More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0534 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009635  Maeo_0979  helicase domain-containing protein  58.97 
 
 		 706 aa  833    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0544879  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0371  DNA repair helicase RAD3  82.96 
 
 		 669 aa  1172    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1453  helicase c2  84.16 
 
 		 669 aa  1184    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0534  helicase c2  100 
 
 		 669 aa  1377    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0466  helicase c2  84.3 
 
 		 669 aa  1183    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2196  helicase c2  27.15 
 
 		 641 aa  143  9e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1197  helicase c2  24.43 
 
 		 661 aa  142  1.9999999999999998e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000973223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3747  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  24.21 
 
 		 934 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.739451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1598  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  24.06 
 
 		 934 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00523268  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2455  helicase c2  26.79 
 
 		 641 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1347  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  25.5 
 
 		 957 aa  131  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.579486 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1671  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  24.05 
 
 		 934 aa  131  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.697043  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1709  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  24.05 
 
 		 934 aa  130  6e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000649538  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1467  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  24.44 
 
 		 934 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533097  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1425  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  24.82 
 
 		 934 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.446116  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0997  helicase c2  24.35 
 
 		 643 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.179863 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0188  helicase c2  26.74 
 
 		 659 aa  129  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00148037  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1452  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  24.16 
 
 		 934 aa  128  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1424  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  24.82 
 
 		 934 aa  128  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1565  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  24.16 
 
 		 934 aa  128  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.554006  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1636  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  24.82 
 
 		 934 aa  128  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00174148 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1859  helicase c2  25.23 
 
 		 674 aa  127  9e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.347581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3224  DNA polymerase III, epsilon subunit  23.53 
 
 		 927 aa  127  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00101103  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1265  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  22.97 
 
 		 929 aa  125  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00466144  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0023  Rad3-related DNA helicases  24.75 
 
 		 851 aa  125  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000466591  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1805  helicase c2  25.08 
 
 		 659 aa  125  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0897  helicase c2  24.36 
 
 		 647 aa  125  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1619  helicase c2  24.66 
 
 		 629 aa  125  3e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2172  helicase c2  25.46 
 
 		 659 aa  124  6e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2081  ATP-dependent helicase DinG  25.27 
 
 		 633 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1003  DNA polymerase III, epsilon subunit  24.35 
 
 		 960 aa  123  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0709  helicase c2  24.74 
 
 		 650 aa  122  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.968194 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1235  helicase c2  23.17 
 
 		 743 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895293  normal  0.149585 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0411  helicase c2  23.32 
 
 		 646 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0820  helicase c2  24.17 
 
 		 650 aa  121  4.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.932295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2097  helicase c2  25.69 
 
 		 644 aa  120  9e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0479006  normal  0.269462 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2809  helicase c2  24.5 
 
 		 707 aa  118  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4634  helicase c2  24.71 
 
 		 674 aa  118  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3029  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  23.68 
 
 		 929 aa  117  6e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2094  helicase c2  21.78 
 
 		 673 aa  117  7.999999999999999e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.239782  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1626  ATP-dependent DNA helicase-related protein  22.48 
 
 		 713 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1593  helicase c2  22.44 
 
 		 725 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.601772  normal  0.0255754 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0733  ATP-dependent DNA helicase  24.54 
 
 		 640 aa  113  1.0000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.982369  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1412  helicase c2  23.67 
 
 		 658 aa  110  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102914  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3770  helicase c2  24.19 
 
 		 830 aa  108  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3621  helicase c2  23.35 
 
 		 838 aa  107  8e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1629  ATP-dependent DNA helicase DinG  24.16 
 
 		 690 aa  106  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117477  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2725  ATP-dependent DNA helicase DinG  24.16 
 
 		 690 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0300555  hitchhiker  0.000425027 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1106  helicase c2  24.73 
 
 		 636 aa  105  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.243566 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1618  ATP-dependent DNA helicase DinG  24.16 
 
 		 690 aa  105  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.326155  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3854  helicase c2  24.19 
 
 		 830 aa  105  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000920192 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1652  ATP-dependent DNA helicase DinG  24.16 
 
 		 690 aa  105  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.303868 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1828  helicase c2  22.78 
 
 		 688 aa  105  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.147958  normal  0.434412 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3486  helicase c2  22.82 
 
 		 698 aa  104  6e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1897  hypothetical protein  24.77 
 
 		 652 aa  103  9e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1900  helicase c2  22.63 
 
