More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0502 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0502  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 201 aa  391  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1262  Phosphoglycerate mutase  84.8 
 
 		 204 aa  331  5e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00931821 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1313  phosphoglycerate mutase  66.5 
 
 		 200 aa  239  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.25121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0188  Phosphoglycerate mutase  52.31 
 
 		 261 aa  238  5.999999999999999e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.677515  normal  0.721859 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0242  phosphoglycerate mutase  52.31 
 
 		 261 aa  229  2e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.273686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2115  phosphoglycerate mutase  47.52 
 
 		 199 aa  150  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0120196 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1087  Phosphoglycerate mutase  46.53 
 
 		 199 aa  143  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2693  phosphoglycerate mutase  39.8 
 
 		 206 aa  140  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3882  phosphoglycerate mutase  40.61 
 
 		 198 aa  135  5e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3400  phosphoglycerate mutase  35 
 
 		 223 aa  113  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1169  phosphoglycerate mutase  37.31 
 
 		 224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1694  Phosphoglycerate mutase  36.08 
 
 		 230 aa  111  8.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0238  phosphoglycerate mutase  37.06 
 
 		 204 aa  108  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.688849  normal  0.278174 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2776  Phosphoglycerate mutase  41.94 
 
 		 242 aa  108  6e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787137  hitchhiker  0.0000492352 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  34.34 
 
 		 241 aa  105  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5934  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  38.24 
 
 		 235 aa  103  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0331503 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1936  phosphoglycerate mutase  38.22 
 
 		 233 aa  104  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0170489  normal  0.370052 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  34.34 
 
 		 245 aa  102  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20000  fructose-2,6-bisphosphatase  38.59 
 
 		 234 aa  102  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.764392  hitchhiker  0.00117347 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0260  Phosphoglycerate mutase  36.41 
 
 		 207 aa  101  7e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.13197  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2439  Phosphoglycerate mutase  38.14 
 
 		 261 aa  99.4  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.777666  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3482  phosphoglycerate mutase  36 
 
 		 234 aa  98.6  6e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00747944  normal  0.39412 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0112  Phosphoglycerate mutase  36.1 
 
 		 234 aa  98.2  7e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2663  Phosphoglycerate mutase  36.63 
 
 		 233 aa  96.7  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.610509  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3521  Phosphoglycerate mutase  36.79 
 
 		 228 aa  93.6  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1837  putative phosphatase  38.04 
 
 		 233 aa  92.4  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0923568  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2625  phosphoglycerate mutase  34.15 
 
 		 242 aa  92  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2283  Phosphoglycerate mutase  36.17 
 
 		 245 aa  91.7  7e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000456651  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2137  Phosphoglycerate mutase  32.66 
 
 		 221 aa  91.7  8e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3044  phosphoglycerate mutase  36.5 
 
 		 230 aa  91.3  8e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16010  fructose-2,6-bisphosphatase  35.68 
 
 		 235 aa  90.9  1e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3157  phosphoglycerate mutase  36.82 
 
 		 238 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2761  Phosphoglycerate mutase  33.98 
 
 		 273 aa  90.9  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3219  phosphoglycerate mutase  36.82 
 
 		 238 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.649085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3169  phosphoglycerate mutase  36.82 
 
 		 238 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.594827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12165  hypothetical protein  35.68 
 
 		 236 aa  89.7  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4894  phosphoglycerate mutase  37.11 
 
 		 274 aa  89.4  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0936935  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2645  phosphoglycerate mutase  36.15 
 
 		 275 aa  88.6  6e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.13165  normal  0.0421048 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  31.16 
 
 		 207 aa  87.4  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1955  phosphoglycerate mutase  35.79 
 
 		 230 aa  86.3  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00415213  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2101  Phosphoglycerate mutase  34.95 
 
 		 230 aa  85.9  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000423123 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5403  Phosphoglycerate mutase  34.78 
 
 		 236 aa  83.2  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.11537 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  37 
 
 		 369 aa  81.3  0.000000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1833  Phosphoglycerate mutase  34.12 
 
 		 245 aa  79.3  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.143224 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  30.81 
 
 		 209 aa  78.6  0.00000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  38.38 
 
 		 401 aa  77.8  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  37.44 
 
 		 440 aa  76.6  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  32.61 
 
 		 412 aa  76.3  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14960  fructose-2,6-bisphosphatase  32.34 
 
 		 243 aa  75.9  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.430385 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  34.17 
 
 		 411 aa  75.9  0.0000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  35.2 
 
 		 383 aa  75.9  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  26.06 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  36.1 
 
 		 412 aa  75.1  0.0000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3353  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.83 
 
 		 365 aa  75.1  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0571  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  39.61 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.149991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.83 
 
 		 365 aa  75.1  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.83 
 
 		 365 aa  75.1  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.262281 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  37.1 
 
 		 214 aa  73.6  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  37.76 
 
 		 391 aa  72.8  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  31.44 
 
 		 213 aa  71.6  0.000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26340  fructose-2,6-bisphosphatase  32.68 
 
 		 235 aa  70.9  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.369087  normal  0.06131 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0241  phosphoglycerate mutase  35.58 
 
 		 194 aa  71.2  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  36.59 
 
 		 356 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2319  phosphoglycerate mutase  34.33 
 
 		 238 aa  70.1  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235645 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2789  Phosphoglycerate mutase  30.85 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0603  hypothetical protein  40.91 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  31.98 
 
 		 402 aa  69.7  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  31.46 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3312  Phosphoglycerate mutase  30.85 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176703  normal  0.738547 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3094  Phosphoglycerate mutase  34.34 
 
 		 218 aa  68.9  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0314512  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3334  Phosphoglycerate mutase  36.99 
 
 		 366 aa  68.9  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.415559 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  27.32 
 
 		 188 aa  68.6  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3483  Phosphoglycerate mutase  35.2 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.75677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  34.18 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  34.18 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2256  phosphoglycerate mutase  39.61 
 
 		 192 aa  67.4  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00135316  normal  0.584402 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  27.86 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4654  Phosphoglycerate mutase  32.43 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000940837 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  30.88 
 
 		 214 aa  67  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0358  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  32.54 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.125683  normal  0.913627 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2165  phosphoglycerate mutase  35.75 
 
 		 235 aa  65.9  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00557331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  32.31 
 
 		 229 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  32.14 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  32.31 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  32.31 
 
 		 220 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3311  Phosphoglycerate mutase  30.69 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.16526  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2710  Phosphoglycerate mutase  34.46 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.266877  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  39.1 
 
 		 378 aa  65.1  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  31.63 
 
 		 220 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2790  Phosphoglycerate mutase  30.69 
 
 		 215 aa  65.1  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2646  Phosphoglycerate mutase  34.59 
 
 		 214 aa  65.1  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.451935 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  31.66 
 
 		 209 aa  64.7  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01160  fructose-2,6-bisphosphatase  37.5 
 
 		 224 aa  64.7  0.0000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0209  phosphoglycerate mutase  33.79 
 
 		 218 aa  64.7  0.0000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  33.54 
 
 		 202 aa  64.7  0.0000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0729  phosphoglycerate mutase  31.46 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000243184 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3137  alpha-ribazole phosphatase  31.49 
 
 		 197 aa  64.3  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000105722  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3077  phosphoglycerate mutase  34.03 
 
 		 196 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  30 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>