facilitator transporter  24.54 
 
 		 396 aa  49.3  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.149282  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3400  major facilitator transporter  28.48 
 
 		 430 aa  49.7  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1982  major facilitator superfamily MFS_1  27.43 
 
 		 434 aa  48.5  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.130406  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2718  major facilitator transporter  28.06 
 
 		 430 aa  48.5  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3973  major facilitator superfamily MFS_1  25.42 
 
 		 449 aa  48.5  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1326  major facilitator transporter  26.79 
 
 		 412 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686197  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1365  major facilitator transporter  26.79 
 
 		 412 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.399503 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1857  major facilitator superfamily MFS_1  27.98 
 
 		 408 aa  48.5  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0541564  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2904  major facilitator transporter  26.9 
 
 		 413 aa  47.8  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.690501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3531  major facilitator superfamily MFS_1  31.21 
 
 		 399 aa  47.8  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2522  major facilitator superfamily MFS_1  25.85 
 
 		 440 aa  47.8  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.636456  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3577  hypothetical protein  26.42 
 
 		 421 aa  47.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.972735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1146  major facilitator transporter  24.4 
 
 		 406 aa  47.8  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155488  unclonable  0.000000029988 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4025  major facilitator superfamily fosmidomycin resistant protein  26.24 
 
 		 401 aa  47.4  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.164373  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2943  major facilitator transporter  28.16 
 
 		 418 aa  47.4  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0431  major facilitator transporter  27.03 
 
 		 440 aa  47.4  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000529382  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0735  major facilitator transporter  26.28 
 
 		 404 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5675  major facilitator transporter  26.73 
 
 		 429 aa  47  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0701  MFS efflux transporter, putative  26.2 
 
 		 404 aa  47  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1681  major facilitator transporter  25.72 
 
 		 402 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0962  major facilitator transporter  25.6 
 
 		 412 aa  46.6  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1444  major facilitator transporter  25.6 
 
 		 412 aa  46.6  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0474  major facilitator transporter  24.82 
 
 		 398 aa  46.6  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.812694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1871  major facilitator transporter  25.6 
 
 		 413 aa  46.6  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.565485  hitchhiker  0.00660368 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5166  major facilitator transporter  27.05 
 
 		 429 aa  46.6  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.733081 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1422  major facilitator transporter  25.6 
 
 		 412 aa  46.6  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2794  major facilitator superfamily MFS_1  25.23 
 
 		 419 aa  46.6  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.572754  normal  0.513078 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0412  putative fosmidomycin resistance antibiotic resistance transmembrane protein  25.6 
 
 		 411 aa  46.2  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.22156  normal  0.519743 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1115  major facilitator transporter  24.81 
 
 		 415 aa  46.2  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>