 		 688 aa  103  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2429  ATP-dependent DNA helicase DinG  22.76 
 
 		 691 aa  102  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2178  ATP-dependent DNA helicase DinG  25.88 
 
 		 686 aa  101  4e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.647766 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2524  helicase c2  22.46 
 
 		 755 aa  101  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00188741  decreased coverage  0.000000000263353 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1513  ATP-dependent DNA helicase DinG  24.06 
 
 		 690 aa  100  8e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.433839  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1612  putative ATP-dependent helicase  22 
 
 		 751 aa  99  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00100383  normal  0.548735 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01131  ATP-dependent helicase  23.14 
 
 		 639 aa  98.2  5e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.625206  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0363  ATP-dependent helicase DinG  22.95 
 
 		 840 aa  97.4  6e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.01237  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0995  helicase c2  23.35 
 
 		 681 aa  97.4  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.900844  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1942  helicase c2  23.75 
 
 		 832 aa  97.1  9e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.357662  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0528  helicase c2  25.63 
 
 		 667 aa  97.1  1e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1403  helicase c2  21.67 
 
 		 757 aa  96.3  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.127709  hitchhiker  0.000000348035 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1269  helicase c2  22.37 
 
 		 636 aa  93.6  9e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1779  helicase c2:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  22.17 
 
 		 641 aa  93.2  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29270  DNA helicase, Rad3  23.3 
 
 		 684 aa  92.4  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.318454 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0323  helicase c2  22.59 
 
 		 699 aa  91.7  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000323796 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1446  ATP-dependent DNA helicase DinG  23.88 
 
 		 703 aa  91.3  5e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107544  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2535  helicase C2  28.67 
 
 		 645 aa  89.7  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801549  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2806  DEAD_2 domain protein  21.53 
 
 		 785 aa  88.6  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717048  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1899  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.31 
 
 		 956 aa  88.2  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0589249 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3086  ATP-dependent DNA helicase DinG  29.31 
 
 		 692 aa  87.8  6e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.175143  hitchhiker  0.0000411022 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1545  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.36 
 
 		 944 aa  87.4  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.676592  decreased coverage  0.000191845 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23060  DNA helicase, Rad3  22.35 
 
 		 692 aa  86.7  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0774743 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1409  helicase c2  29.23 
 
 		 651 aa  85.1  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1566  ATP-dependent DNA helicase DinG  29.17 
 
 		 692 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000620367 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1812  DEAD_2 domain-containing protein  21.81 
 
 		 617 aa  85.1  0.000000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0429091  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2470  ATP-dependent DNA helicase DinG  27.44 
 
 		 690 aa  85.1  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127477 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1934  helicase c2  30.19 
 
 		 640 aa  84.7  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.101214  normal  0.540234 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2483  ATP-dependent DNA helicase DinG  27.43 
 
 		 690 aa  84.7  0.000000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204554 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1289  ATP-dependent DNA helicase DinG  22.92 
 
 		 725 aa  84.7  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.649523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2630  ATP-dependent DNA helicase DinG  27.44 
 
 		 690 aa  84.7  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.920562  hitchhiker  0.00302525 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1940  ATP-dependent helicase DinG  32.2 
 
 		 665 aa  84.3  0.000000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.497186  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1819  ATP-dependent DNA helicase DinG  29.72 
 
 		 690 aa  84.3  0.000000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2413  helicase c2  30.19 
 
 		 669 aa  84.3  0.000000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0561182  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2424  helicase c2  30.19 
 
 		 669 aa  84.3  0.000000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2532  helicase c2  30.19 
 
 		 640 aa  84  0.000000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.139439 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2538  ATP-dependent DNA helicase DinG  29.86 
 
 		 690 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.536241  unclonable  0.0000322681 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1921  helicase c2  25.8 
 
 		 725 aa  83.6  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.782434  normal  0.028244 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1743  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.29 
 
 		 930 aa  82.8  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23026  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5421  DEAD_2 domain protein  21.57 
 
 		 754 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0280  helicase c2  21.97 
 
 		 683 aa  82.8  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0332575 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1461  ATP-dependent DNA helicase DinG  21.88 
 
 		 732 aa  82  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.498771 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1156  helicase c2  32.33 
 
 		 649 aa  82.4  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003963  ATP-dependent helicase DinG/Rad3  21.76 
 
 		 691 aa  82  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0196  DEAD_2 domain protein  31.73 
 
 		 619 aa  82.4  0.00000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>